Добавил:
Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

книги из ГПНТБ / Хокинс, К. Абсолютная конфигурация комплексов металлов

.pdf
Скачиваний:
7
Добавлен:
22.10.2023
Размер:
12.68 Mб
Скачать

Конформационный анализ

133

приведены в табл. 3-7. Эти структуры соответствуют минимальной энергии, равной 19,8 ккал-моль“1.

Вкомплексах, в которых кольца имеют конформации гибкой ванны и хиральности которых одинаковы, систе­ ма взаимодействий каждого кольца сравнима с системой взаимодействий моно-комплекса, и в наборе конформа­ ций гибкой ванны предпочтительными оказываются кон­ формации симметрично скошенного типа. Такое кольцо симметрично относительно оси второго порядка, являю­ щейся в плоскости ху биссектрисой угла хОу. Поскольку оба остальных хелатных кольца расположены также сим­ метрично относительно этой оси, каждое кольцо при иска­ жении сохраняет симметрию второго порядка.

Структуры колец, которые, как было найдено, соответ­ ствуют минимальной энергии в трис-комплексах, описа­ ны в табл. 3-7. В таких комплексах каждое кольцо имеет конформационную энергию 7,1 ккал-моль“1 (общая энер­ гия 21,3 ккал-моль“1).

Втрис-комплексах неизбежно существует большее напряжение, чем в моно- и транс-бис-комплексах, по­ скольку аминогруппа не может просто удалиться от взаимодействующих с ней атомов. Взаимодействия ослаб­ ляются главным образом угловыми деформациями, скон­ центрированным в /CMNC и zCN(l)MN(2). В конформа­ ции с минимумом энергии деформации сконцентрированы

восновном в углах MNC (119,5°). Было найдено, что эта конформация соответствует довольно отчетливому энер­ гетическому минимуму. При меньших значениях Z-MNC вандерваальсовские взаимодействия больше, а при боль­ ших значениях Z-MNC efg и <%t становятся неоправданно

большими. Второй локализованный энергетический ми­ нимум, отвечающий более высокой энергии, соответствует конформации с Z.MNC = 117,0° и Z-N(1)MN(2) =~ 100°.

ПЯТИЧЛЕННЫЕ АМИНОКИСЛОТНЫЕ КОЛЬЦА

Из рентгеноструктурных исследований ряда комплек­ сов с аминокислотами было найдено, что аминокислотное хелатное кольцо существует в одном из двух типов кон­ формаций (рис. 3-21):

134

 

Глава 3

1)

Плоская

или слегка складчатая конформация.

2)

Асимметричная конформация формы конверта, в

которой атомы

NCCOO слегка некопланарны.

Торсионное расположение атомов в аминокислотных кольцах иное, чем в кольцах с диаминами. Важно отме­ тить, что когда связь С—0 (—М) занимает заслоненное

Рис. 3-21. Складчатая конфигурация и конфигурация формы кон­ верта аминокислотных хелатных колец.

положение по отношению к связи С—N, С = 0 имеет шахматную ориентацию относительно R и Н, а в случае когда С—0(—М) занимает шахматное положение относи­ тельно связей С—N и С—Н, связь С = 0 имеет заслонен­ ную ориентацию относительно С—R (рис. 3-22). В Диаминовых циклах углы со составляют около 50°; для амино-

Конформациинный анализ

135

кислот рентгеноструктурные исследования показали, что соответствующий двугранный угол имеет значения между О и 30° [45). Такой же диапазон значений был найден так­ же для свободных аминокислот в форме цвиттер-ионов или протонированной форме (рис. 4-9) и для ряда карбо­ новых кислот [71].

Рис. 3-22. Торсионная структура относительно С—О-связи в аминокислотных хелатных кольцах.

