Молекулярно-биологические:

Полимеразная цепная реакция (ПЦР). Определяют специфический участок нуклеиновой кислоты для матрицы для многократного увеличения копий (амплификация), чтоб визуально обнаружить копии.

Нужны: ДНК-полимераза или РНК-полимераза и специфический праймер(синтетические олигонуклеотиды, комплементарные фрагменту НК определяемого микроорганизма).

Для ВИЧ-инфекции, вирусных гепатитов, хламидийной инфекции.;

Метагеномные исследования.

Метагеномика –генетический материал (метагеном) сообществ микроорганизмов в совокупности. Цель– получение и анализ всех геномов для установления видового состава и метаболических взаимосвязей в сообществе.

Основано на анализе нуклеотидных последовательностей хромосомных генов, кодирующих 16S p РНК меньшей субъединицы рибосомы, гены не подвергаются изменениям в ходе эволюции - консервативны.

Позволяет определить фенотипическую принадлежность микроорганизмов, основа геносистематики и позволяет определить степень родства. Для изучения микробных сообществ и диагностики.

БИОЛОГИЧЕСКИЙ– обнаружение возбудителя путем заражения лабораторных животных. Для ботулизма, создания экспериментальных моделей инфекционных заболеваний.

Отличие прокариотических клеток от эукариотических.

Различия в строении клеток эукариот и прокариот. 

Признаки	Эукариоты	Прокариоты
Ядро: мембрана хромосомы ядрышко	двойная >1 + +	- 1 - -
Признаки	Эукариоты	Прокариоты
Мембранные структуры: эндоплазматический ретикулум комплекс Гольджи лизосомы митохондрии хлоропласты циклоз жгутики	+ + + + + (у водорослей) + сложной структуры (2´9)+2	- - - - - - простые
Фиксация азота	-	+
Анаэробное дыхание с неорганическими екцкпторами углеводов	-	+
Хемосинтез	-	+

4. Систематика и номенклатура микробов. Домены:

1. Bacteria (царство бактерий)

2. Archaea (царство архебактерий)-нет пептидогликанов в стенке, особые вибосомы, непатогенны, живут при высокой т и давлении.;

3. Vira (царство вирусов);

4. Eucarya (царство простейших и грибов+хромисты).

В основе систематики - филогенетический принцип на генотипических, фенотипических.

Систематика = три части: классификацию, таксономию (порядок) и идентификацию. Основа идентификации -морфологические, физиологические, биохимические, молекулярно-биологические и генотипи- ческие свойства.

Вид – это эволюционно сложившаяся совокупность особей, имеющих экологическое единство, близкий генотип и сходные (в стандартных условиях) морфологические, физиологические, биохимические признаки и антигенную структуру

подвидовые таксоны:

1) варианты (вары) – отличаются по свойствам, но не сильно, чтобы быть отдельный вид: серовары (по антигенам), ферментовары, геновары, эковары и др.;

2) чистая культура – совокупность м/о одного вида или варианта, полученная из одного образца материала и содержащаяся в определенном объеме среды;

3) штамм – чистая культура из определенного источника в определенное время, с известными свойствами, которые могут отличаться от свойств других штаммов – это именованная чистая культура после определения ее свойств;

4) клон – чистая культура из одной материнской клетки, генетически полностью однородная

Размеры и основные формы бактерий.

По размеру:

мелкие (1-3 мкм);

средние (3-6 мкм); крупные (> 6 мкм).