Слесарев В.И. - Химия. Основы химии живого. 2000 (учебник для вузов)
.pdfнове экспериментальных значений АН и AS для этих процессов по уравнению:
|
AG = |
АН - TAS |
|
|
|
|
||
где АН - ха р а к тер и зу ет п ол н ое изм енение эн ергии си стем ы |
при р, Т — |
|||||||
= co n st и отр аж а ет стр ем л ен и е си стем ы |
к |
м и н и м у м у эн ерги и ; |
TAS - |
|||||
х а р а к тер и зу ет ту часть эн ер ги и , |
к о то р у ю |
нельзя |
п реврати ть в р а боту, |
|||||
и отр аж ает стрем ление си стем ы к м ак си м ум у н еуп орядочен н ости ; |
AG - |
|||||||
х а р а к тер и зу ет ту ч а сть эн ер ги и , |
к о то р у ю |
м ож н о |
п реврати ть в р а боту, |
|||||
и я в л я ется тер м од и н а м и ч еск и м |
кри тер ием |
в о зм о ж н о сти |
са м о п р о и з |
|||||
вол ьн ого п р отека н и я л ю б ы х п р оц ессов при р, Т = |
con st. |
|
|
|||||
Соотношение между |
из- |
_ |
ди |
~ |
_ |
рду |
_ |
|
менениями важнейших |
тер- |
|
|
|
|
|
|
|
модинамических параметров |
--------------------- —--------------------------► |
|||||||
и функций, описывающими |
^ |
TAS |
» щ |
|
|
|||
химические и биохимические |
i |
|
|
|
|
|
|
процессы при р у Т = const, представлено на схеме и в табл. 4.1. Второй закон термодинамики для любых систем формули
руется следующим образом:
В системе при постоянной температуре и давлении са мопроизвольно могут совершаться только такие процес сы, в результате которых энергия Гиббса уменьшается, т. е. AGK0H< AGHa4, или AG < 0.
Таким образом, в соответствии со вторым законом термоди намики самопроизвольно (AGp < 0) протекают все экзотермиче ские реакции (AiTp < 0) при любой температуре, если они сопро вождаются увеличением энтропии (ASp > 0). Эндотермические реакции (Aifp > 0), сопровождающиеся уменьшением энтропии (ASp < 0), не могут протекать самопроизвольно при любой тем пературе, так как в этих случаях AGp > 0.
Биохимические реакции, сопровождающиеся уменьшением энергии Гиббса (AGp < 0), называют экзэргоническими реак-
Q
Исходные Течение вещества, реакции
оциямиу они могут совершаться самопроизвольно. Если в течение экзэргонической реакции энер гия Гиббса только понижается, как показано на рис. 4.1, то та
кая реакция протекает в данных условиях самопроизвольно и не обратимо. Чем больше значение энергии Гиббса биохимической системы в начальном состоянии
Рис. 4.1. Изменение энергии Гиб бса в закры той системе в необ ратимых экзэргонических реакци-
Продукты ях, совершаемых самопроизвольно
реакции (р9Т — const)
8 8
Таблица 4.1
ТЕИУедМАМИК4дГ=смкё)
Взаимосвязь термодинамических величин
H= U+ pV
С истем а сам опрои звольн о стрем ится к
минимуму энергии^ |
^ максимуму энтропии________ |
A G - А Д ~ |
TAS — Gкон ~ Снач |
______Л _____________________________________
Термодинамический критерий самопроизвольности протекания процесса:
Д<7 < 0 - экзэргонические (самопроизвольные) процессы ЛG > О - эндэргонические процессы
AG = 0 - химическое равновесие
ХИМИЧЕСКОЕ РАВНОВЕСИЕ
Кинетический критерий: Термодинамический критерий:
v = v |
ДС = 0 |
n |
а А + ЬВ йГО + /Р |
Исходные |
Равновесный состав смеси |
Продукты |
вещества |
исходных веществ и продуктов реакции |
реакции |
|
A cj = 0; А Я = О AS = О |
|
89
Рис. 4.2. Изменение энергии Гиб бса в закрытой системе в необра тимых эндэргонических реакциях (р, Т = const)
|
|
|
GHa4 по сравнению с ее значени |
|
|
|
ем в конечном состоянии GK0H, |
|
|
|
тем больше химическое сродство |
|
|
|
между реагентами в рассматри |
|
|
|
ваемой системе, т. е. их реакци |
|
|
|
онная способность. |
Исходные |
|
Продукты |
Критерий AGp < 0 свиде |
Течение |
тельствует только о термодина |
||
вещества |
реакции |
реакции |
мической возможности протека- |
ния данного процесса и ничего не говорит о скорости процесса и необходимых условиях для его начала. Например, горение гра фита С + 0 2 -» С02 по законам термодинамики может происхо дить в стандартных условиях, так как AGp = -393,5 кДж/моль. Но графит при 298 К с кислородом не реагирует, а чтобы реак ция пошла, необходимо создать определенные условия (запал, катализатор) для увеличения ее скорости.
