- •Практикум по медицинской статистике Учебно - методическое пособие Санкт – Петербург 2012
- •1. Структура научно-медицинского исследования с применением медицинской статистики.
- •Практические задания
- •Упражнение № 3. Сравнение выборочных средних в двух группах с помощью t-критерия.
- •Упражнение № 4. Сравнение выборочных средних в двух группах
- •Приложения
- •2. Классическое Фрэмингхемское исследование.
- •3. Исследование гемограмм пациентов.
- •Диаграмма рассеяния
- •Средство Кисть
- •Диаграмма Вороного
- •Описательный (дескриптивный) анализ гемограмм
- •Описательные статистики по группам
- •Анализ выбросов
- •Корреляционный анализ
- •Корреляции Пирсона
- •Корреляции Спирмена и Кендалла
- •Исследование эффективности лечения: введение новой переменной
- •Цель дальнейшего исследования
- •Проверка гипотезы о нормальности для переменной Эффективность
- •Сравнение выборок
- •1) Какой метод лечения более эффективен?
- •2) Есть ли существенное различие состояний пациентов до и после лечения?
- •4. Диагностика остеопороза. Методика Всемирной Организации Здравоохранения:
- •Алгоритм вычисления z-скора (стандартного скора)
- •Алгоритм вычисления т-скора:
- •5. Частота рекомбинаций хромосом домашней мыши относительно некоторого признака.
- •1. Структура научно-медицинского исследования с применением медицинской статистики. 1
- •2. Классическое Фрэмингхемское исследование. 23
- •3. Исследование гемограмм пациентов. 26
- •4. Диагностика остеопороза. 54
- •5. Частота рекомбинаций хромосом домашней мыши относительно некоторого признака. 56
Диаграмма Вороного
Построим диаграмму Вороного по переменным Гемоглобин и Тромбоциты.
На диаграмме Вороного значения двух переменных X и Y изображаются, как на диаграмме рассеяния, а затем пространство между отдельными точками данных делится границами, окружающими каждую точку данных, на области по следующему принципу: каждая точка области находится ближе к заключенной внутри точке данных, чем к любой другой соседней точке данных.
! Выполните пример практического использования диаграммы Вороного.
Предположим, что на анализ поступил новый больной.
Для назначения лечения было бы полезно знать, какая гемограмма ему наиболее близка. Это можно сделать с помощью диаграммы Вороного.
Пусть в поступившей гемограмме указано значения: Тромбоциты = 220 и Гемоглобин = 105. Проведите на графике соответствующие прямые; точка пересечения прямых будет соответствовать новому пациенту.
Выявите наблюдение, которое является «хозяином» области, в которое попадает данное наблюдение.
37
Описательный (дескриптивный) анализ гемограмм
Вычислим описательные статистики для переменных, содержащих информацию о гемограммах.
Запуск модуля Основные статистики и таблицы.
Выберем пункт Описательные статистики. Нажмём OK.
Выбор переменных
На вкладке Дополнительно укажем интересующие нас статистики.
38
Нажав OK, получим таблицу с описательными статистиками.
Описательные статистики по группам
Достаточно часто возникает необходимость вычислить описательные статистики отдельно по каждой группе наблюдений.
Например, вычислим средние значения показателей гемограммы отдельно для каждой группы пациентов, а также для мужчин и для женщин.
В диалоге Основные статистики и таблицы выберем пункт Группировкаиоднофакторный ДА.
В окне Внутригрупповые статистикии корреляции перейдём на вкладку Списки таблиц.
39
Выберем группирующие переменные.
Выберем зависимые переменные.
Нажмём на кнопку OK в диалоге Внутригрупповые статистики и таблицы.
В рабочей книге STATISTICA появится таблица, содержащая таблицу средних по группам.
Анализ выбросов
Выбросами являются резко выделяющиеся наблюдения, например, пациенты с избыточным числом тромбоцитов.
Выявление выбросов осуществляется посредством построения двумерных диаграмм размаха.
Построим диаграмму размаха по переменной Тромбоциты.
Выберем в меню пункт Графики / 2M Графики / Диаграммы размаха.
В появившемся окне перейдём на вкладку Дополнительно.
40
Укажем переменные.
Пока что мы не будем указывать группирующую переменную.
Отметим, что на вкладке Дополнительно окна 2M Диаграмма размаха Вы можем настроить опции для выявления наблюдений – выбросов (например, можно указать Коэффициент выбросов).
Нажмём OK в диалоге 2M Диаграмма размаха.
41
На диаграмме размаха отмечены четыре выброса – три «слишком больших» значения и одно «слишком маленькое».
Визуально анализируя диаграмму размаха, Вы можете получить представление об изменчивости переменной.
Определим, какие именно наблюдения являются выбросами. Один из способов нам уже известен – можно построить диаграмму рассеяния для переменных Номер наблюдения и Тромбоциты и при помощи средства Кисть выделить нужные наблюдения.
Опишем другой способ. Расположим наблюдения по убыванию переменной Тромбоциты.
Для этого выберем из меню пункт Данные / Сортировка.
В появившемся окне укажем параметры Ключа 1.
42
После нажатия на кнопку OK наблюдения в исходной таблице данных будут расположены в порядке убывания переменной Тромбоциты.
Теперь мы можем определить, какие наблюдения являются выбросами – это будут первые три и последнее наблюдение в таблице. Например, «нестандартный» уровень тромбоцитов в крови выявлен у пациентов номер 71, 87, 79 и 97.
Теперь вновь вызовем диалог 2M Диаграмма размаха и зададим в окне Переменные в качестве группирующей переменной переменную Пол.
Отметим, что наблюдения – выбросы, отмеченные на этой диаграмме, отличаются от наблюдений - выбросов на диаграмме, построенной без разбиения на группы.
Например, значение Тромбоциты=300, являющее выбросом для наблюдений, рассмотренных вместе, оказывается «нормальным» при рассмотрении только группы женщин. Есть и примеры обратного: значение Тромбоциты = 73 оказывается выбросом для группы мужчин, но при рассмотрении всех наблюдений оно оказывается «нормальным».