- •Пцр - анализ в клинической лаборатории
- •Р е ц е н з е н т ы
- •К о л л е к т и в а в т о р о в
- •Оглавление
- •Введение
- •История открытия и разработка метода пцр
- •Механизм полимеразной цепной реакции
- •Праймеры
- •Полимераза
- •Пробоподготовка (выделение днк/рнк)
- •Амплификация
- •Факторы, влияющие на эффективность амплификации
- •Использование «горячего старта» при постановке пцр
- •Приборное обеспечение
- •Регистрация результатов
- •Возможности лабораторной диагностики инфекционных болезней
- •Преимущества пцр перед другими методами клинической лабораторной диагностики
- •Универсальность процедуры выявления различных возбудителей
- •Специфичность
- •Чувствительность
- •Актуальность ответа (быстрота получения результата анализа)
- •Возможность экспертизы
- •Исследуемый биологический материал
- •Локализация возбудителей
- •Правила забора материала и транспортировки клинического материала для пцр-диагностики
- •Кровь, плазма, сыворотка
- •Соскоб с эпителиальных клеток для выявления днк возбудителей инфекций, передающихся половым путем
- •Факторы, влияющие на эффективность выявления урогенитальных патогенных микроорганизмов с помощью нк
- •Правила подготовки больного для пцр-диагностики урогенитальных инфекций
- •Мазок с конъюнктивы, слизистой зева и дыхательных путей
- •Гепатит а (hаv), е (hеv)
- •Гепатит в (hвv)
- •Гепатит d (вгd)
- •Гепатит с (hcv)
- •Использование пцр в пульмонологии и фтизиатрии
- •Применение пцр в урогинекологической практике
- •Основные клинические синдромы и урогенитальные инфекции
- •Генитальный герпес вызывает вирусы простого герпеса I и II типов
- •Криминология
- •Установление отцовства
- •Персонализированная медицина
- •Клонирование генов
- •Онкология
- •Применение пцр в практике службы крови
- •Управление качеством пцр-исследований
- •Преаналитический этап
- •Аналитический этап
- •Контроль качества пцр-исследований
- •Контроль реакции амплификации
- •Внутренний контроль вко
- •Проблема контаминации
- •Действия при возникновении контаминации нуклеиновыми кислотами
- •Постаналитический этап
- •Заключение
- •Вопросы для самопроверки
- •Ответы на вопросы для самопроверки
- •Список литературы
- •Приложение
- •Возможности пцр-диагностики в гуз иоккдц
- •Комплекс исследований на заболевания,
- •Передающиеся половым путем (зппп), 2ж3001
- •Хламидиоз, 2ж3002
- •Туберкулез, 2жз003
- •Гепатит с, 2ж3004
- •Микоплазма гоминис, 2ж3005
- •Трихомониаз, 2ж3006
- •Гепатит в, 2ж3007
- •Уреаплазма, 2ж3009
- •Папиллома (впч с определением онкогенности), 2ж3010
- •Гонорея, 2ж3011
- •Гепатит с количественный, 2ж3012
- •Генотипирование вируса гепатита с, 2ж3013
- •Микоплазма гениталиум, 2ж3015
- •Цмв, 2ж3019
- •Вирус Эпштейна-Барр, 2ж3020
- •Вирус герпеса I-го и II-го типов, 2ж3021
- •Вирус герпеса 6-го типа, 2ж3022
- •Токсоплазмы гондии, 2ж3023
- •Энтеровирус, 2ж3027
- •Гепатит в количественный, 2ж3031
- •Пцр - анализ в клинической лаборатории
- •664079, Г. Иркутск, м-н Юбилейный, 100, к. 302.
Гепатит d (вгd)
Возбудитель HDV является уникальным среди всех вирусов гепатита, а также самым вирулентным. Как вирус он неполноценен, т.к. не может реплицироваться и инфицировать человека, не зараженного вирусом гепатита В. Чтобы репродуцироваться в организме человека, вирусу гепатита D необходима внешняя оболочка вируса гепатита В (HВV). HDV состоит из РНК, внутреннего антигена (HDAg) и внешней оболочки, состоящей из HBsAg. HDV встречается только у улиц, инфицированных возбудителем гепатита В.
Вирус гепатита HDV, так же, как и вирус гепатита В, передается через кровь и жидкости организма. Симптомы гепатита HDV идентичны с проявлениями других форм вирусных гепатитов и включают в себя желтуху, лихорадку, недомогание, темную мочу и тошноту. Несмотря на то, что симптомы сходны, заболевание гепатитом HDV протекает в более тяжелой форме, чем заболевание только гепатитом В. Основной особенностью патогенеза HDV-инфекции является ведущая роль HDV по сравнению с HBV. При этом активная репликация HDV чаще приводит к подавлению репродукции HBV.
Существуют два типа инфицирования: коинфицирование и суперинфицирование вирусом гепатита HDV.
