Добавил:
Upload Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

Биохимия растений

.pdf
Скачиваний:
728
Добавлен:
17.05.2015
Размер:
8.33 Mб
Скачать

энергии в окружающую среду или, наоборот, поглощение энер˝гии из окружающей среды, в результате чего будет происходить ˝изменение внутренней энергии биохимической системы. В том случае, когда система выделяет определенное количество энер-

гии в окружающую среду, общий запас ее внутренней энергии˝ уменьшается, а при поглощении энергии из окружающей сре-

ды — увеличивается.

Изменение внутренней энергии системы происходит в соотв˝ет-

ствии с первым законом термодинамики законом сохранения энергии, который для открытых систем можно сформулировать следу-˝

ющим образом: при любом процессе сумма внутренней энергии˝

системы и энергии окружающей среды остается величиной по˝стоянной. Исходя из этого, изменение внутренней энергии сист˝емы

равно алгебраической сумме всех энергий, уходящих из сист˝емы в

окружающую среду и входящих в нее из окружающей среды.

Общий запас внутренней энергии биохимической системы за˝-

висит от ее состава, массы, потенциальной и кинетической э˝нергии молекул, атомов и частиц, входящих в состав системы, внут-

римолекулярной, внутриядерной и гравитационной энергии˝, тер-

модинамических параметров (температуры, давления, объема˝), а

также обмена веществами и энергией с окружающей средой. В˝ме-

сте с тем внутренняя энергия системы является функцией ее˝ состояния. В процессе биохимических превращений система пе˝ре-

ходит из одного термодинамического состояния в другое, пр˝и

этом изменение внутренней энергии системы не зависит от п˝ути

перехода, а определяется разностью между конечным (U2) è íà-

чальным состоянием (U1) и поэтому можно записать U = U2 U1. И каким бы путем ни осуществлялся переход системы от сост˝ояния U1 к состоянию U2, через ряд промежуточных стадий или в

результате прямого превращения, согласно первому закону˝ термодинамики величина U не изменяется.

Это важное положение применяется в биохимической энерге˝- тике для оценки энергетических изменений в ходе биологич˝еско-

го окисления веществ, которое осуществляется в клетках организ-

мов постепенно, проходя множество промежуточных стадий. О˝д- нако суммарный энергетический эффект окисления в этих пр˝о- цессах равен количеству энергии, которое выделяется при сгорании органических веществ. Поэтому, сопоставляя тепл˝оту

сгорания исходных веществ и продуктов, образующихся при б˝ио-

логическом окислении кислородом, можно с достаточно высо˝кой точностью определять энергетические изменения в ходе ук˝азанных биохимических реакций.

С помощью термодинамических расчетов и в специальных экс˝-

периментах доказано, что если в процессе горения вещества˝ сис-

тема не совершает никакой работы, то по количеству выдели˝в-

151

шейся теплоты можно судить об изменении внутренней энерг˝ии системы, так как в таком процессе U = Q. В связи с этим для многих органических соединений, являющихся продуктами б˝иохимических реакций, определена теплота сгорания (табл. 7.1)˝, ко-

торая представляет собой термохимический показатель, вы˝ражающий количество теплоты при полном сгорании 1 моля веществ˝а с

образованием высших оксидов.

7.1. Теплота сгорания некоторых биохимических продуктов (кД˝ж · моль–1)

Биохимический

продукт

Теплота

 

Биохимический продукт

Теплота

сгорания

 

сгорания

 

 

 

 

Щавелевая кислота

 

252

 

Глутаровая кислота

2154

Молочная кислота

 

1364

 

Янтарная кислота

1492

Глюкоза

 

2872

 

Пальмитиновая кислота

10038

Фруктоза

 

2827

 

Олеиновая кислота

11117

Сахароза

 

5661

 

Стеариновая кислота

11346

Мальтоза

 

5649

 

Индол

4277

Глицерин

 

1663

 

Салициловая кислота

3025

Этанол

 

1371

 

Аланин

1634

Уксусная кислота

 

876

 

Глицин

979

Пировиноградная

 

1144

 

Валериановая кислота

2852

кислота

 

 

 

Ванилин

3825

7.2. ТЕПЛОВЫЕ ЭФФЕКТЫ БИОХИМИЧЕСКИХ РЕАКЦИЙ

Âбольшинстве биохимических систем реакции проходят при˝

постоянном давлении, поэтому их тепловые эффекты определ˝я- ются изменением термодинамической функции, называемой энтальпией: Q = Í. Поскольку энтальпия является функцией, ха-

рактеризующей термодинамическое состояние системы, вел˝ичина

изменения этой функции не зависит от путей перехода систе˝мы от начального к конечному состоянию или последовательност˝и биохимических реакций, а определяется как разность между ее ˝конеч- ным и начальным состоянием: Í = Í2 Í1.