Биохимические реакции, сопровождающиеся увеличением энер гии Гиббса (рис. 4.2), называются эндэргоническими (AGp > 0), и они невозможны без внешнего подвода энергии. Для того чтобы подобная реакция происходила, надо постоянно подво дить энергию. Например, процесс фотосинтеза в растениях идет только под воздействием солнечной энергии:
6 С 0 2 + 6 Н 20 h\> С6Н 120 6 + 6 0 2 AGp = + 2 8 7 0 к Д ж /м о л ь
В живых системах эндэргонические реакции происходят за счет их сопряжения с экзэргоническими реакциями.
4.5. ПРИНЦИП ЭНЕРГЕТИЧЕСКОГО СОПРЯЖЕНИЯ БИОХИМИЧЕСКИХ РЕАКЦИЙ
Живая клетка для своего существования нуждается в энер гии. При этом гетеротрофные клетки получают необходимую энергию в основном за счет окисления продуктов питания (разд. 9.3.6), а для прототрофных клеток источником энергии часто является солнечный свет (разд. 9.3.7). Полученная энер гия переводится теми и другими клетками с довольно хорошим КПД « 40 % в химическую энергию за счет синтеза в них аденозинтрифосфорной кислоты (АТФ):
|
О |
О |
; о |
|
|Аде |
II |
II |
ill |
|
-р— о - - р — -ОЧ-Р— < |
||||
|
1 |
1 |
: |
I |
|
1 |
1 |
: |
1 |
|
о н |
о н |
j ОН |
90
Это соединение выполняет функцию аккумулятора энергии, так как при его взаимодействии с водой, т. е. гидролизе, обра зуются аденозиндифосфорная (АДФ) и фосфорная (Ф) кислоты и выделяется энергия. Поэтому АТФ называется макроэргическим соединением, а разрывающаяся при его гидролизе связь Р—О—Р - макроэргической. Макроэргической связью называет ся химическая связь, при разрыве которой в результате реак ции гидролиза выделяется значительная энергия:
АТФ + Н20 |
АДФ + Ф |
AG° = -30,5 |
кДж/моль |
АТФ + 2Н20 |
АМФ + Ф + Ф |
AG® = -61,0 кДж/моль |
Как известно, разрыв любой связи (в том числе и макроэр гической) всегда требует затраты энергии. В случае же гидро лизу АТФ кроме процесса разрыва связи между фосфатными группами, для которого AG > 0 , происходят процессы гидрата ции, изомеризации и нейтрализации продуктов, образующихся при гидролизе. В результате всех этих процессов .суммарное изменение энергии Гиббса имеет отрицательное значение. Сле довательно, макроэргическим является не разрыв связи, а энер гетический результат ее гидролиза.
Аденозинтрифосфат функционирует в клетках как проме жуточный продукт, обеспечивающий организм энергией, необ ходимой для протекания жизненно важных эндэргонических процессов: синтеза метаболитов (химическая работа), сокраще ния мышц (механическая работа), переноса вещества через мем браны против градиента концентрации (активный транспорт) и передачи информации (в частности, для передачи нервных им пульсов).
