Лекции
.pdfСанкт-Петербургский государственный электротехнический университет «ЛЭТИ» им. В.И. Ульянова
(Ленина)
АВТОАНАЛИЗАТОР С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ТЕХНОЛОГИИ
ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ
Метод молекулярной биологии, позволяющий создать копии определенного фрагмента ДНК из исходного образца, повысив его содержание в пробе на несколько порядков.
2
ИСТОРИЯ
МЕТОДА
ПРИНЦИП ПЦР
В основе работы
ПЦР – принцип
комплиментарно
сти азотистых
оснований ДНК
4
ТИПИЧНАЯ РЕАКЦИОННАЯ СМЕСЬ
•Анализируемая ДНК. ДНК служит матрицей для многократного копирования исследуемого участка.
•Праймеры. Праймер — это искусственно синтезированная короткая цепочка нуклеотидов (15–30 штук), комплементарная выбранному участку одной из цепей анализируемой ДНК.
•ДНК-полимераза. Фермент, строящий комплементарную матричной цепь ДНК. Обычно используют термостабильные полимеразы.
•Буфер. Раствор, содержащий различные ионы для поддержания необходимого рН, соли магния, необходимые для работы полимеразы, и не содержащий ионы детергент в сочетании бычьим сывороточным альбумином для предотвращения налипания компонентов реакции на стенки пробирки.
5
ЭТАПЫ ПЦР - АНАЛИЗА
1. Денатурация
Чтобы полимераза могла работать, две цепи ДНКматрицы нужно разъединить.
2. Отжиг праймеров
На этом этапе праймеры специфично присоединяются к освободившимся цепям ДНК-матрицы.
3. Элонгация, или синтез ДНК
В ходе реакции фермент ДНК-полимераза последовательно выстраивает цепь ДНК
6
ЭТАПЫ ПЦР - АНАЛИЗА
7
8
Зона детекции (при
использовании
электрофореза)
ВЫДЕЛЕНИЕ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ ИЗ РАЗЛИЧНЫХ МАТЕРИАЛОВ
Одним из самых прогрессивных методов очистки ДНК является очистка ДНК при помощи магнитных частиц.
В образец добавляется взвесь магнитных частиц, ДНК адгезируется к ним, далее пробирка ставится в магнитный штатив, магнитные частицы собираются на стенке пробирки, супернатант собирается и удаляется. Для промывки частицы ресуспензируются, опять собираются на стенке. На последнем этапе ДНК смывается с магнитных частиц, частицы собираются на стенке, а чистый раствор ДНК отбирается для дальнейших