Âходе эндотермической реакции происходит поглощение те˝п-

лоты (из окружающей среды), в результате чего энтальпия системы увеличивается, и тогда изменение энтальпии будет величин˝ой положительной ( Í > 0). В экзотермической реакции тепловая энер-

гия выделяется в окружающую среду, поэтому энтальпия в хо˝де

такой реакции уменьшается, а изменение энтальпии станови˝тся

отрицательной величиной ( Í < 0). Для многих биохимических

продуктов определены стандартные энтальпии образования˝, которые численно равны изменению энтальпии в реакции образов˝а-

152

ния 1 моля конкретного химического соединения из элементо˝в или простых веществ при стандартных термодинамических у˝словиях. Некоторые из этих показателей приведены в таблице 7.2.˝

7.2. Стандартные энтальпии образования ( Í°) и стандартные энтропии (S°) некоторых биохимических продуктов

Биохимический продукт

H °, êÄæ · ìîëü–1

S°, Äæ · ìîëü–1 · K–1

Í2О (жидкость)

–286

70

ÑÎ2 (ãàç)

–394

214

NH3 (ãàç)

–46

193

Муравьиная кислота

–377

251

Уксусная кислота

–487

160

α-D-Глюкоза

–1247

212

β-D-Глюкоза

–1268

228

Сахароза

–2224

360

Глицерин

–670

204

D,L-Глицин

–531

109

D,L-Аланин

–566

132

L-Аспарагиновая кислота

—978

174

L-Аспарагин

–793

175

L-Глутаминовая кислота

–1010

191

Бензойная кислота

–385

168

Щавелевая кислота

–827

120

Этиловый спирт

–278

161

Пропанол

–660

318

Изопропанол

–261

307

Зная стандартные энтальпии образования реагирующих ве-

ществ и продуктов реакции, можно, не прибегая к измерениям˝, расчетным путем определить тепловой эффект любой биохим˝и- ческой реакции, который численно равен изменению энтальп˝ии в ходе данного превращения. В соответствии с законом Гесса ˝изменение энтальпии в ходе реакции при стандартных условиях р˝авно

разности между суммой стандартных энтальпий образовани˝я про-

дуктов реакции и суммой стандартных энтальпий образован˝ия реагирующих веществ с учетом коэффициентов в уравнении реа˝к- ции:

Í°реакции = Σ Í°продуктов Σ Í°реагентов.

Для реакции xA + yB nC + kD изменение энтальпии можно рассчитать по формуле

Í°

= (n H° + k H° ) – (x H° + y H°).

реакции

C

D

A

B

153

В качестве примера рассмотрим реакцию синтеза аспарагин˝а из аспарагиновой кислоты и аммиака:

Hреакции°

= ( Hаспарагина°

+

HÍ°

Î ) – ( Hàñï.°

ê-û +

HNH°

) =

 

 

 

2

 

 

3

 

= (–793– 286) – (–978– 46) = – 1079 + 1024 = – 55 êÄæ.

Поскольку изменение энтальпии при синтезе аспарагина из˝ аспарагиновой кислоты имеет отрицательное значение, то это˝ —ýê- зотермическая реакция, в ходе которой выделяется тепловая энер-

гия (55 кДж в расчете на каждый моль синтезируемого аспараг˝ина

при стандартных условиях).

