Биохимия растений
.pdfлитического центра этих ферментов входит гем. Действие пе˝роксидазы можно представить в виде следующей реакции:
Субстрат—Н2 + Í2Î2 → Окисленный субстрат + 2Н2Î
Пероксидазы катализируют окисление пероксидом водорода˝
фенольных соединений, жирных кислот, терпенов, восстановл˝енного глютатиона. По сходному с пероксидазой механизму дей˝-
ствует фермент каталаза (1.11.1.6), катализирующий разложение
пероксида водорода на кислород и воду. Каталазы представл˝яют
собой тетрамерные белки с молекулярной массой около 250 000,
имеющие в качестве кофермента гем и проявляющие очень выс˝о- кую каталитическую активность (2 · 105 кат в расчете на 1 моль ка-
талитических центров). Этот фермент осуществляет защиту ˝тка-
ней организма от повреждающего действия пероксида водор˝ода.
Катализаторы переноса электронов. К ферментам — переносчи-
кам электронов относятся цитохромы, включающие в качестве коферментов гемы, железосерные белки, а также ферменты, соде˝р-
жащие атомы металлов. Способность к переносу электронов у˝
этих ферментных белков определяется тем, что имеющиеся в ˝их
составе атомы металлов могут обратимо изменять степень о˝кисле-
íèÿ (ñì. ñ. 189—191).
Чаще всего цитохромы акцептируют электроны от флавопрот˝е-
идов или хинонов, а передают их на металлопротеиды или кис˝ло-
род. В результате соединения гемов со специфическими белк˝ами
возникают ферментные молекулы, обладающие разными окисл˝и-
тельно-восстановительными потенциалами, благодаря чему˝ из цитохромов формируются цепи переноса электронов. Передача˝ электронов по цепи переносчиков происходит от цитохрома˝, име-
ющего меньший окислительно-восстановительный потенциал˝, цитохрому с большим потенциалом.
Наиболее хорошо изучена цитохромная система дыхательно˝й цепи переноса электронов. Она включает шесть цитохромов (˝b556, b560, c1, c, à è à3), способных последовательно от одного другому
передавать один электрон. Донором электронов для передач˝и в цитохромную систему служит восстановленный кофермент Q
(ÊîQ · Í2).
Цитохромы b556, b560 è ñ1 объединены в единый ферментный
комплекс, входящий в состав внутренней мембраны митохонд˝рий.
В составе цитохрома ñ1 кроме гема имеется еще один реакционный центр, включающий железосерный кластер 2Fе2S. Цитохромы à è à3 также образуют мембраносвязанный ферментный комп-
лекс, называемый цитохромоксидазой. В реакционных центрах ци-
тохромоксидазного комплекса содержатся два атома меди, к˝ото-
рые совместно с гемовыми группировками цитохромов à è à3
241
участвуют в связывании кислорода и передаче электронов н˝а атомы кислорода. Для ионизации одного атома кислорода необхо˝димо, чтобы по цитохромной системе от восстановленного кофе˝р- мента Q переносилось два электрона, при этом кофермент Q пер˝е-
ходит в окисленную форму, а в физиологическую среду (матри˝кс) митохондрий переходят два катиона водорода (2Н+). Приняв
электроны от цитохрома à3, кислород ионизируется и очень активно реагирует с катионами водорода, образуя молекулы во˝ды:
1 /2Î2 + 2å + 2Í+ ¾¾® Í2Î
От ферментного комплекса цитохромов b è ñ1 перенос электро-
нов на цитохромоксидазу осуществляет цитохром ñ, представляю-
щий собой водорастворимый белок, который способен переме˝- щаться в жидкой физиологической среде на поверхности мит˝о-
хондриальной мембраны. Перенос электронов по цитохромно˝й
системе, образующей цепь дыхательных ферментов митохонд˝рии,
можно представить в виде следующей схемы:
В одном из звеньев электронтранспортной цепи хлоропласт˝-
ных мембран функционирует комплекс цитохромов b6—f, êîòî-
рый осуществляет перенос электронов от пластохинона, явл˝яющегося структурным аналогом убихинона, на водорастворимый˝ белок пластоцианин, содержащий в активном центре атомы меди˝.
Цитохромы в качестве переносчиков электронов также вход˝ят в
состав целого ряда окислительно-восстановительных ферм˝ентов.
Нитратредуктаза растений содержит цитохром b557, оксигеназа жирных кислот и сульфитоксигеназа — цитохром b5, гидроксилазы стеролов — цитохром Ð-450, лактатдегидрогеназа дрожжей — цитохром b2.
Кроме цитохромов в системах переноса электронов важную
роль играют железосерные белки, строение и механизм дейст˝вия которых были представлены ранее (с. 192—193). Такие белки име-
ются в электронтранспортных цепях хлоропластов и митохо˝ндрий
(растительные и животные ферредоксины, белок Риске), клето˝к микроорганизмов (бактериальные ферредоксины и рубредок˝си-
ны), а также в составе ферментного комплекса нитрогеназы (˝азо-
ферредоксин), катализирующего восстановление молекуляр˝ного
242
азота (N2) до аммонийной формы у азотфиксирующих микроорганизмов.
