книги из ГПНТБ / Хокинс, К. Абсолютная конфигурация комплексов металлов
.pdfКонформационный анализ |
133 |
приведены в табл. 3-7. Эти структуры соответствуют минимальной энергии, равной 19,8 ккал-моль“1.
Вкомплексах, в которых кольца имеют конформации гибкой ванны и хиральности которых одинаковы, систе ма взаимодействий каждого кольца сравнима с системой взаимодействий моно-комплекса, и в наборе конформа ций гибкой ванны предпочтительными оказываются кон формации симметрично скошенного типа. Такое кольцо симметрично относительно оси второго порядка, являю щейся в плоскости ху биссектрисой угла хОу. Поскольку оба остальных хелатных кольца расположены также сим метрично относительно этой оси, каждое кольцо при иска жении сохраняет симметрию второго порядка.
Структуры колец, которые, как было найдено, соответ ствуют минимальной энергии в трис-комплексах, описа ны в табл. 3-7. В таких комплексах каждое кольцо имеет конформационную энергию 7,1 ккал-моль“1 (общая энер гия 21,3 ккал-моль“1).
Втрис-комплексах неизбежно существует большее напряжение, чем в моно- и транс-бис-комплексах, по скольку аминогруппа не может просто удалиться от взаимодействующих с ней атомов. Взаимодействия ослаб ляются главным образом угловыми деформациями, скон центрированным в /CMNC и zCN(l)MN(2). В конформа ции с минимумом энергии деформации сконцентрированы
восновном в углах MNC (119,5°). Было найдено, что эта конформация соответствует довольно отчетливому энер гетическому минимуму. При меньших значениях Z-MNC вандерваальсовские взаимодействия больше, а при боль ших значениях Z-MNC efg и <%t становятся неоправданно
большими. Второй локализованный энергетический ми нимум, отвечающий более высокой энергии, соответствует конформации с Z.MNC = 117,0° и Z-N(1)MN(2) =~ 100°.
ПЯТИЧЛЕННЫЕ АМИНОКИСЛОТНЫЕ КОЛЬЦА
Из рентгеноструктурных исследований ряда комплек сов с аминокислотами было найдено, что аминокислотное хелатное кольцо существует в одном из двух типов кон формаций (рис. 3-21):
134 |
|
Глава 3 |
1) |
Плоская |
или слегка складчатая конформация. |
2) |
Асимметричная конформация формы конверта, в |
|
которой атомы |
NCCOO слегка некопланарны. |
Торсионное расположение атомов в аминокислотных кольцах иное, чем в кольцах с диаминами. Важно отме тить, что когда связь С—0 (—М) занимает заслоненное
Рис. 3-21. Складчатая конфигурация и конфигурация формы кон верта аминокислотных хелатных колец.
положение по отношению к связи С—N, С = 0 имеет шахматную ориентацию относительно R и Н, а в случае когда С—0(—М) занимает шахматное положение относи тельно связей С—N и С—Н, связь С = 0 имеет заслонен ную ориентацию относительно С—R (рис. 3-22). В Диаминовых циклах углы со составляют около 50°; для амино-
Конформациинный анализ |
135 |
кислот рентгеноструктурные исследования показали, что соответствующий двугранный угол имеет значения между О и 30° [45). Такой же диапазон значений был найден так же для свободных аминокислот в форме цвиттер-ионов или протонированной форме (рис. 4-9) и для ряда карбо новых кислот [71].
Рис. 3-22. Торсионная структура относительно С—О-связи в аминокислотных хелатных кольцах.
Таким образом, по-видимому, при торсионных взаимо действиях в карбоксилатах выгодно заслоненное положе ние связи С—О относительно заместителя при а-углероде. Экспериментально определенный барьер для свободного вращения вокруг связи С—О составляет примерно 1 ккал-моль-1 [1], и поэтому для аминокислотных хела тов поворотная энергия относительно связи С—О опре делялась по уравнению (3-51) при Ѵ0 — 1 ккал-моль-1 1521:
^ = 4 - ^ [1 + cos3(60-со)] |
(3-51) |
Однако следует помнить, что, когда связи С—О и С—N находятся целиком в заслоненной ориентации и хелатный цикл является плоским, торсионное расположение отно сительно связи С—N наиболее невыгодно и при этом за местители находятся в заслоненном положении
[1/0(С—N) = 2 ккал-моль-1].