В соответствии с законом Гесса тепловой эффект реакции мо˝ж- но также определить по теплоте сгорания реагирующих веще˝ств и

продуктов реакции. Особенно это важно для тех процессов, в˝ ко-

торых участвуют биохимические компоненты с неизвестной˝ вели-

чиной стандартной энтальпии образования. Тепловой эффек˝т та-

кой реакции будет равен разности между суммарным значени˝ем теплоты сгорания реагирующих веществ и суммой теплоты сг˝ора-

ния продуктов реакции (с учетом коэффициентов в уравнени˝и ре-

акции).

7.3. ТЕРМОДИНАМИЧЕСКИЕ КРИТЕРИИ НАПРАВЛЕННОСТИ БИОХИМИЧЕСКИХ ПРЕВРАЩЕНИЙ

Биохимические процессы в организме происходят самопрои˝з- вольно в определенном направлении, обеспечивающем его но˝р- мальную жизнедеятельность. Изменения энтальпии или внутренней энергии системы, происходящие в соответствии с первым˝ за-

коном термодинамики, позволяют количественно определит˝ь теп-

ловой эффект реакции, превращения различных форм энергии˝, параметры обмена биохимических систем веществом и энерг˝ией с окружающей средой, но эти термодинамические функции не мо˝- гут служить критериями, определяющими направление реакц˝ий,

возможность их самопроизвольного осуществления. Они так˝же не позволяют оценить, какое количество энергии должна получ˝ить

биохимическая система для того, чтобы в ней инициировалос˝ь самопроизвольное превращение. Согласно второму закону тер˝моди-

намики таким критерием является термодинамическая функ˝ция,

получившая название энтропии.

154

Энтропия выражает отношение изменения тепловой энергии в ходе реакции или процесса к температуре. Она служит показ˝ателем термодинамического состояния системы, и ее изменение˝ не зависит от пути биохимического превращения, а определяет˝ся как

разность между конечным и начальным состоянием системы. Д˝ля изотермических процессов (проходят при постоянной темпе˝рату-

ре), которые характерны для биохимических систем, изменен˝ие энтропии определяется соотношением

S = S

2

– S = Q

,

 

1

T

 

 

 

 

 

ãäå Q — количество теплоты, выделяемое или поглощаемое системой в ходе процесса.

Для многих органических и неорганических веществ рассчи˝та-

ны значения энтропии при стандартных условиях, которые вы˝ра-

жаются в джоулях в расчете на 1 моль вещества и на 1 К (кель-

вин — единица абсолютной термодинамической температур˝ной шкалы). Некоторые из этих величин приведены в таблице 7.3. Ис-˝

пользуя стандартные энтропии химических соединений, мож˝но

рассчитать изменение энтропии в ходе биохимической реак˝ции,

которое равно разности стандартных энтропий продуктов р˝еакции

и реагирующих веществ (с учетом коэффициентов в уравнени˝и реакции):

S°реакции = ΣS°продуктов ΣS°реагентов.

Энтропия характеризует ту часть энергии системы, которую˝

невозможно превратить в работу или использовать для синт˝еза веществ в организме. При любом самопроизвольном процессе ко˝ли- чество такой энергии увеличивается и, когда оно достигает˝ максимума, способность системы к самопроизвольным превращени˝ям утрачивается. Таким образом, чем меньше энтропия, тем боль˝шей

способностью к самопроизвольному процессу обладает сис˝тема. При самопроизвольных процессах в закрытых системах энтр˝опия

возрастает, и поэтому изменение энтропии будет величиной˝ положительной ( S > 0).

Живые организмы состоят из функционирующих в них различ-

ных открытых биохимических систем. В результате обмена эн˝ер-

гией с окружающей средой при самопроизвольном процессе э˝нт-

ропия этих систем может уменьшаться, а энтропия окружающе˝й среды возрастает до такого уровня, при котором суммарное ˝изменение энтропии системы и окружающей среды остается велич˝и-

ной положительной, т. е. общее изменение энтропии в систе˝ме и

155

окружающей среде при самопроизвольном процессе выражае˝тся в виде следующего неравенства:

S°процесса = Σ S°системы + Σ S°среды > 0.

В полной мере такое неравенство можно продемонстрироват˝ь

на примере целого функционирующего организма. В процессе˝ роста и развития организма его энтропия уменьшается, а энтр˝опия окружающей среды увеличивается. При этом возрастает спос˝обность организма к самопроизвольным биохимическим превр˝ащениям.

