Слесарев. Основы Химии живого
.pdfОТ АВТОРА
Учебник «Химия: Основы химии живого» рекомендован к изданию как победитель Всероссийского конкурса учебников для бакалавров по фундаментальным дисциплинам для студентов высших учебных заведе ний естественнонаучных направлений и специальностей. Автор учебни ка имеет 20-летний опыт преподавания химии в Санкт-Петербургской государственной медицинской академии им. И. И. Мечникова.
Химия является фундаментальной наукой и мощным инструментом исследования и познания процессов в живых системах. Поэтому студен* ты естественнонаучных специальностей, таких как биология, биохимия, физиология, агрономия, животноводство, биотехнология, экология, а также студенты медицинских и фармацевтических вузов должны хоро шо усвоить основные идеи, законы и методы этой науки. Учитывая очень ограниченное количество часов (200-240), отводимых на изучение химии, автор стремился изложить полный курс химии, включающий основы общей, бионеорганической, биоорганической, биофизической и коллоидной химии, по возможности кратко и доступно, но достаточно строго, на высоком уровне и в рамках единого подхода.
Цель данного учебника - сформировать у читателя целостное вос приятие химии, показать ее тесную связь с жизнедеятельностью био логических систем, сделать изучение химии как можно более эффек тивным и увлекательным, раскрыть химические и физико-химические аспекты превращений молекула - клетка - организм. Автор надеется, что учебник поможет стимулировать интерес к химии у любознатель ных студентов и будет способствовать тесному научному*сотрудничеству химиков, биологов, физиологов, фармацевтов и врачей. Такой союз должен исправить существующую терминологическую несогласован ность в языках родственных специальностей, препятствующую взаи мопониманию. Последовательность, четкость и оригинальность изложе ния многих вопросов химии позволяет рекомендовать данный учебник и студентам химических вузов, преподавателям химии, а также уча щимся медучилищ и школ с углубленным изучением химико-биологи- ческих дисциплин.
Для того чтобы адаптировать химию к медико-биологическим проблемам в соответствии с требованиями государственных общеоб разовательных стандартов, в основу учебника положены следующие принципы:
систематическое изложение современной химии с сохранением необходимой строгости на уровне краткого курса для студентов, специализирующихся в науках о жизни;
представление материала с минимальным привлечением мате-
>матического аппарата, но на таком физико-химическом уровне, который необходим для последующего изучения специальных предметов;
тесная взаимосвязь различных разделов химии, биологии, био-
>химии и медицины показана с помощью большого числа при меров из жизни растительного и животного мира, а также ме дицинской практики.
11
В учебнике использована модульная система с сохранением клас сической последовательности изложения разделов химии. Это рацио нально, так как при наличии логической взаимосвязи между всеми модулями отдельные темы можно выносить в качестве элективов для самостоятельной проработки, а некоторые модули даже изучать па раллельно.
Основными особенностями учебника являются: рассмотрение жид кокристаллического состояния для веществ, молекулы которых анизометричны; более широкое изложение свойств воды и систем на ее ос нове; впервые химические свойства органических и биохимических со единений рассматриваются с учетом окислительно-восстановительной двойственности атомов углерода; последовательно излагаются химиче ские и физико-химические аспекты важнейших биохимических про цессов и различных видов гомеостаза в организме. В учебнике не толь ко даны необходимые общие сведения по химии, но и рассмотрены, иногда на уровне гипотез, ее новые направления, которые тесно связа ны с биологией, физиологией и медициной. В начале каждой главы учебника указаны основные цели ее изучения и перечислены важней шие понятия. Это поможет студенту после изучения главы проверить себя и убедиться в достижении поставленной цели. Многочисленные рисунки и таблицы, представляющие собой графическое резюме наибо лее важных положений, помогут студентам усвоить и повторить прой денный раздел, а также увидеть взаимосвязь химических явлений и их связь с другими формами движения материи.
Автор надеется, что настоящий учебник не только поможет любо знательным студентам приобрести знания по фундаментальной нау ке - химии, но и повысит интеллект и культуру будущих специали стов. Пусть изучение химии для вас, читатели, будет интересным и полезным, пусть приобретенные знания помогут вам в вашей профес сии и в достижении целей, которые вы ставите перед собой.