Таким образом, по-видимому, при торсионных взаимо­ действиях в карбоксилатах выгодно заслоненное положе­ ние связи С—О относительно заместителя при а-углероде. Экспериментально определенный барьер для свободного вращения вокруг связи С—О составляет примерно 1 ккал-моль-1 [1], и поэтому для аминокислотных хела­ тов поворотная энергия относительно связи С—О опре­ делялась по уравнению (3-51) при Ѵ0 — 1 ккал-моль-1 1521:

^ = 4 - ^ [1 + cos3(60-со)]

(3-51)

Однако следует помнить, что, когда связи С—О и С—N находятся целиком в заслоненной ориентации и хелатный цикл является плоским, торсионное расположение отно­ сительно связи С—N наиболее невыгодно и при этом за­ местители находятся в заслоненном положении

[1/0(С—N) = 2 ккал-моль-1].

136

Глава 3

Геометрическая модель

Для комплекса типа М(апі)а2Ь.> аминокислотное хелат­ ное кольцо располагалось в правой системе координат, как показано на рис. 3-23. Конформации определялись постоянным набором длин связей и внутренними коорди­ натами Z_NMO( = a), Z_MNC(1), (= ß), zx и z2. Положения

Z

*

I

Рис. 3-23. Геометрическая модель для M(am)a2b2.

заместителей относительно кольца определялось соответ­ ствующими длинами связей и валентными углами, а по­ ложения групп а и b координатами их донорных атомов.

Вычисления энергии

Торсионная энергия и энергия угловой деформации

определялись обычным

образом

для

большого

набора

конформаций.

Углы а

и ß варьировались от их зна­

чений в ненапряженном состоянии

(90

и 109,5°) с интер­

валами в 2°, а Zj и Zj варьировались

независимо,

при­

нимая

ряд

значений

от 0,0

до ±

0,8 Â.

Допу­

скалась

возможность

удаления

координированных

Конформационный анализ

137

групп а от взаимодействующих с ними атомов хелатного цикла. Координаты ха и уа независимо варьировали с ин­

тервалами в

0,1 Â.

ё'ѳ от со

для

некоторых

Графики

зависимости

типичных значений а и р приведены на рис.

3-24,

а

ана­

логичные графики для полной энергии

(<%ѵ у <%t + S’o)

приа = ЫН3 и R = —СН.,Х приведены на рис. 3-25.

 

Каж­

дая кривая

соответствует

конкретному

значению

С(1)

и ряду значений С(2). Сплошная линия

на

рис.

3-24 и

3-25 представляет собой огибающую линию энергетиче­ ских минимумов на всех кривых. Геометрические пара­ метры для некоторых конформаций с минимальной энер­

гией напряжения цикла

приведены

в табл. 3-8.

 

 

 

 

 

 

Т абли ц а 3-8

Некоторые конформации аминокислотного хелатного

 

кольца, отвечающие

минимуму

энергии

а , град

р . град

 

О

го,

О

0), град

*1.

Л

Л

 

 

 

88

1 0 7 , 5

0 , 0

0 , 0

0

88

1 07 , 5

+ 0 , 2

0 , 0

16. 2

88

1 0 7 , 5

+ 0 , 4

0 , 0

3 2 , 8

88

1 07, 5

+ 0,1

- 0, 1

17, 4

88

1 07 , 5

+ 0 , 2

+ 0 , 2

2 , 6

88

1 07 , 5

+ 0 , 4

+ 0 , 2

13, 4

88

1 07 . 5

0 , 0

— 0 , 2

1 8 . 7

86

1 09 , 5

+ 0 , 2

0 . 0

15 . 7

86

1 09 , 5

+ 0 , 4

-1 0 , 2

2 , 5

8 6

1 09 , 5

0 , 0

— 0 , 2

18,1

86

1 09 , 5

+ 0 ,1

— 0 ,1

1 6, 0

86

1 0 9 , 5

+ 0 , 2

+ 0 , 2

2 , 5

86

1 07 , 5

+ 0 , 4

+ 0 , 4

4 , 8

86

1 07 , 5

+ 0 , 4

+ 0 , 2

1 3, 8

86

1 07, 5

4- 0 , 4

0 , 0

3 1 , 6

84

1 0 9 , 5

+ 0 , 4

+ 0 , 4

4 , 5

Из рис. 3-25 ясно, что варианты строения аминокислот­ ного хелатного кольца ограничиваются уплощенной кон­ формацией или конформацией типа конверта с интерва­

лом значений

со

от 0 до 30°.