Исходя из указанного неравенства, для оценки возможности˝ и направления самопроизвольного превращения в биохимичес˝кой системе необходимо определить изменение энтропии как в с˝истеме, так и в окружающей среде. Однако рассчитать изменение э˝нт-

ропии в окружающей среде практически невозможно, поэтому˝ в термодинамических расчетах для биохимических систем об˝ычно определяют величину изменения энтропии только в системе˝ и используют этот показатель для оценки другой термодинамич˝еской функции — свободной энергии.

Свободная энергия — это часть общей энергии системы, которая

может быть использована для выполнения работы, а в живом организме — для синтеза жизненно необходимых веществ, с˝оздания электрохимического потенциала в клеточных мембрана˝х, переноса веществ и ионов против градиента концентрации и т. д.

Она является функцией состояния системы, поэтому ее измен˝е- ние, как и энтропии, а также энтальпии, не зависит от того, ка˝-

ким путем происходит переход системы от одного состояния˝ к другому.

Если термодинамические параметры системы оценивают при˝ постоянном давлении и температуре, характерном для живых˝ организмов, то указанную термодинамическую функцию назы˝ва-

þò свободной энергией Гиббса. Изменение этой функции в изобар-

но-изотермическом процессе связано с изменением энтальп˝ии и энтропии в виде следующего уравнения: G = H T S. Экспериментально и теоретически установлено, что при самопрои˝з- вольных (спонтанных) процессах, происходящих в организма˝х, свободная энергия системы уменьшается, в связи с чем измене-

ние свободной энергии в ходе такого процесса будет величи˝ной

отрицательной. Если, например, система самопроизвольно переходит из состояния, характеризующегося запасом свободной

энергии G1, в другое состояние с запасом свободной энергии G2,

òî G2 будет меньше G1, в связи с чем изменение свободной энер-

156

гии будет равно G = G2 G1 < 0 (при постоянных температуре и давлении).

Таким образом, в данных условиях изменение свободной энер˝-

гии является критерием самопроизвольности процесса: при˝ отри-

цательном значении изменения свободной энергии ( G < 0) система способна к спонтанному биохимическому превращению˝, а

åñëè G > 0, то самопроизвольный ход превращения в системе не-

возможен. В этом случае положительное значение изменения˝ свободной энергии показывает, какое количество свободной эн˝ергии

должно поступить в систему для самопроизвольного осущес˝твле-

ния данной биохимической реакции или данного процесса. Кр˝оме

того, отрицательное значение изменения свободной энерги˝и по-

казывает, какое количество свободной энергии выделяется˝ в ходе процесса и поступает в окружающую среду или переходит к д˝ру-

гой биохимической системе.

Следует также отметить, что в биоэнергетических системах˝ из-

менение свободной энергии, как правило, не равно нулю, что н˝а-

блюдается при наступлении термодинамического равновеси˝я. Однако биохимические системы в ходе превращений веществ по˝чти

никогда не достигают истинного химического равновесия. Д˝ля

них характерны так называемые стационарные состояния, ко˝гда

поддерживаются определенные скорости притока веществ и˝ энер-

гии в систему и их оттока из системы, так как образующиеся в ходе реакции продукты не накапливаются, а подвергаются да˝ль-

нейшим превращениям. При достижении стационарного состо˝я-

ния обеспечиваются максимальные скорости биохимических˝ пре-

вращений, которые сопровождаются также значительным уме˝нь-

шением или увеличением свободной энергии.

Биохимические реакции, в ходе которых свободная энергия с˝и- стемы уменьшается ( G < 0), принято называть экзергоническими, à

реакции, при которых свободная энергия в системе возраста˝ет

( G > 0), — эндергоническими. Экзергонические реакции происходят самопроизвольно и сопровождаются переходом системы˝ на более низкий энергетический уровень в результате выделе˝ния свободной энергии. Эндергонические реакции могут происходи˝ть са-

мопроизвольно только при условии притока необходимой дл˝я их

осуществления свободной энергии из окружающей среды или˝ другой биохимической системы, в которой происходит экзергон˝ическая реакция.