Автор выражает глубокую благодарность всем сотрудникам кафед ры химии Санкт-Петербургской государственной медицинской акаде мии им. И. И. Мечникова за бесценную помощь в работе, рецензен там - за кропотливый анализ рукописи и чрезвычайно полезные и конструктивные замечания, а своей семье - за поддержку и понима ние в период написания учебника. Особая признательность кандидату биологических наук М. Ю. Корябину за большой вклад в обсуждение и оформление рукописи.
Все замечания, пожелания и отзывы читателей автор примет с большой признательностью и благодарностью.
МОДУЛЬ I
ВВЕДЕНИЕ В СТРОЕНИЕ ВЕЩЕСТВА,
БИОЭНЕРГЕТИКУ И ХИМИЧЕСКУЮ КИНЕТИКУ
Глава 1
СТРОЕНИЕ АТОМА, ПЕРИОДИЧЕСКИЙ ЗАКОН
ИПЕРИОДИЧЕСКАЯ СИСТЕМ А ЭЛЕМ ЕНТОВ
Д. И. М ЕНДЕЛЕЕВА
Глава 2
ХИМИЧЕСКАЯ СВЯЗЬ
Глава 3
М ЕЖМОЛ ЕКУЛ ЯPH ЫЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ
И АГРЕГАТНОЕ СОСТОЯНИЕ ВЕЩ ЕСТВА
Глава 4
ОСНОВЫ ХИМИЧЕСКОЙ ТЕРМОДИНАМИКИ
И БИОЭНЕРГЕТИКИ
Глава 5
ОСНОВЫ КИНЕТИКИ БИОХИМИЧЕСКИХ РЕАКЦИЙ
И ХИМИЧЕСКОГО РАВНОВЕСИЯ
Атомные орбитали в многоэлектронных атомах
|
2Р |
, |
_ |
3d |
4Р . |
4d |
- |
5d4/ |
IS |
ЪР |
л „ |
„ |
5Р |
6/? |
|||
25 _ |
35 |
_ |
45 |
55 |
|
|
65 |
■>
15 < 25 < 2р < 35 < 3/? < 45 < 3d < 4р < 5s < 4d < 5р < 6s < 5d* < Ьр
Увеличение энергии
>
Глава 1
СТРОЕНИЕ АТОМА, ПЕРИОДИЧЕСКИЙ ЗАКОН
ИПЕРИОДИЧЕСКАЯ СИСТЕМА ЭЛЕМЕНТОВ
Д.И. МЕНДЕЛЕЕВА
После изучения этой главы вы должны:
-иметь представление о строении атома и корпускулярно волновой природе электрона;
-знать квантовые числа и принципы заполнения электронами атомных орбиталей;
-знать периодический закон Д. И. Менделеева, принципы по строения периодической системы элементов, написание электрон ных формул атомов элементов;
-уметь прогнозировать химические свойства элементов, исхо дя из их положения в периодической системе и электронных фор мул соответствующих атомов;
-знать основные характеристики атомов элементов и измене ние этих величин по группам и периодам периодической системы.
1.1. СТРОЕНИЕ АТОМА
Понятие атома как мельчайшей неделимой частицы веще ства было предложено еще в V веке до н. э. греческими фило софами Демокритом и Эпикуром. Экспериментальные факты, свидетельствующие о сложной структуре атома, были получены при исследовании электролиза, природы катодных и каналовых лучей, фотоэффекта, радиоактивности элементов и оптиче ских спектров атомов различных элементов. Обобщая извест ные экспериментальные данные, Э. Резерфорд в 1911 г. пред ложил планетарную модель атома, согласно которой 99,9 %
14
массы атома и его положительный заряд сосредоточены в ядре, а электроны - отрицательно заряженные частицы - движутся вокруг ядра подобно планетам в Солнечной системе. Планетар ная модель, благодаря своей наглядности и идеям Н. Бора, сфор мулированным им в 1913 г., долгое время использовалась для объяснения атомно-молекулярных явлений. Однако оказалось, что движение электрона в атоме и устойчивость атомной систе мы, в отличие от устойчивости Солнечной системы, нельзя опи сать законами классической механики. Это вызвано прежде все го очень большой разницей в размерах этих двух систем. Для описания строения атома необходимо применять законы кван тово-волновой механики, которым подчиняется микромир и которые сформулировали в 1920-е годы JI. де Бройль, В. Гей зенберг, Э. Шредингер и П. Дирак.