Внутри

этого интервала

со — 0 ± 30°

не

существует

никаких

энергетических

8

1

40

1

I

_ _ 1_ _

_ I I _

_ I_ _

_ I I_ I

1

60

20

0

20

40

 

60

 

 

 

-

CO

 

 

 

 

 

Рис . 3-24. Изменение %Л-%в в зависимости от со при а

=

86° и ß

=

 

 

=

109,5°.

 

 

 

 

 

--------- полный

минимум

энергии

для

каждого

значения

со; — — —

Zl = —z2\ . . .

г, = 0,0;---------- г, =

+ 0,2

А ; --------------z, =

+

0,4 Л [52].

Рис .

3-25. Зависимость полной

энергии

от со

при

а = 86° и

 

ß =

109,5°.

 

 

 

 

 

--------

полный минимум энергии для каждого значения со; — —

Zi = —z2;

. • •

Zi = 0,0; полностью скрыто кривой (

) ;

zt —

0,2

о

Л. Значе­

ния со в левой части графика соответствуют конформациям с экваториальной ориентацией заместителя, а в правой части — с аксиальной [52].

 

Конформационный анализ

139

барьеров

для изменения конформации,

поскольку

энергия

остается неизменной

в

пределах 2,0 ±

± 0,2 ккал-моль-1. Вклады <gt и S

q в

эту энергию зави­

сят от типа конформации, а также от степени складчатости лиганда, которая определяется о. В уплощенных кон­ формациях заместители при N и С(1) находятся в засло­ ненном положении, что приводит к высокому значению <%t, а мало вследствие ничтожного углового напряжения в цикле. Заслоненность относительно С—Н связи может быть уменьшена путем образования конформации формы конверта; при этом сохраняется предпочтительность тор­ сионного расположения относительно С—О-связи. Одна­ ко снижение торсионного напряжения сопровождается возрастанием энергии углового напряжения.

Несвязанные взаимодействия между заместителями в хелатном кольце и группой а чрезвычайно малы, даже если заместитель типа —СН2Х является аксиальным. Единственный эффект несвязанных взаимодействий с аксиальным заместителем состоит в ограничении набора значений со для некоторых типов конформаций. Согласно вычислениям [52], не существует никакой заметной раз­ ности энергии между аксиальной и экваториальной кон­ формациями с минимальными энергиями и не существует барьера для инверсии цикла. Недавнее рентгеноструктур­ ное исследование ^ыс-бис-(ь-изолейцинато) меди(П) по­ казало, что, в соответствии с этим выводом, один a -заме­ ститель имеет аксиальную ориентацию [134]*.

КОРРЕЛЯЦИЯ ПРЕДСКАЗАННЫХ И РЕАЛЬНЫХ СТРУКТУР

Предпочтительные конформации, предсказанные для отдельных систем на основе априорных вычислений, являются нереальными в том смысле, что внешние взаи­ модействия, такие, как эффекты сольватации или взаимо­ действия, характерные для кристаллического состояния, не были приняты во внимание. Для большинства изучен-

* Дополнительные данные. Это наблюдалось также для цис-

бис-(о-аланинато)меди(ІІ) [Gillard R. D., Mason R., Payne N. С., Robertson G. В., J. Chem. Soc. A., 1969, 1864].

Углы цикла в шестичленных диаминовых хелатах

Усредненные значения в градусах. [106].

[105].