Для того чтобы в живых системах протекали эндэргонические реакции (AGp > 0 ), необходимо, чтобы они были сопряжены с экзэргоническими реакциями (AGp < 0). Такое сопряжение воз можно, если обе реакции имеют какое-либо общее промежуточ ное соединение и на всех стадиях сопряженных реакций суммар ный процесс характеризуется отрицательным значением измене
ния энергии Гиббса (^AGconp#p < 0)- Например, синтез сахарозы является эндэргонической реакцией и самопроизвольно проис
ходить не может: |
|
Глюкоза + Фруктоза —► Сахароза + Н20 |
AG° = +20,9 кДж/моль |
Однако сопряжение этой реакции с экзэргонической реакцией гидролиза АТФ, сопровождающееся образованием общего про межуточного соединения глюкозо-1 -фосфата, приводит к тому,
что суммарный процесс имеет ]^AGp < 0 :
АТФ + Глюкоза + Фруктоза —► Сахароза + АДФ + Ф AGp = -29,2 кДж/моль
91
Наряду с АТФ в живых организмах имеются более эффек тивные макроэргические фосфорилированные соединения, гид ролиз которых сопровождается выделением большей энергии. Так, стандартная энергия Гиббса для гидролиза креатинфосфата, Ъ-фосфоглицерилфосфата и фосфоенолпируеата равна со ответственно -4 3 ,1 ; -4 9 ,4 и -6 1 ,9 кДж/моль. С помощью этих соединений происходит синтез АТФ из АДФ.
Таким образом, внутренним источником энергии в живых системах являются фосфорилированные соединения, при взаи модействии которых с биосубстратами, включая воду, выделя ется энергия. В результате сопряжения этих реакций с други ми (эндэргоническими) обеспечивается протекание в клетке не обходимых эндэргонических процессов.
4.6. ОСОБЕННОСТИ ТЕРМОДИНАМИКИ БИОХИМИЧЕСКИХ ПРОЦЕССОВ В РАВНОВЕСНЫХ
И СТАЦИОНАРНЫХ СОСТОЯНИЯХ. ПОНЯТИЕ О ГОМЕОСТАЗЕ
Главная особенность протекания обратимых биохимических реакций заключается в стремлении достичь динамического рав новесия, так как это состояние возникает и поддерживается вследствие протекания реакций в двух противоположных направ лениях с одинаковыми скоростями v = v . Такое состояние назы вается химическим равновесием, о котором подробно пойдет разговор дальше, а сейчас рассмотрим, как изменяется энергия Гиббса системы, в которой устанавливается химическое равно весие. В этом случае изменение энергии Гиббса в системе ха рактеризуется наличием минимума, который соответствует со стоянию химического равновесия (рис. 4.3, табл. 4.1). К этому равновесному состоянию возможен подход как со стороны ис-
ходных веществ (ДG < 0), так и со стороны продуктов реакции
(AG < 0).
Таким образом, в случае протекания обратимых реакций система самопроизвольно приходит к состоянию хи мического равновесия, из которого она без внешне го воздействия не может выйти, поскольку это тре бует увеличения энергии Гиббса.
Рис. 4.3. Изменение энергии Гиббса в закрытой системе в обратимой химической ре
вещества смеси исходных веществ реакции акции (р, Т = const)
92
Химическое и биохимическое равновесное состояние сис темы характеризуется:
1) равенством скоростей прямой и обратной реакций (о *= v);
&
2) энергетической выгодностью (G = m in);
3) отсутствием изменений величин параметров и функций
&
состояния системы: концентрации реагентов ( Act = 0 ), энталь-
^ ^ &
пии ( АН = О), энтропии ( AS = О) и энергии Гиббса ( AG = О).
Поскольку в состоянии химического равновесия система достигает минимально возможного значения энергии Гиббса, то реакция, которая приводит в данных условиях к состоянию равновесия, всегда протекает самопроизвольно. Благодаря этой особенности обратимых процессов большинство биохимических реакций, протекающих в организме, обратимы.
Другая особенность биохимических процессов, протекающих в организме, заключается в их многостадийности, так как ве роятность обратимого протекания отдельной стадии значитель но выше, чем всего процесса в целом (рис. 4.4). Это объясняет ся тем, что разница между величинами G„ a4 и GKOHдля каждой отдельной стадии обычно невелика (| AGp |< 10 кДж/моль). Об ратимость отдельных стадий биохимических процессов позволя ет живому организму легко регулировать синтез тех или иных соединений в зависимости от потребности и тем самым поддер живать стационарное состояние.