С целью проведения термодинамических расчетов определе˝- ны стандартные свободные энергии образования многих хим˝и-

ческих веществ, включая и важнейшие биохимические продук˝-

ты, из химических элементов или простых веществ при станд˝арт-

ных условиях. Некоторые из этих показателей представлены˝ в

таблице 7.3.

157

7.3. Стандартные свободные энергии образования некоторых б˝иохимических продуктов

Биохимический продукт

G°,

 

Биохимический продукт

,

êÄæ · ìîëü–1

 

êÄæ · ìîëü–1

 

 

 

Уксусная кислота

–393

Глицерин

–477

Этиловый спирт

–175

Муравьиная кислота

–350

Щавелевая кислота

–698

Фумаровая кислота

–654

Аммиак

–17

Масляная кислота

–377

Диоксид углерода

–394

Бензойная кислота

–245

Âîäà

–237

Сахароза

–1545

Гидрохинон

–217

Глицин

–367

Бутанол

–161

Мочевина

–197

Пропанол

–470

Изопропанол

–164

Зная стандартные свободные энергии образования химичес˝ких веществ, можно рассчитать изменение свободной энергии в л˝ю-

бой реакции, происходящей в стандартных условиях. Оно рав˝но

разности суммарных изменений свободной энергии продукт˝ов ре-

акции и реагирующих веществ (с учетом коэффициентов в ура˝вне-

нии реакции):

G°реакции = Σ G°продуктов Σ G°реагентов.

Если хотя бы для одного из реагирующих веществ или продук˝- тов реакции нет сведений о стандартной свободной энергии˝ обра-

зования, изменение свободной энергии в ходе биохимическо˝го

превращения рассчитывают другим способом, который завис˝ит от

того, какие имеются данные о компонентах биохимической си˝сте-

мы. Довольно часто для определения G° используют сведения о стандартных энтальпиях образования и стандартных энтро˝пиях

химических веществ. На основе этих данных изменение свобо˝д- ной энергии рассчитывают по формуле

G°реакции = H°реакцииÒ S°реакции,

ãäå Í°реакции = Σ Í°продуктов Σ Í°реагентов; Ò — стандартное значение температуры

(298,16 Ê); S°реакции = ΣS°продуктов ΣS°реагентов.

Если известна константа равновесия биохимической реакц˝ии, то расчет изменения свободной энергии в этой реакции при ˝стандартных условиях очень легко выполнить в соответствии с у˝равнением

G°= – ln Êð,

ãäå G°— изменение стандартной свободной энергии при р Н7; R — универсальная газовая постоянная (8,314 Дж · моль–1 · Ê–1); Ò — стандартная температура (298,16 К); Кð — константа равновесия биохимической реакции при рН 7 и ˝посто-

янном давлении.

158

Как следует из указанного уравнения, при значениях конста˝н- ты равновесия химической реакции больше единицы (Кð > 1) ln Êð будет величиной положительной, а изменение свободной энергии в ходе реакции согласно уравнению отрицательно

( G°< 0). А если константа равновесия реакции меньше единицы (Кð < 1), то в этом случае ln Кð имеет отрицательное значение,

à G°становится величиной положительной, что является показателем эндергонического превращения.

Константу равновесия химической реакции можно рассчита˝ть,

если известны равновесные концентрации реагирующих вещ˝еств и продуктов реакции. В соответствии с законом действующих˝ масс

эта константа выражается как отношение произведения рав˝новесных концентраций продуктов реакции к произведению равно˝вес-

ных концентраций реагирующих веществ, у которых показате˝ли степени равны стехиометрическим коэффициентам в уравне˝нии

реакции. Для химической реакции õÀ + óΒ → + rD константа

равновесия будет равна:

=[C]n ·[D]r

Êð [A]x ·[B]y .

Ñучетом более строгого соответствия указанных расчетов˝ зако-

ну действующих масс необходимо вместо концентраций ввес˝ти активности реагирующих веществ и продуктов реакции. Одна˝ко физиологические растворы в клетках организмов довольно˝ сильно

разбавлены и растворенные в них химические вещества имею˝т сравнительно низкие концентрации, которые по своей велич˝ине очень мало отличаются от активностей, поэтому при расчете˝ констант равновесия биохимических реакций поправки на акти˝вность

обычно не вводят. К тому же для многих биохимических проду˝к- тов их активности в физиологической среде пока точно не у˝ста-

новлены.