Большую группу ферментов, осуществляющих перенос электронов, составляют металлопротеиды, которые представляют˝ собой
белки, имеющие в активном центре атомы металлов (Cu, Mn, Mo, Se и др.). Так, в электронтранспортной цепи хлоропластов пере˝-
нос электронов от фотосистемы II к фотосистеме I выполняет в˝о- дорастворимый медьсодержащий белок пластоцианин, спосо˝бный
передавать один электрон. В составе фермента нитратредук˝тазы,
катализирующей восстановление нитрата до нитрита, имеют˝ся
атомы молибдена, участвующие в переносе электронов от нит˝рат-
редуктазы на азот нитрата.
Очень часто в системах транспорта электронов принимают у˝ча-
стие сложные ферментные комплексы, включающие одновреме˝н-
но гемы и атомы металлов (например, рассмотренная ранее ци˝-
тохромоксидаза) или железосерные белки, содержащие атомы˝
металлов. Типичным представителем таких ферментов можно считать молибдоферредоксин нитрогеназного комплекса аз˝отфик-
сирующих микроорганизмов. Он содержит FeS-кластеры и атомы
молибдена, с участием которых происходит перенос электро˝нов
на атомы молекулярного азота (N2), в результате чего последние
ионизируются и присоединяют катионы водорода, превращая˝сь в аммонийную форму азота.
8.8.2.ТРАНСФЕРАЗЫ
Âобмене веществ организмов важную роль играют ферменты, катализирующие перенос группировок от одной молекулы на˝ дру-
гую, при этом возможен синтез новых веществ. Реакции перен˝оса
групп происходят также и в ходе распада и превращений хим˝ичес-
ких веществ в процессе жизнедеятельности организмов. В за˝висимости от природы переносимых групп трансферазы подразде˝ляют на восемь подклассов, а в каждом подклассе проводится дел˝ение на подподклассы на основе уточнения функциональных свой˝ств
переносимой в ходе реакции группировки. Так, к первому под˝-
классу трансфераз относятся ферменты, катализирующие пе˝ренос одноуглеродных остатков: метилтрансферазы (2.1.1), переносящие метильные группы; карбоксилтрансферазы (2.1.3), осуществляющие перенос карбоксильных групп; формилтрансферазы (2.1.2),
катализирующие перенос формильных группировок и др. Ферменты, катализирующие перенос одноуглеродных остат-
ков, имеют коферменты в виде производных тетрагидрофолие˝вой
кислоты, которая синтезируется из витамина фолиевой кисл˝оты
под действием фермента дигидрофолатредуктазы. Донором водорода служат восстановленные динуклеотиды НАДФ · Н:
243
Как доноры одноуглеродных остатков наиболее важное биол˝о-
гическое значение имеют метилентетрагидрофолиевая кисл˝ота, 5-метилтетрагидрофолиевая кислота, 5,10-метенилтетрагидроф˝о-
лиевая кислота и 10-формилтетрагидрофолиевая кислота. Эти˝ ко-
ферментные формы тетрагидрофолиевой кислоты принимают
участие в реакциях метилирования и формилирования различных
субстратов, синтезе метионина, серина и пуриновых нуклеот˝идов, модификации молекул белков и нуклеиновых кислот.
244
Довольно хорошо изучена реакция переноса метильной груп˝пы в процессе синтеза аминокислоты метионина. Донором метил˝ь- ной группы в этой реакции служит 5-метилтетрагидрофолиева˝я кислота, а акцептором — гомоцистеин:
Образовавшийся в этой реакции метионин используется в си˝н-
тезе белков или, соединяясь с аденозином, превращается в S-аде-
нозилметионин, который является активным донором метиль˝ных
групп в различных реакциях трансметилирования.
245
Характерным примером реакции трансметилирования с учас˝-
тием S-аденозилметионина в качестве донора метильных груп˝п
может служить метилирование никотинамида:
К важнейшим трансферазам растений относятся ферменты, ка˝-
тализирующие перенос альдегидных, кетонных, аминных и фос˝- фатных групп, ацильных и гликозильных остатков, а также гр˝уп-
пировки КоА.
Транскетолаза (2.2.1.1) — фермент, катализирующий перенос
остатков гликолевого альдегида от кетозы на альдозу с образованием новых кетозы и альдозы. Такая реакция, например, проис˝ходит в процессе фотосинтеза:
246
Транскетолаза имеет в качестве кофермента тиаминпирофо˝с- фат. Она играет важную роль в процессах превращения кетоз˝ и альдоз, происходящих при фотосинтезе и пентозофосфатном˝ пути окисления углеводов.