N03]. ________________

Конформационный анализ

I4I

ных систем был найден ряд структур, отвечающих наинизшей энергии, и еще один обширный ряд структур, слегка отличающихся от предыдущих по геометрическим параметрам, которые имеют энергии, только немного превышающие вычисленный минимум. В кристалле си­ стема принимает такое строение, которое сводит к мини­ муму совокупность внутренних и внешних взаимодейст­ вий. Поскольку для молекулы имеется большой ряд кон­ формаций с низкой энергией, весьма вероятно, что одна из этих конформаций допускает минимизацию внутрен­ них и внешних взаимодействий. Таким образом, можно предположить, что конформации, определяемые рентгено­ структурными исследованиями должны быть среди набо­ ра конформаций, предсказанных априорными расчетами. Однако при некоторых взаимодействиях в твердом состоя­ нии, например при образовании водородных связей, кон­ формации с высокой энергией могут стать предпочтитель­ нее.

Сравним данные табл. 3-5 с данными табл. 4-4. Строе­ ние этилендиаминовых хелатных колец в различных кри­ сталлах близко соответствует предсказанному для них строению. Шестичленные диаминовые хелаты дают еще один довольно яркий пример хорошего совпадения между предсказанными и найденными структурами (табл. 3-9). Определенные с помощью рентгенографии различные параметры аминокислотных хелатных колец (табл. 3-10) согласуются с результатами априорных расчетов (см. выше).

Внастоящее время не имеется подробной информации

огеометрии хелатных колец в растворе, но весьма вероят­ но, что по крайней мере одна, а, возможно, и много боль­ ше из рассчитанных конформаций с минимальными энер­ гиями будет все же соответствовать структуре с наиниз-

шей энергией в растворе.

Исключительное совпадение предсказанных конфор­ маций с минимумом энергии и конформаций, найденных в кристаллическом состоянии, показывает, что мы пра­ вильно понимаем основные факторы, определяющие энер­ гии конформаций. Возможно, на этой стадии развития предмета чрезмерно надеяться на хорошее соответствие между вычисленными и экспериментально найденными

142

Глава 3

Таблица 3-10

Параметры циклов пятичленных аминокислотных хелатов по рентгеноструктурным данным

К о м п л ек с

а, град P, град

 

О

О

со, град

Литера­

 

zj_, А

z2, А

тура

Ni(a-NH2ibut)2 -4H20

83,0

109,3

—0,20 —0,33 + 14,1

102

 

84,9

109,1

+ 0,04 —0,27 +28,1

 

Cu(gly)o-H,0

85,4

109,5

+ 0,12 + 0,06

+ 4 ,5

46

Cu(L-(Et)2

85,0

109,3

+ 0,08 —0,02

+ 8,3

101

84,1

103,6

+ 0,62 + 0,22 + 30,1

Cu(L-ileu) a l a ) 2

84,2

111,9

+ 0,14

0,04

+ 6,6

134

2

84,5

111,2

—0,08

+ 0,06

10,5

 

Cu(b-scr)2

82,3

110,2

 

0,52

+

+ 8,0

62

 

+ 0,36

+ 13,4

 

83,7

109,6

+ 0,52

+ 0,31

 

 

+

 

 

 

 

Ni(b-ser)2 2H20

81,0

108,1

+ 0,55

+0,23

+ 23,5

63

разностями энергий. Но можно надеяться, что по мере увеличения числа экспериментальных данных эти расче­ ты могут быть в дальнейшем уточнены..

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ МЕТОДЫ КОНФОРМАЦИОННОГО АНАЛИЗА

Для получения качественной информации о предпочти­ тельности конформаций в комплексах металлов исполь­ зовались различные методы, но количественных данных было получено мало. Для некоторых систем существуют методы, которые позволяют определить разности энер­ гий между конформациями. Эти методы рассмотрены ниже. Качественные исследования обсуждаются в главах, посвя­ щенных отдельным методам.

Методы, основанные на выделении компонентов

Рассмотрим два диастереомера А и В. Если они при­ ведены в состояние равновесия и разделяются без нару­ шения равновесия, константу равновесия можно опреде­ лить из отношения концентраций этих компонентов, и следовательно, разность свободных энергий между ними

Соседние файлы в папке книги из ГПНТБ