Важную роль в организмах играют окислительно-восстанови˝- тельные реакции, в которых происходит перенос электронов˝ от вещества-донора к веществу-акцептору. В зависимости от ти˝па ре-

акции и природы фермента-переносчика осуществляется пер˝енос

одного или пары электронов и одновременно с электронами в˝озможен также перенос протонов (Н+). В результате переноса электронов изменяются электрические заряды донора и акцептор˝а электронов и их окислительно-восстановительные потенци˝алы.

По величине окислительно-восстановительных потенциалов˝ определяют направленность и возможность самопроизвольн˝ого осуществления биохимических реакций, происходящих в жив˝ых

организмах. Донором электронов служит биохимическая сис˝тема,

имеющая наименьший окислительно-восстановительный поте˝н-

циал (наиболее отрицательный), а конечным акцептором элек˝тро-

159

нов — система с наибольшим окислительно-восстановитель˝ным потенциалом (имеющим менее отрицательное или наибольшее˝ положительное значение). В цепи переносчиков перенос эле˝ктронов осуществляется от окислительно-восстановительной с˝истемы

с отрицательным потенциалом к системе с менее отрицатель˝ным или положительным потенциалом, т. е. электроны с помощью пе˝-

реносчиков передаются от одной окислительно-восстанови˝тель- ной системы к другой в направлении возрастания окислител˝ьно-

восстановительного потенциала.

Для сравнения окислительно-восстановительных потенциал˝ов

различных биохимических систем используют стандартные ˝окис-

лительно-восстановительные потенциалы, которые определ˝яют по сравнению с нормальным водородным электродом в станда˝рт-

ных термодинамических условиях. Учитывая, что окислитель˝но-

восстановительные потенциалы зависят от состояния иони˝зации

реагирующих веществ и образующихся продуктов, которая в з˝начи-

тельной степени определяется концентрацией катионов во˝дорода (Н+), стандартные окислительно-восстановительные потенциал˝ы

биохимических систем определяют при рН 7 и обозначают сим˝во-

ëîì Å°. Значения стандартных окислительно-восстановительных

потенциалов наиболее важных биохимических систем предс˝тавле-

ны в таблице 7.4. Из этих данных можно заключить, что они нахо-˝ дятся в интервале между значениями потенциалов водородн˝ого и

кислородного электродов (от –0,42 до 0,82 В при рН 7).

7.4. Стандартные окислительно-восстановительные потенциал˝ы некоторых биохимических окислительно-восстановительных систем

Восстановленная форма

 

 

 

Окисленная форма

Å°, Â

Ферредоксин (Fe2+)

Ферредоксин (Fe3+)

–0,43

ÍÀÄ · Í + Í+

ÍÀÄ+

 

–0,32

ÍÀÄÔ · Í + Í+

ÍÀÄÔ+

 

–0,32

Липоевая кислота (восстановленная)

Липоевая кислота (окисленная)

–0,29

Глютатион (восстановленный)

Глютатион (окисленный)

–0,23

ÔÀÄ · Í2

ÔÀÄ

 

–0,05

Кофермент Q · H2

Кофермент Q

(Fe3+)

+0,07

Цитохром b (Fe2+)

Цитохром b

+0,08

560

 

 

 

560

 

 

Пластохинон (восстановленный)

Пластохинон (окисленный) ÐQ

+0,1

ÐQ · Í2

Цитохром c (Fe3+)

 

Цитохром ñ (Fe2+)

+0,24

Цитохром a (Fe2+)

Цитохром à (Fe3+)

+0,21

Цитохром à3 (Fe2+)

Цитохром à3 (Fe3+)

+0,39

Реакционный центр фотосистемы I

Ï700 (окисленный)

+0,45

Ï700 (восстановленный)

 

 

 

 

 

 

Реакционный центр фотосистемы II

Ï680 (окисленный)

+1,12

Ï680 (восстановленный)

 

 

 

+ + 2å

 

 

Водородный электрод

 

H

 

–0,42

 

2

 

 

 

Кислородный электрод

1 /

Î +2Í+ +

2å Í Î

+0,82

 

 

 

2

2

2

 

160