136 |
Глава 3 |
Геометрическая модель
Для комплекса типа М(апі)а2Ь.> аминокислотное хелат ное кольцо располагалось в правой системе координат, как показано на рис. 3-23. Конформации определялись постоянным набором длин связей и внутренними коорди натами Z_NMO( = a), Z_MNC(1), (= ß), zx и z2. Положения
Z
*
I
Рис. 3-23. Геометрическая модель для M(am)a2b2.
заместителей относительно кольца определялось соответ ствующими длинами связей и валентными углами, а по ложения групп а и b координатами их донорных атомов.
Вычисления энергии
Торсионная энергия и энергия угловой деформации
определялись обычным |
образом |
для |
большого |
набора |
|||
конформаций. |
Углы а |
и ß варьировались от их зна |
|||||
чений в ненапряженном состоянии |
(90 |
и 109,5°) с интер |
|||||
валами в 2°, а Zj и Zj варьировались |
независимо, |
при |
|||||
нимая |
ряд |
значений |
от 0,0 |
до ± |
0,8 Â. |
Допу |
|
скалась |
возможность |
удаления |
координированных |
Конформационный анализ |
137 |
групп а от взаимодействующих с ними атомов хелатного цикла. Координаты ха и уа независимо варьировали с ин
тервалами в |
0,1 Â. |
ё'ѳ от со |
для |
некоторых |
||
Графики |
зависимости |
|||||
типичных значений а и р приведены на рис. |
3-24, |
а |
ана |
|||
логичные графики для полной энергии |
(<%ѵ у <%t + S’o) |
|||||
приа = ЫН3 и R = —СН.,Х приведены на рис. 3-25. |
|
Каж |
||||
дая кривая |
соответствует |
конкретному |
значению |
С(1) |
||
и ряду значений С(2). Сплошная линия |
на |
рис. |
3-24 и |
3-25 представляет собой огибающую линию энергетиче ских минимумов на всех кривых. Геометрические пара метры для некоторых конформаций с минимальной энер
гией напряжения цикла |
приведены |
в табл. 3-8. |
|||||
|
|
|
|
|
|
Т абли ц а 3-8 |
|
Некоторые конформации аминокислотного хелатного |
|||||||
|
кольца, отвечающие |
минимуму |
энергии |
||||
а , град |
р . град |
|
О |
го, |
О |
0), град |
|
*1. |
Л |
Л |
|||||
|
|
|
|||||
88 |
1 0 7 , 5 |
0 , 0 |
0 , 0 |
0 |
|||
88 |
1 07 , 5 |
+ 0 , 2 |
0 , 0 |
16. 2 |
|||
88 |
1 0 7 , 5 |
+ 0 , 4 |
0 , 0 |
3 2 , 8 |
|||
88 |
1 07, 5 |
+ 0,1 |
- 0, 1 |
17, 4 |
|||
88 |
1 07 , 5 |
+ 0 , 2 |
+ 0 , 2 |
2 , 6 |
|||
88 |
1 07 , 5 |
+ 0 , 4 |
+ 0 , 2 |
13, 4 |
|||
88 |
1 07 . 5 |
0 , 0 |
— 0 , 2 |
1 8 . 7 |
|||
86 |
1 09 , 5 |
+ 0 , 2 |
0 . 0 |
15 . 7 |
|||
86 |
1 09 , 5 |
+ 0 , 4 |
-1 0 , 2 |
2 , 5 |
|||
8 6 |
1 09 , 5 |
0 , 0 |
— 0 , 2 |
18,1 |
|||
86 |
1 09 , 5 |
+ 0 ,1 |
— 0 ,1 |
1 6, 0 |
|||
86 |
1 0 9 , 5 |
+ 0 , 2 |
+ 0 , 2 |
2 , 5 |
|||
86 |
1 07 , 5 |
+ 0 , 4 |
+ 0 , 4 |
4 , 8 |
|||
86 |
1 07 , 5 |
+ 0 , 4 |
+ 0 , 2 |
1 3, 8 |
|||
86 |
1 07, 5 |
4- 0 , 4 |
0 , 0 |
3 1 , 6 |
|||
84 |
1 0 9 , 5 |
+ 0 , 4 |
+ 0 , 4 |
4 , 5 |
Из рис. 3-25 ясно, что варианты строения аминокислот ного хелатного кольца ограничиваются уплощенной кон формацией или конформацией типа конверта с интерва
лом значений |
со |
от 0 до 30°. |
Внутри |
этого интервала |
со — 0 ± 30° |
не |
