- •Экология микроорганизмов
- •020209.65 «Микробиология»
- •Оглавление
- •Введение
- •Лабораторная работа №1 Углеводородокисляющие микроорганизмы, как естественная часть гетеротрофного бактериопланктона водных экосистем
- •Контрольные вопросы
- •Лабораторная работа №2 Эвтрофные и олиготрофные бактерии, как основные группы гетеротрофного бактериопланктона
- •Контрольные вопросы
- •Лабораторная работа №3 Оценка качества воды
- •Контрольные вопросы
- •Лабораторная работа №4 Микроорганизмы, обитающие в ризосфере и ризоплане растений
- •Контрольные вопросы
- •Лабораторная работа №5 Эпифитные микроорганизмы зерна
- •Контрольные вопросы
- •Лабораторная работа №6 Окисление жира микроорганизмами
- •Контрольные вопросы
- •Лабораторная работа №7 Разложение белковых веществ микроорганизмами
- •Контрольные вопросы
- •Лабораторная работа №8 Анаэробное разложение клетчатки микроорганизмами
- •Контрольные вопросы
- •Лабораторная работа №9 Денитрификация
- •Контрольные вопросы
- •Лабораторная работа №10 Изучение свободноживущих азотфиксирующих бактерий
- •Контрольные вопросы
- •Список использованной литературы:
Контрольные вопросы
Раскройте понятие «углеводородокисляющие микроорганизмы».
За счёт сего происходит окисление углеводородов микроорганизмами?
От каких факторов зависит численность углеводородокисляющих микроорганизмов в водоёме?
Приведите примеры углеводородокисляющих микроорганизмов.
Для чего в среду для выращивания микроорганизмов добавляют дизельное топливо?
Каким методом определяют численность углеводородокисляющих микроорганизмов? Опишите этот метод.
Лабораторная работа №2 Эвтрофные и олиготрофные бактерии, как основные группы гетеротрофного бактериопланктона
Цель работы: определить количественный и качественный состав эвтрофных и олиготрофных микроорганизмов в воде морских (и/или пресных) водоёмов.
В основе круговорота элементов лежит органическое вещество, поэтому в водоемах доминируют гетеротрофные микробные сообщества, использующие в качестве источника энергии и конструктивного материала органические соединения углерода.
В 1967 г. в экспериментах со штаммами морских гетеротрофных бактерий в хемостате было показано, что по способности к росту при различных концентрациях органических субстратов эти микроорганизмы можно разделить на две группы, одна из которых обладает способностью к росту при очень низком содержании субстрата в среде, а вторая - при высоком. При этом микроорганизмы второй группы не проявляли активности, но и не погибали при низких концентрациях органических субстратов в среде. Первая группа бактерий в получила название олигокарбофильных, а позднее - олиготрофных бактерий, вторая до сих пор разными исследователями именуется по разному - эвтрофными, сапрофитными, сапротрофными или копиотрофными бактериями.
Бактерии, существование которых в природе зависит от их способности размножаться в местах с низким пищевым потоком углерода - до 0,1 мг/л в день, относятся к олиготрофам (греч. oligos - малый, trophe - пища). Организмы, не только способные расти на богатых питательных средах, но и предпочитающие изобилие пищевых веществ, относят к копиотрофам (греч. copiosus - изобилие, trophe - пища).
Олиготрофные виды встречаются среди представителей многих родов бактерий, их можно классифицировать в зависимости от особенностей отношения к органическому субстрату:
Характеристика: |
Организмы: |
Растут на органической среде только в первом посеве пробы, не выдерживают пересевов |
Бактерии необычной морфологии: бобовидные, тороидальные, треугольные, шестиугольные, звездчатые клетки и т.п. |
При первом посеве пробы растут только на бедных средах, но в последующих пересевах растут на богатых средах |
Pseudomonas, Agrobacterium, Pho-tobacterium, Vibrio, Aeromonas, Flavobacterium, Micrococcus, Staphylo-coccus, Corynebacterium, Arthrobacter |
Бактерии выделяют и культивируют на специальных бедных средах |
Hyphomicrobium, Caulobacter, Mic-rocyclus, Leptothrix, Ochrobium, Metallogenium |
Не культивируются в лабораторных условиях. Обнаружены в природных водоемах при изучении проб в электронном микроскопе |
Простековые бактерии; некоторые бактерии с газовыми вакуолями |
Олиготрофные бактерии являются типичными обитателями водоемов и почв. Многие олиготрофы обладают необычной морфологией, весьма сложным циклом развития и дифференцировкой клеток. Нередко олиготрофные бактерии снабжены простеками - окруженными клеточной стенкой выростами клетки. Такие бактерии называют простекобактериями.
Поскольку репродуктивный ответ олиготрофов на появление пищевых субстратов происходит медленнее, чем у эвтрофов, в условиях непрерывного пищевого потока, популяции эвтрофов используют запасы пищи, быстро размножаются и численно доминируют над олиготрофами. Однако если период поступления пищи был короче цикла репродукции эвтрофов, олиготрофы за счет использования накопленных пищевых резервов получают преимущество и начинают доминировать в истощенной среде. Олиготрофы весьма широко распространены в природе и во многих случаях численно доминируют над эвтрофовными бактериями.