Согласно современным представлениям атом является слож ной электромагнитной системой, включающей элементарные час тицы - протоны, нейтроны, находящиеся в ядре атома, и элек троны. Протон имеет массу 1,67 •10“ 2 7 кг и положительный за ряд 1,6 •10“ 1 9 Кл, нейтрон имеет примерно такую же массу, но лишен заряда, электронейтрален. Электрон имеет массу покоя в 1836 раз меньше массы протона - 9,1 •10~ 3 1 кг и отрицатель ный заряд, равный по величине заряду протона 1,6 •10~ 1 9 Кл. Атом электронейтрален, так как число электронов в атоме равно числу протонов. Пользуясь периодической системой Д. И. Мен делеева, легко определить число элементарных частиц в атоме. Так, элемент калий имеет порядковый номер 19 и атомную мас су 39. Следовательно, в ядре имеется 19 протонов и 20 нейтро нов (39 - 19 = 20), а вокруг ядра атома калия движется 19 элек тронов.
В ядрах атомов одного и того же элемента может содержать ся при одинаковом числе протонов разное число нейтронов. Та кие атомы имеют различную массу, но одинаковый заряд ядра и, следовательно, одинаковое число электронов.
Разновидности атомов одного и того же химического «элемента, отличающиеся массовыми числами, но имею
щие одинаковый заряд ядра, называются изотопами.
Массовое число элемента является средней величиной мас совых чисел его природных изотопов с учетом их распростра ненности. Например, элемент хлор имеет два естественных
изотопа: 1 7 CI - 75,43 % и f7 CI - 24,57 %, поэтому относи
тельная масса атома хлора приблизительно равна 35 •0,7543 +
+ 37 •0,2457 = 35,491.
Устойчивость атомного ядра зависит от соотношения чисел содержащихся в нем нейтронов и протонов. Для легких эле ментов ядро максимально устойчиво при отношении число ней тронов/число протонов, равном приблизительно 1 , а для тя
15
желых элементов - около 1,6. При иных соотношениях прото нов и нейтронов ядро атома становится неустойчивым и склон ным к самопроизвольным радиоактивным превращениям в дру гие ядра за счет испускания а- или Р-частиц и у-лучей.
При химическом взаимодействии ядра атомов элементов ос таются без изменения, а строение внешних электронных оболочек их атомов изменяется вследствие перераспределения электро нов между ними. Способность атома отдавать или присоединять электроны, зависящая от заряда ядра, от строения электронной оболочки атома и его радиуса, определяет химические свойства соответствующего элемента. Поэтому рассмотрим электронную структуру атома с учетом его квантово-механической модели.
По современным представлениям электрон имеет двойствен ную (корпускулярно-волновую) природу, проявляя одновременно свойства как корпускулы (частицы), так и волны (см. табл. 1 .1 ). Наличие у электрона массы и заряда характеризует его как кор пускулу, а способность пучка электронов к явлениям дифракции и интерференции свидетельствует о волновых свойствах элек трона и используется в электронной микроскопии биологиче ских объектов. Особенности поведения электрона в атоме вызва ны прежде всего его волновыми свойствами, так как волновое движение принципиально отличается от движения корпускулы. При описании движения волны нельзя пользоваться понятием “траектория”. Поэтому для характеристики движения электрона вместо терминов “траектория” и “орбита” применяют вероятно стный подход, т. е. движение электрона описывают через веро ятность нахождения электрона в данной точке атомного про странства. Таким образом, согласно квантово-волновой механике электрон в атоме оказывается как бы “размазанным” по всему объему атома, образуя электронное облако с неравномерной плот ностью, т. е. атомную орбиталь.
Часть атомного пространства, где вероятность пребы «вания электрона составляет свыше 90 %, называется
атомной орбиталью.
На схемах атомная орбиталь обычно изображается как ячейка: О или □ .
Другая особенность поведения электрона в атоме также связа на с его волновыми свойствами. Вследствие закономерностей дви жения электронной волны и с учетом граничных условий, элек трон в атоме может принимать не любые состояния, а только оп ределенные, т. е. для состояний электрона в атоме и величин, их характеризующих, свойственна квантованность (дискретность).
Электрон, находящийся в атоме, участвует в двух видах движения (орбитальное движение относительно ядра и собст венное вращательное движение). Поэтому для полного описа ния состояния электрона в атоме необходимо знать следующие четыре параметра:
16
- |
энергия электрона |
|
- |
величина орбитального момента |
характеризуют движение |
|
количества движения |
|
- направление орбитального момента |
электрона относительно |
|
ядра |
||
- |
количества движения |
) |
направление собственного момента |
||
|
количества движения |
описывает собственное |
|
вращательное движение |
электрона
Все эти четыре параметра, описывающие состояние электро на в атоме (табл. 1 .1 ), вследствие его волновых свойств должны квантоваться, т. е. все их возможные значения обязательно дол жны быть пропорциональны определенным числам, называе мым квантовыми.