существует |
никаких |
энергетических |
8
1 |
40 |
1 |
I |
_ _ 1_ _ |
_ I I _ |
_ I_ _ |
_ I I_ I |
1 |
60 |
20 |
0 |
20 |
40 |
|
60 |
|
|
|
|
- |
CO |
|
|
|
|
|
Рис . 3-24. Изменение %Л-%в в зависимости от со при а |
= |
86° и ß |
= |
|||||
|
|
= |
109,5°. |
|
|
|
|
|
--------- полный |
минимум |
энергии |
для |
каждого |
значения |
со; — — — |
||
Zl = —z2\ . . . |
г, = 0,0;---------- г, = |
+ 0,2 |
А ; --------------z, = |
+ |
0,4 Л [52]. |
Рис . |
3-25. Зависимость полной |
энергии |
от со |
при |
а = 86° и |
||
|
ß = |
109,5°. |
|
|
|
|
|
-------- |
полный минимум энергии для каждого значения со; — — |
— |
Zi = —z2; |
||||
. • • |
Zi = 0,0; полностью скрыто кривой ( |
) ; |
— |
zt — |
0,2 |
о |
|
Л. Значе |
ния со в левой части графика соответствуют конформациям с экваториальной ориентацией заместителя, а в правой части — с аксиальной [52].
|
Конформационный анализ |
139 |
||
барьеров |
для изменения конформации, |
поскольку |
||
энергия |
остается неизменной |
в |
пределах 2,0 ± |
|
± 0,2 ккал-моль-1. Вклады <gt и S |
q в |
эту энергию зави |
сят от типа конформации, а также от степени складчатости лиганда, которая определяется о. В уплощенных кон формациях заместители при N и С(1) находятся в засло ненном положении, что приводит к высокому значению <%t, а мало вследствие ничтожного углового напряжения в цикле. Заслоненность относительно С—Н связи может быть уменьшена путем образования конформации формы конверта; при этом сохраняется предпочтительность тор сионного расположения относительно С—О-связи. Одна ко снижение торсионного напряжения сопровождается возрастанием энергии углового напряжения.
Несвязанные взаимодействия между заместителями в хелатном кольце и группой а чрезвычайно малы, даже если заместитель типа —СН2Х является аксиальным. Единственный эффект несвязанных взаимодействий с аксиальным заместителем состоит в ограничении набора значений со для некоторых типов конформаций. Согласно вычислениям [52], не существует никакой заметной раз ности энергии между аксиальной и экваториальной кон формациями с минимальными энергиями и не существует барьера для инверсии цикла. Недавнее рентгеноструктур ное исследование ^ыс-бис-(ь-изолейцинато) меди(П) по казало, что, в соответствии с этим выводом, один a -заме ститель имеет аксиальную ориентацию [134]*.
КОРРЕЛЯЦИЯ ПРЕДСКАЗАННЫХ И РЕАЛЬНЫХ СТРУКТУР
Предпочтительные конформации, предсказанные для отдельных систем на основе априорных вычислений, являются нереальными в том смысле, что внешние взаи модействия, такие, как эффекты сольватации или взаимо действия, характерные для кристаллического состояния, не были приняты во внимание. Для большинства изучен-
* Дополнительные данные. Это наблюдалось также для цис-
бис-(о-аланинато)меди(ІІ) [Gillard R. D., Mason R., Payne N. С., Robertson G. В., J. Chem. Soc. A., 1969, 1864].
Углы цикла в шестичленных диаминовых хелатах
Усредненные значения в градусах. [106].
[105].