Стационарное состояние для живого организма характери зуется постоянством его термодинамических величин и неиз менностью во времени скоростей поступления и удаления ве ществ и энергии. Несмотря на постоянство термодинамических величин, они не имеют равновесных значений в этом состоянии. Биологическое развитие организма возможно только в системе, находящейся в стационарном состоянии, но далеком от равнове сия. Именно стационарное неравновесное состояние живой ма
терии позволяет ей опти |
' |
|
мизировать свои характе- |
||
ристики |
и эволюциониро |
^нач |
вать во времени. |
||
Термодинамическая осо |
A G 1 |
|
бенность стационарного со |
|
|
стояния |
открытых систем |
A G 1 |
впервые |
сформулирована |
A G-]ш |
И. Р. Пригожиным (1946). |
|
|
Рис. 4.4. Изменение энергии |
|
|
Гиббса в многостадийном био |
|
|
химическом процессе (р, Т = |
|
|
= const) |
|
Течение реакции |
В открытой системе в стационарном состоянии при рост энтропии в единицу времени AS/AT принимает ми нимальное положительное значение для данных условий, /гг. е. AS/AT -> min. ч
Поскольку энтропия является мерой деградации, или рас сеяния энергии, принцип Пригожина приводит к важнейшему заключению: при стационарном состоянии рассеяние энергии Гиббса открытой системой оказывается минимальным.
Термодинамические особенности открытых систем, харак терные для живого организма, объясняют его устойчивость, по зволяющую ему в течение многих лет сохранять определенный уровень работоспособности, а также относительное постоянство внутренней среды, называемое в биологии гомеостазом.
Гомеостаз - относительное динамическое постоянство «состава и свойств внутренней среды организма, обуслав ливающее устойчивость его физиологических функций.
В формировании и поддержании состояния гомеостаза боль шую роль играет обратимость большинства биохимических про цессов. Эти процессы всегда протекают самопроизвольно в на правлении достижения равновесия, но, как правило, в орга низме они его не достигают, а только приводят к достижению необходимого соотношения между конечными и исходными про дуктами реакции, протекающей самопроизвольно при данных условиях. Это происходит или за счет использования продуктов реакции, протекающей самопроизвольно, в других процессах, или за счет изменения условий в данной системе. Так, система, приближающаяся к химическому равновесию, переносится ор ганизмом в другие условия, при которых к состоянию химиче ского равновесия приводит обратная реакция (разд. 5.5.1). На пример, в легких, где концентрация кислорода большая, гемо глобин крови соединяется с кислородом (разд. 10.4), но, не дос тигнув состояния равновесия в насыщении кислородом, кровь переносится из легких к тканям, и там гемоглобин отдает ки слород, поскольку при переходе от легких к тканям в крови из меняются условия для процесса взаимодействия гемоглобина с кислородом. Другой пример: формирование и рост костной тка ни происходит в одних клетках - остеобластах, а ее растворение - в других клетках - остеокластах (разд. 11.3), в то же время ра бота тех и других клеток регулируется организмом, что позволя ет ему поддерживать содержание костной ткани на определен ном уровне.
Таким образом, организм использует в своей жизнедеятель ности обратимые биохимические процессы и их стремление к состоянию химического равновесия, но не допускает наступле ния устойчивого во времени химического равновесия, так как это состояние приведет к гибели организма. В то же время со
94
стояние гомеостаза поддерживается за счет баланса, т. е. необхо димого соотношения между компонентами с противоположными (антагонистическими) свойствами. Так, в основе гомеостаза орга низма находятся следующие химические и физико-химические балансы: кислотно-основный (гл. 8 ), окислительно-восстанови тельный (гл. 9), металло-лигандный (гл. 10), гидрофильно-липо- филънщй (разд. 2 6 . 6 ) водно-электролитный (разд. 7.6). В совре менной литературе понятия "баланс" и "гомеостаз" часто исполь зуются как синонимы.
В заключение отметим основные положения, следующие из законов термодинамики:
-развитие системы происходит под влиянием двух тенден ций - стремления к минимуму энергии и к максимуму энтро пии;
-экзэргонические реакции в организме протекают самопро извольно, так как AGP < 0;
-эндэргонические реакции требуют подвода энергии, так как AGP> 0;
-состояние равновесия в обратимых процессах с позиции
&
термодинамики характеризуется AG = 0 и является энергетиче-
ски самым выгодным, так как G = m in;
- биологические системы в стационарном состоянии харак теризуются AS/Ат —» min. При этом биологические системы ор ганизма далеки от состояния равновесия, что позволяет им оп тимизировать свои характеристики и эволюционировать во вре мени, используя стремления к состоянию равновесия в отдельно взятых своих системах, но избегая наступления равновесия.