1.1.1. КВАНТОВЫЕ ЧИСЛА
Для полного описания состояния каждого электрона в ато ме в квантово-волновой механике используется система четы рех параметров п, I, /П/, т8, называемых квантовыми числами (табл. 1.1). Квантовые числа - величины безразмерные.
Главное квантовое число п. Главное квантовое число - это положительное целое число, 1, 2, 3, 4, ..., оо, которое характери зует в основном энергию электрона, т. е. энергетический уро вень. При п = 1 электрон находится на самом низком энерге тическом уровне. По мере возрастания п энергия уровня увели чивается. Помимо энергии главное квантовое число также характеризует удаленность данного электрона от ядра (г). Чем больше величина п, тем дальше находится электрон от ядра и тем больше его энергия:
Е г < Е2 < Е3 < ... < Еп гг < г 2 < г3 < ... < гп
Кроме того, значение главного квантового числа также ука зывает на число энергетических подуровней, соответствующих данному уровню, - оно равно значению п. Так, в первом энер гетическом уровне (п = 1 ) имеется один подуровень, во втором ( / 1 = 2 )-' два, в третьем (п = 3) -- три, в четвертом ( / 1 = 4 ) - че тыре подуровня и т. д.
Таким образом, главное квантовое число п определяет энер гетический уровень электрона в атоме. Хотя оно может прини мать любые целочисленные значения от 1 до оо, но для электро нов в невозбужденных атомах известных в настоящее время элементов оно изменяется от 1 до 7, что соответствует числу пе риодов в современной периодической системе Менделеева.
Орбитальное квантовое число I. Число I характеризует ве личину орбитального момента количества движения электрона, другими словами, уточняет энергетическое состояние электронов в п[)(делах данного уровня, т. е. энергию подуровня. Наряду с этим орбитальное квантовое число характеризует форму атом ных орбиталей электрона, соответствующих данному подуровню.
2 4/.Ч 17
Таблица 1.1
ЭЛЕКТРОНВ АТОМЕ J
МАССА ПОКОЯ 9,1-1о-31кг ЗАРЯД 1 ,6 Ю 19Кл
ИНТЕРФЕРЕНЦИЯ
ДИФРАКЦИЯ
Характеристикисостоянияэлектронаватоме
ОРБИТАЛЬНЫИ |
МОМЕНТ |
НАПРАВЛЕНИЕ | |
|
КОЛИЧЕСТВА ДВИЖЕНИЯ |
СОБСТВЕННОЙ |
||
|
Г |
МОМЕНТА |
|
|
КОЛИЧЕСТВА |
||
ВЕЛИЧИНА |
|
НАПРАВЛЕНИЕ |
|
|
ДВИЖЕНИЯ |
Квантовые числа
• ЭНЕРГИЯ 1
п о д у ро в н я !
■
•ГИП 1 ПОДУРОВНЯ!
•ФОРМА 1 АТОМНЫХ I ОРБИТАЛЕЙ I
п о д у р о в н я !
• ОРИЕН- |
1 |
• НАПРАВЛЕ |
ГАЦИЯ |
I |
НИЕ СОБСТ |
АТОМНЫХ |
■ |
ВЕННОГО |
ОРБИТАЛЕЙ ■ |
МОМЕНТА |
■КОЛИ
•ЧИСЛО 1 ЧЕСТВА АТОМНЫХ ■ ДВИЖЕНИЯ ОРБИТАЛЕЙ ■
ВПОДУРОВ-1
НЕ ■
/=0,1,2.... (/М )! |
W/=-/,-,-1,0,+!,-,+/■ |
/Яд = ± /2 |
18
Для электронов, находящихся на энергетическом уровне с глав ным квантовым числом п, орбитальное квантовое число I может принимать значения 0, 1, 2, 3, (п - 1). При 1 = 0 имеем энер гетический s-подуровень, которому соответствует сферическая форма атомной орбитали, называемой s-орбиталью. При 1 = 1 имеем энергетический р-подуровень, содержащий атомные ор битали двухлепестковой формы (объемная восьмерка), которые называются р-орбиталями. Если 1 = 2, то имеем энергетический ^-подуровень, где форма атомных орбиталей (d-орбиталей) - че тырехлепестковая. В случае 1 = 3 имеем энергетический /-под уровень, на котором форма атомных орбиталей (/-орбиталей) - шестилепестковая (рис. 1 .1 ).