N03]. ________________
Конформационный анализ |
I4I |
ных систем был найден ряд структур, отвечающих наинизшей энергии, и еще один обширный ряд структур, слегка отличающихся от предыдущих по геометрическим параметрам, которые имеют энергии, только немного превышающие вычисленный минимум. В кристалле си стема принимает такое строение, которое сводит к мини муму совокупность внутренних и внешних взаимодейст вий. Поскольку для молекулы имеется большой ряд кон формаций с низкой энергией, весьма вероятно, что одна из этих конформаций допускает минимизацию внутрен них и внешних взаимодействий. Таким образом, можно предположить, что конформации, определяемые рентгено структурными исследованиями должны быть среди набо ра конформаций, предсказанных априорными расчетами. Однако при некоторых взаимодействиях в твердом состоя нии, например при образовании водородных связей, кон формации с высокой энергией могут стать предпочтитель нее.
Сравним данные табл. 3-5 с данными табл. 4-4. Строе ние этилендиаминовых хелатных колец в различных кри сталлах близко соответствует предсказанному для них строению. Шестичленные диаминовые хелаты дают еще один довольно яркий пример хорошего совпадения между предсказанными и найденными структурами (табл. 3-9). Определенные с помощью рентгенографии различные параметры аминокислотных хелатных колец (табл. 3-10) согласуются с результатами априорных расчетов (см. выше).
Внастоящее время не имеется подробной информации
огеометрии хелатных колец в растворе, но весьма вероят но, что по крайней мере одна, а, возможно, и много боль ше из рассчитанных конформаций с минимальными энер гиями будет все же соответствовать структуре с наиниз-
шей энергией в растворе.
Исключительное совпадение предсказанных конфор маций с минимумом энергии и конформаций, найденных в кристаллическом состоянии, показывает, что мы пра вильно понимаем основные факторы, определяющие энер гии конформаций. Возможно, на этой стадии развития предмета чрезмерно надеяться на хорошее соответствие между вычисленными и экспериментально найденными
142 |
Глава 3 |
Таблица 3-10
Параметры циклов пятичленных аминокислотных хелатов по рентгеноструктурным данным
К о м п л ек с |
а, град P, град |
|
О |
О |
со, град |
Литера |
|
|
zj_, А |
z2, А |
тура |
||||
Ni(a-NH2ibut)2 -4H20 |
83,0 |
109,3 |
—0,20 —0,33 + 14,1 |
102 |
|||
|
84,9 |
109,1 |
+ 0,04 —0,27 +28,1 |
|
|||
Cu(gly)o-H,0 |
85,4 |
109,5 |
+ 0,12 + 0,06 |
+ 4 ,5 |
46 |
||
Cu(L-(Et)2 |
85,0 |
109,3 |
+ 0,08 —0,02 |
+ 8,3 |
101 |
||
84,1 |
103,6 |
+ 0,62 + 0,22 + 30,1 |
|||||
Cu(L-ileu) a l a ) 2 |
84,2 |
111,9 |
+ 0,14 |
0,04 |
+ 6,6 |
134 |
|
2 |
84,5 |
111,2 |
—0,08 |
+ 0,06 |
10,5 |
|
|
Cu(b-scr)2 |
82,3 |
110,2 |
|
0,52 |
+ |
—+ 8,0 |
62 |
|
+ 0,36 |
+ 13,4 |
|||||
|
83,7 |
109,6 |
+ 0,52 |
+ 0,31 |
|
||
|
+ |
|
|
|
|
||
Ni(b-ser)2 2H20 |
81,0 |
108,1 |
+ 0,55 |
+0,23 |
+ 23,5 |
63 |
разностями энергий. Но можно надеяться, что по мере увеличения числа экспериментальных данных эти расче ты могут быть в дальнейшем уточнены..
ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ МЕТОДЫ КОНФОРМАЦИОННОГО АНАЛИЗА
Для получения качественной информации о предпочти тельности конформаций в комплексах металлов исполь зовались различные методы, но количественных данных было получено мало. Для некоторых систем существуют методы, которые позволяют определить разности энер гий между конформациями. Эти методы рассмотрены ниже. Качественные исследования обсуждаются в главах, посвя щенных отдельным методам.
Методы, основанные на выделении компонентов
Рассмотрим два диастереомера А и В. Если они при ведены в состояние равновесия и разделяются без нару шения равновесия, константу равновесия можно опреде лить из отношения концентраций этих компонентов, и следовательно, разность свободных энергий между ними