Типичными представителями эвтрофных бактерий являются Е. coli и многие другие хорошо изученные гетеротрофные бактерии. Жизнеспособные клетки эвтрофных бактерий обычно легко можно обнаружить в олиготрофных местах обитания, где их устойчивое существование невозможно. В условиях голодания или при отсутствии достаточного количества пищи такие бактерии в течение некоторого времени сохраняют жизнеспособность. В отсутствие роста может продолжаться их деление и в результате образуются мелкие клетки, обозначаемые в литературе как «ультрамикробактери», «ультрамикроклетки», «минибактерии», «карлики». Через 12-24 ч после прикрепления к поверхности, ультрамикроклетки принимают форму и достигают размеров нормальной бактерии. Среди морских бактерий, образовывавших ультрамикроклетки, обнаружены представители родов Aeromonas, Alcaligenes, Fluvobacterium, Pseudomonas, Vibrio.
Микроорганизмы, приспособленные к жизни в олиготрофных местообитаниях, характеризуются высоким отношением поверхности к объему, способностью к образованию запасных веществ при избыточном, а у некоторых даже при недостаточном поступлении субстрата; низкими тратами на поддержание, что позволяет переживать условия голодания и конкурировать с другими микроорганизмами при низких скоростях роста; наличием системы переносчиков, высокоспецифичных к определенным субстратам; специфической конститутивной системой метаболизма. Полный набор данных свойств обычно не встречается у какого-либо одного организма, но все они являются характерными для микроорганизмов, приспособленных к жизни в олиготрофных местообитаниях. Показано, что олиготрофные бактерии способны усваивать гораздо более широкий спектр органических субстратов, чем эвтрофные, они более гибки в трофическом отношении.
Соответственно различаются и среды, предназначенные для учета олиготрофных и эвтрофных бактерий. Для выделения первых используются питательные среды, содержащие от менее 1 мг до 50 мг органического вещества в литре. Четких границ между группами эвтрофных и олиготрофных бактерий, основываясь только на их способности к росту на средах с высоким или низким содержанием сложных органических веществ (пептона, дрожжевого экстракта и т.д.), провести, по-видимому, невозможно. Считается деление на эвтрофных и олиготрофных бактерий вполне оправданным, поскольку раздельный учет численности бактерий обеих групп позволяет получить дополнительную информацию, например - о трофности водоема.
Таким образом, соотношение численности эвтрофных и олиготрофных бактерий имеет важное практическое значение для характеристики состояния водоемов.
Задание:
нарисовать схему посева для количественного определения эвтрофных и олиготрофных микроорганизмов;
определить количество вышеперечисленных микроорганизмов в 1 мл морской и/или пресной воде;
выделить чистые культуры эвтрофных и олиготрофных микроорганизмов;
Материалы и оборудование: соли NaCl, MgSО4x7Н2О, КС1, К2НРО4, Na2HPО4, NH4NО3, КН2РО4х3Н2О, FeSО4x7Н2О, рыбный бульон (РБ), дрожжевой экстракт, пептон, пробирки, стерильные градуированные пипетки на 1 мл; пинцеты, стерильные шпатели, микроскопы и все необходимое для приготовления окрашенных препаратов и микроскопирования.
Методика проведения работы:
Определение численности эвтрофных и олиготрофных микроорганизмов
Для учета численности эвтрофных бактерий в морских водах наиболее часто используется модифицированная среда Зобелла следующего состава (г): пептон - 5,0; КН2РО4х3Н20 - 0,084; FeS04x7Н2О - 0,185; NaCl - 24,0; MgSO4х7Н2О-1,0; КС1-0,7; дрожжевой экстракт -1,0; вода дистиллированная _ 1 л. Соленость среды при необходимости может быть понижена за счет уменьшения содержания в среде NaCl. Эту же среду можно использовать для учета эвтрофных бактерий в пресных водоемах, исключив из ее состава NaCl. Так же для учета численности эвтрофных бактерий в морских водах может быть использована среда – рыбный бульон.
Для учета олиготрофных бактерий может быть рекомендована модифицированная среда ММС следующего состава (г): NaCl - 7,0; MgSO4х7Н2О - 1,0; КС1-0,7; К7НРО4-2,0; Na2HPО4-3,0; NH4NО3 - 1,0; вода дистиллированная - 1,0 л. В качестве единственного источника углерода и энергии добавляют 50 мг/л дрожжевого экстракта.
Наиболее распространенным методом учета численности эвтрофных и олиготрофных бактерий, способных к росту на питательных средах, является метод предельных разведений. См. лабораторную работу №1.
Время инкубации проб воды зависит от состава среды и исходной численности микроорганизмов в пробе воды. Как правило, для эвтрофных бактерий время инкубации составляет не более 7 суток, а для олиготрофных бактерий может достигать 1 месяц. Пробирки с разведениями инкубируют при комнатной температуре, желательно не выше 200С. В зимний период желательно проверять посевы на присутствие в них психрофильных форм бактерий. Поэтому в этом случае делают два посева из одной пробы воды, один из которых инкубируют при 50С, а второй - при 200С.
О наличии роста в каждом из разведений пробы судят по общему помутнению содержимого пробирок, иногда сопровождаемому и изменением его цвета. Рост микроорганизмов обычно имеет место не во всех повторностях разведений, поэтому для расчета численности микроорганизмов в пробе обычно пользуются таблицами Мак-Креди (приложение 1), построенными на основе методов вариационной статистики.
Полученные результаты записать в тетради и сделать выводы.