Для многоэлектронных атомов, вследствие межэлектронных взаимодействий, в пределах одного энергетического уровня вели чины энергии его подуровней различны, причем Ет < Епр < Еп(л < < Enf ... . Следовательно, энергия электрона в многоэлектронном атоме зависит не только от л, но и от I и возрастает с увеличени ем суммы п + I (правило В. М. Клечковского). Энергия электро нов, которые находятся на одном уровне и на одном и том же подуровне, т. е. на атомныхорбиталях одного типа, одинакова.
Магнитное (азимутальное) квантовое число т*. Величина т / характеризует направление орбитального момента количества движения электрона и связанного с ним магнитного момента, другими словами, она определяет ориентацию атомных орбиталей в магнитном поле атома, а также число атомных орбиталей на энергетическом подуровне. Магнитное квантовое число при нимает целочисленные значения от -I до +J, включая и нуль, т. е. всего 21 4- 1 значений, которым отвечает число атомных ор биталей в данном подуровне. Так, любой s-подуровень, где I = О, mi= 0 , содержит одну s-орбиталь; р-подуровень, где I =1 , тп/ = = -1, 0, 4-1 - три р-орбитали, ориентированные по координатным осям х, у, z (рис. 1 .1 ); d-подуровень, где I =2, тп/= - 2 , - 1 , 0 , +1 , 4-2 - пять d-орбиталей, симметрично ориентированных в про странстве; /-подуровень, где 1 = 3, mi= -3, -2, -1, 0, +1, 4-2, 4-3 - семь /-орбиталей.
Таким образом, с помощью трех квантовых чисел n, I и т полностью описывается состояние электрона относительно ядра, т. е. характеризуется атомная орбиталь, на которой он находится.
/ I |
/ 2 |
/ 3 |
Рис. 1.1. Пространственная форма S-, р-, d- и /-атомных орбиталей
19
Спиновое квантовое число ms. Число ms характеризует соб ственное вращательное движение электрона и принимает значе ния + 1 / 2 и - 1 / 2 , отвечающие вращению по часовой и против ча совой стрелки. Вместо понятия “собственное вращение электрона” используется термин “спин” . Поскольку возможны только два направления собственного вращения электрона, то и спин имеет два значения, часто обозначаемые Т и I. Электроны, находящие ся на одной орбитали и обладающие противоположно направ ленными спинами 14, называются спаренными, а одиночный электрон на орбитали называется неспаренным.
Характеристики состояния электрона в атоме, которые опреде ляются четырьмя квантовыми числами, представлены в табл. 1 .1 .
1.1.2. ПРИНЦИПЫ ЗАПОЛНЕНИЯ АТОМНЫХ' ОРБИТАЛЕЙ ЭЛЕКТРОНАМИ
Число электронов в атоме химического элемента определя ется зарядом ядра, который равен порядковому номеру этого элемента в периодической системе Менделеева. Распределение электронов в атомах подчиняется трем основным принципам:
принципу минимума энергии, принципу Паули и правилу Гунда.
Принцип минимума энергии
«Электроны в невозбужденном атоме распределяются по энергетическим уровням и подуровням так, чтобы их суммарная энергия была минимальна.
Энергия электрона в атоме в основном определяется глав ным п и орбитальным I квантовыми числами, поэтому сначала заполняются те подуровни, для которых сумма п + I является наименьшей (правило В. М. Клечковского). В соответствии с этим в многоэлектронном атоме наблюдается следующая последова тельность заполнения электронами энергетических подуровней, согласно которой элементы расположены по периодам в перио дической системе элементов Менделеева:
Номер периода |
1 |
2 |
3 |
4 |
||
Номер |
и |
тип |
|
Is < 2s < 2р < 3s < Зр < 4s < 3d < 4р < |
||
подуровня |
|
|
||||
|
|
|
|
|
||
Номер периода |
5 |
|
6 |
7 |
||
Номер |
и |
тип |
< 5s < |
4d < Ьр < 6 s < 4 / * 5d < 6 p < 7s < 5/ * 6d < 6p |
||
подуровня |
|
|||||
|
|
|
|
|
Эту последовательность заполнения электронами энергети ческих уровней и подуровней в атоме можно представить в краткой форме:
Ens < Е(п- 1)d * E(n-2)f < Е Пр
20