Общие законы биохимической термодинамики дают биологу, врачу и экологу ключ к пониманию энергетической стороны биохимических реакций в организме, процессов эмбриогенеза, регенерации и старения тканей, аналогичных процессов, проте кающих в биосфере, а также дают возможность регулировать эти процессы осуществлением профилактических или исправляю щих (лечебных) мероприятий.
ОСНОВЫ КИНЕТИКИ
БИОХИМИЧЕСКИХ РЕАКЦИЙ
И ХИМИЧЕСКОГО РАВНОВЕСИЯ
После изучения этой главы вы должны:
-знать следующие величины, характеризующие химическую реакцию: константа скорости, порядок по реагенту, температурный коэффициент, энергия активации;
-усвоить понятия: катализатор, ингибитор;
-знать особенности протекания различных типов реакций: про стых, сложных, гомогенных, гетерогенных, последовательных, парал лельных, последовательно-параллельных, циклических, цепных, необ ратимых и обратимых, ферментативных, сопряженных, колебательных;
-описание протекания во времени химических и биохимиче ских реакций с помощью кинетических уравнений, ферментативных
реакций - с помощью уравнения Михаэлиса - Ментен;
-описание положения равновесия обратимых реакций посред ством константы химического равновесия и взаимосвязь константы равновесия с изменением энергии Гиббса для этих реакций;
-принцип Ле Шателье для химических равновесий и принцип адаптивных перестроек для живых организмов.
Химические и биохимические реакции - это химическая фор ма движения материи, которая проявляется в превращении одних веществ в другие. Термодинамика предсказывает только возмож ность этих превращений с позиции их энергетики. В то же время необходимо знать, как это происходит и как быстро протекают эти превращения, т. е. механизм и скорость химических реакций. В яшвых системах химические процессы совершаются с различной скоростью. Так, процесс передачи нервного импульса совершается в сотые доли секунды, процессы усвоения пищи требуют несколь ких часов, а процессы старения могут длиться десятилетия.
96
II Раздел химии, изучающий механизмы химических реак-
||ций и скорости их протекания, называется химической
||кинетикой.
Для понимания законов, определяющих протекание химиче ских и биохимических реакций, необходимо рассматривать их с позиций к^к термодинамики, так и химической кинетики. Если термодинамика позволяет узнать, насколько полно осуществится превращение исходных реагентов в продукты реакции, то хими ческая кинетика ответит на вопросы: как быстро совершается химическая реакция и каков ее механизм, т. е. путь реакции? Еще великий Галилей сказал прекрасные слова: ”Кто не знаком с законами движения, тот не может познать природы” .
Сбалансированность скоростей множества химических ре акций позволяет живым системам регулировать метаболизм и поддерживать состояние гомеостаза. Нарушение сбалансирован ности скоростей отдельных процессов вызывает различные па тологические изменения. Методы химической кинетики широ ко используются в биологии, физиологии, фармакологии, ме дицине и экологии.
5.1.ОСНОВНЫЕ ПОНЯТИЯ
ИТЕРМИНОЛОГИЯ РАЗДЕЛА
Химические реакции разделяются на гомогенные и гетеро генные.
Гомогенные реакции характеризуются отсутствием «поверхности раздела между реагентами, поэтому их
взаимодействие протекает по всему объему системы.
При гомогенных реакциях реагирующие вещества находят ся в одном агрегатном состоянии. Например:
а) реакции между газообразными веществами
2 N 0 + 0 2 — |
2 N 0 2 |
б) реакции в растворах
H 2 S 0 4 + 2 К О Н - ► K 2 S 0 4 + 2 Н 20
Гетерогенные реакции характеризуются наличием по «верхности раздела между реагентами, где и протекает
их взаимодействие.
При гетерогенных реакциях реагирующие вещества находят ся в разных агрегатных состояниях. Например:
С а О (т) + С 0 2 (г) - ► С аС О д(т)
Одним из основных параметров химических реакций явля ется скорость, с которой они протекают.
97
4 - 3 4 5 3