Коинфицирование происходит, если пациент одновременно инфицируется вирусом гепатита HDV и вирусом гепатита HBV.
Суперинфицирование происходит, если больной с хроническим инфицированием вирусом гепатита HBV заражается вирусом гепатита HDV. У таких пациентов, как правило, наблюдается внезапное ухудшение состояния при заболевании печени.
У пациентов с гепатитом HBV, которые инфицируются вирусом гепатита HDV, течение хронического гепатита становится более агрессивным и наблюдается очень высокий уровень цирроза и развития терминальных стадии заболеваний печени, что делает такое суперинфицирование чрезвычайно опасным.
Гепатит с (hcv)
Инфицирование гепатитом С является одной из основных причин развития хронических (до 85%) диффузных заболеваний печени и гепатоцеллюлярной карциномы (первичного рака печени). Отличительной особенностью ВГС является многолетнее латентное или малосимптомное течение по типу так называемой медленной вирусной инфекции. В таких случаях заболевание большей частью долго остается нераспознанным и диагностируется на далеко зашедших клинических стадиях, в том числе на фоне развития цирроза печени и первичной гепатоцеллюлярной карциномы.
В настоящее время наиболее распространенным методом лабораторной диагностики гепатита HСV является иммуноферментный анализ, направленный на выявления специфических антител в сыворотке крови. При использовании тест-систем даже 3-го поколения, считающихся наиболее чувствительными и специфичными, не всегда удается своевременно поставить диагноз. В большинстве случаев это связано с существованием «серологического окна». Этот период может продолжаться от 3 недель до 6 месяцев. Кроме того, наличие антител к вирусу гепатита HСV не свидетельствует о наличии заболевания. Тест-систем для выявления антигенов вируса гепатита HСV в настоящее время в практическом здравоохранении нет.
Одним из основных маркеров активности патологического процесса является репликация вируса, для доказательства которой необходимо выявление самого вируса или его компонентов. РНК HCV обнаруживаются в сыворотке крови уже в течение первой недели после инфицирования.
Учитывая неуклонный рост заболеваемости вирусным гепатитом HCV, проблема этиологической диагностики этого заболевания становится все более актуальной.
ПЦР играет ведущую роль в диагностике гепатита С, позволяя:
Установить факт инфицированности гепатитом С и выявить смешанные формы HСV/HВV и HCV/HGV. При микст - инфекции вирусы гепатитов HCV и HBV оказывают взаимное влияние на течение инфекционного процесса. HВV подавляет развитие HСV за счет стимуляции в организме больного неспецифических цитокинов. С другой стороны, коровский белок HСV подавляет репликацию HВV, связываясь с прегеномной РНК HВV, препятствуя ее упаковке. При коинфекции вирусом гепатита HGV в подавляющем большинстве исследований наблюдался менее выраженный синдром цитолиза. Подобный феномен благоприятного влияния HGV описывают у пациентов с ВИЧ-инфекцией, у которых коинфекция вирусом гепатита HGV способствовала замедлению развития СПИД (дискутабельные данные).
Установить наличие показаний к противовирусному лечению, а также выбрать оптимальную схему лечения. Решить эти вопросы помогают количественное определение уровня РНК HCV (при низкой вирусной нагрузке эффективность лечения выше) и определение генотипа HCV (генотип 1 хуже отвечает на противовирусную терапию по сравнению с генотипами 2 и 3). Наличие генотипа 1, высокий уровень виремии ассоциированы с продолжительностью заболевания и тяжестью печеночных изменений.
Оценить эффективность проводимого лечения. Курс лечения гепатита С (генотип 1) составляет 48 недель, но уже на 12 неделе лечения врач может оценить эффективность проводимой терапии, сопоставляя результаты анализов до начала лечения и на двенадцатой неделе лечения.
оценить устойчивость ответа на лечение. Для этого проводят обнаружение РНК HCV через 24 недели и через 72 недели после окончания лечения.
Рис. 6. Преимущества выявления HCV количественным метода ПЦР в реальном времени перед качественным методом.
В настоящее время успешно реализуются количественные методы ПЦР-анализа. Хорошим прогностическим признаком при назначении терапии является низкий уровень виремии – менее 30000 ME/мл. Количественный ПЦР-тест является информативным параметром отклика пациента на терапию (рис. 6).
При проводимой терапии понижение вирусной нагрузки является явным маркером того, что пациент хорошо реагирует на выбранные лекарственные препараты и их дозу. В случае, когда в течение трех месяцев не происходит значимого уменьшения уровня вирусной нагрузки (в 100 и более раз), обычно рекомендуется изменение дозы или смена препарата и схемы лечения. В связи с этим важно постоянно контролировать ход лечения. Количественное определение РНК вируса гепатита С в плазме крови во время лечения является необходимым исследованием и позволяет врачам выбрать оптимальную схему лечения для каждого пациента.