Трансальдолаза (2.2.1.2) является еще одним ферментом, содержащим в активном центре тиаминпирофосфат. Она катализиру˝ет
перенос остатка диоксиацетона от кетозы на альдозу с обра˝зованием новой альдозы и новой кетозы. Причем трансальдолаза ˝дей-
ствует практически на те же субстраты, которые превращают˝ся с
участием транскетолазы. Так, например, на одном из этапов п˝ен-
тозофосфатного пути окисления глюкозы под действием
трансальдолазы происходит перенос остатка диоксиацетон˝а от се- догептулозо-7-фосфата на 3-фосфоглицериновый альдегид, в ре˝-
зультате образуются новые моносахаридные производные —˝ фрук-
тозо-6-фосфат и эритрозо-4-фосфат:
А ц и л т р а н с ф е р а з ы переносят остатки карбоновых кислот. Они имеют в каталитическом центре активную группиров˝ку в
виде кофермента А, к которой присоединяется карбоновая ки˝сло-
та (см. с. 196), при этом образуется ацил-КоА производное, способное далее быть донором ацильного остатка.
Глицеролфосфатацилтрансфераза (2.3.1.15) в процессе синтеза жиров осуществляет перенос остатков жирных кислот, связа˝нных
с КоА, на глицерол-3-фосфат с образованием фосфатидной кис-
ëîòû:
247
Ацилтрансферазы катализируют перенос ацильных остатков в процессе синтеза жирных кислот, ацилглицеринов, фосфолип˝и- дов, различных сложных эфиров (ацетилхолин и др.), фенольны˝х соединений, терпенов.
Г л и к о з и л т р а н с ф е р а з ы переносят остатки моносахаридов в ходе синтеза олиго- и полисахаридов, а также глик˝ози-
äîâ. Сахарозоглюкозилтрансфераза (2.4.1.7) — типичный предста-
витель таких ферментов, катализирующая образование глюк˝озо-1-
фосфата из сахарозы и ортофосфата:
В этой реакции фермент осуществляет перенос остатка глюк˝о-
зы от молекулы сахарозы на ортофосфат. На первой стадии ре˝ак-
ции происходит образование промежуточного соединения ф˝ермента с глюкозой — глюкозилфермента, так как данная тран˝сфе-
раза обладает сильным сродством к глюкозе. Вторая стадия ˝реак-
ции связана с тем, что фосфатная группа, вытесняя фермент, образует более устойчивое соединение с глюкозой — глюк˝озо-1-
фосфат.
Сахарозо-УДФ-глюкозилтрансфераза (2.4.1.13) катализирует синтез сахарозы в нефотосинтезирующих органах растений˝ (корнеплодах, клубнях, зародышах семян и др.). Под действием это˝го фермента активированный остаток глюкозы, связанный с ури˝дин-
дифосфатом (УДФ), переносится на фруктозу с образованием д˝и-
сахарида сахарозы:
248
Данная реакция обратима, и при повышении концентрации
УДФ с участием одного и того же фермента может происходит˝ь
расщепление молекул сахарозы с образованием исходных су˝бстра-
тов. В связи с тем что в реакции синтеза сахарозы под действ˝ием
фермента осуществляется перенос остатков глюкозы, этот ф˝ермент называют глюкозилтрансферазой. Однако во многих реа˝кци-
ях синтеза углеводов переносу подвергаются остатки друг˝их моно-
сахаридов, связанных с разными нуклеозиддифосфатами, поэ˝тому
общее название таких ферментов переноса — гликозилтран˝сфера-
зы. Реакции переноса моносахаридных остатков играют такж˝е
важную роль в синтезе ряда гликозидов.
А м и н о т р а н с ф е р а з ы катализируют перенос амино-
группы от аминокислоты на кетокислоту в реакциях переами˝ни-
рования по следующей схеме:
Очень активным донором аминных групп для реакций пере-
аминирования служит глутаминовая кислота.
249
Аспартатаминотрансфераза (2.6.1.1) катализирует, например, взаимодействие глутаминовой и щавелевоуксусной кислот ˝в реакции переаминирования.
Аминотрансферазы имеют в каталитическом центре коферме˝нт
в виде фосфорилированного производного витамина В6 — пиридок-
сальфосфата. Механизм действия этих ферментов рассмотре˝н ра-
нее (см. с. 198—200). Они участвуют в реакциях синтеза и превра-
щений аминокислот у всех видов живых организмов. В этой гр˝уппе насчитывается более 50 ферментов.
Ф о с ф о т р а н с ф е р а з ы участвуют в переносе фосфатных
групп (—Н2ÐÎ3) от АТФ на различные органические субстраты, а
также от различных макроэргических фосфатов на АДФ в проц˝ес-
се синтеза АТФ. Очень часто фосфотрансферазы называют киназами.
Превращение многих веществ в организме начинается их акт˝и-
вированием путем фосфорилирования, и донором фосфатных
групп для этих реакций служат молекулы АТФ. Гексокиназа
(2.7.1.1) является одним из таких ферментов. Она катализирует синтез глюкозо-6-фосфата из глюкозы с участием АТФ:
Гексокиназа проявляет каталитическую активность только˝ в присутствии катионов Mg2+, которые образуют с АТФ комплексы, способные взаимодействовать с определенными группировк˝ами в
каталитическом центре фермента.
П р о т е и н к и н а з ы переносят фосфатные группы от АТФ
на гидроксильные группы остатков серина или треонина в мо˝ле-
кулах белков, в результате чего происходит их фосфорилиро˝вание:
250