- •Введение
- •1.1. Аминокислоты Протеиногенные аминокислоты
- •1.2. Строение белков
- •1.3. Свойства белков
- •Классификация белков в организме
- •1.4. Обмен белков
- •Распад белков
- •Метаболизм аминокислот
- •1.5. Основные термины темы
- •Вопросы и задания
- •Углеводы. Обмен углеводов
- •Классификация углеводов
- •Альдозы
- •Альдозы
- •2.2. Обмен углеводов Катаболизм углеводов
- •Катаболизм гликогена
- •Распад глюкозы
- •2.3. Основные понятия и термины темы
- •Вопросы и задания
- •Липиды. Обмен липидов
- •Наиболее распространенные природные жирные кислоты
- •Классификация липидов
- •Простые липиды
- •Сложные липиды
- •Обмен липидов
- •Катаболизм липидов
- •Основные понятия и термины темы
- •Вопросы и задания
- •Цикл трикарбоновых кислот
- •4.1. Общая схема цикла трикарбоновых кислот
- •4.2. Стехиометрия цикла трикарбоновых кислот
- •4.3. Пируват – дегидрогеназный комплекс – организованная система ферментов
- •5. Ферменты - специфические белки
- •5.1. Свойства ферментов
- •Строение ферментов
- •5.3. Номенклатура ферментов
- •5.4. Классификация ферментов и характеристика некоторых групп
- •5.5. Методы выделения и очистки ферментов
- •6. Гормоны
- •6.1. Механизм действия гормонов
- •6.2. Основные гормоны человека
- •. Гормоноиды
- •6.4. Применение гормонов
- •7.Витамины
- •7.1. Общие представления о витаминах
- •7.2. Методы определения витаминов
- •7.3. Классификация витаминов
- •7.4. Антивитамины
- •7.5. Значение витаминов
- •8. Нервная система
- •9. Обмен веществ и энергии в живых организмах
- •9.1. Превращение химической энергии в организме
- •9.2. Некоторые аспекты биоэнергетики
- •9.3. Метаболизм
- •9.4. Методы изучения обмена веществ
- •9.5. Регуляция обмена веществ
- •10. Гемоглобин
- •10.1. Строение гемоглобина
- •10.2. Функциональные свойства гемоглобина
- •10.3. Метаболизм гемоглобина
- •10.4. Методы определения концентрации гемоглобина
- •10.5. Генетика гемоглобина
- •Заключение
- •Библиографический список
- •Оглавление
- •6.1. Механизм действия гормонов……………………124
- •9.2. Некоторые аспекты биоэнергетики………………199
- •3 94026 Воронеж, Московский просп., 14
Распад глюкозы
Распад глюкозы возможен двумя путями. Один из них заключается в распаде шестиуглеродной молекулы глюкозы на две трехуглеродные молекулы. Этот путь называется дихотомическим распадом глюкозы. При реализации второго пути происходит потеря молекулой глюкозы одного атома углерода, что приводит к образованию пентозы; это апотомический распад.
Дихотомический распад глюкозы может происходить как в анаэробных (без присутствия кислорода), так и в аэробных (в присутствии кислорода) условиях. При распаде глюкозы в анаэробных условиях в результате процесса молочнокислого брожения образуется молочная кислота. Иначе этот процесс называется гликолизом (от греч. glicos – сладкий, lysis – растворение).
Отдельные реакции гликолиза катализируют 11 ферментов, образующих цепь. Гликолиз условно можно разбить на два этапа. В первом этапе происходит затрата энергии, второй этап, наоборот, характеризуется накоплением энергии в виде молекул АТФ (рис.7).
Первой реакцией гликолиза является фосфорилирование глюкозы с образованием глюкозо-6-фосфата. Глюкозо-6-фосфат далее изомеризуется во фруктозо-6-фосфат, который фосфорилизуется до фруктозо-1,6-дифосфата. Следующей реакцией является лиазное расщепление фруктозо-1,6-дифосфата до двух триоз – 3-фосфоглицеринового альдегида и фосфодиоксиацетона. Образованием этих триоз заканчивается первый этап гликолиза:
Во второй этап гликолиза вступают две молекулы 2-фосфоглицеринового альдегида, одна из которых образуется непосредственно при расщеплении фруктозо-1,6-дифосфата, а другая при изомеризации фосфодиоксиацетона.
Второй этап гликолиза открывается реакцией окисления 3-фосфоглицеринового альдегида, катализируемой специфической дегидрогеназой, содержащей в активном центре свободную сульфгидрильную (HS-) группу и кофермент НАД. В результате образуется 1,3-дифосфоглицериновая кислота. Далее происходит перенос фосфатной группы на молекулу АДФ; таким образом происходит запасание энергии в макроэнергических связях молекулы АТФ. Поскольку в гликолизе образуются две молекулы 1,3-дифосфоглицериновой кислоты, то и возникают две молекулы АТФ. Изомеризация предыдущего метаболита в 2-фосфоглицериновую кислоту необходима для протекания реакции дегитратации, ускоряемой соответствующей лиазой, с образованием макроэнергического соединения – фосфоенолпировиноградной кислоты, которая далее отдает фосфатную группу на молекулу АТФ. В результате образуется по две молекулы АТФ и пировиноградной кислоты (ПВК). Заключительной реакцией этого метаболического пути является молочная кислота, которая образуется при восстановлении пировиноградной кислоты.
Глюкоза
Г
Л
И Глюкозо-6-фосфат
К
О
Л Фруктозо-6-фосфат
И
З
Фруктозо-1,6-дифосфат
Фосфодиоксиацетон 3-Фосфоглицериновый альдегид
Пировиноградная кислота
Молочная кислота
Рис. 7. Взаимосвязь гликолиза и пентозофосфатного цикла
Распад глюкозы по апотомическому пути в большей степени наблюдается в жировой ткани, печени, ткани молочной железы, надпочечниках, половых железах, костном мозге, лимфоидной ткани. Низкая активность отмечается в мышечной ткани (сердечной и скелетной мышце).
Биологическое назначение пентозофосфатного цикла связанос образованием восстановленной формы НАДФ и рибозо-5-фосфата, которые используются в процессах биосинтеза разнообразных биологических молекул.
СН2ОН
С=О О
НО-С-Н С-Н
Н-С-ОН + Н-С-ОН Трансальдолаза
О
Н-С-ОН
Н-С-ОН СН2О-Р-ОН
О
ОН
СН2О- Р-ОН
ОН
Сегептулозо-7-фосфат 3 –Фосфоглицериновый альдегид
СН2ОН
С=О О
НО-С-Н С-Н
Н-С-ОН + Н-С-ОН
О
Н-С-ОН
СН2О-Р-ОН
Н-С-ОН
О ОН
СН2О- Р-ОН
ОН
Фруктозо-6-фосфат Эритрозо-4-фосфат
СН2ОН
С=О О
НО-С-Н С-Н
Транскетолаза
Н-С-ОН + Н-С-ОН
О О
СН2ОН
СН2О- Р-ОН СН2О-Р-ОН
С =О О
ОН ОН
НО-С-Н С-Н
Ксилулозо-5- Эритрозо-4-
фосфат фосфат Н-С-ОН + Н-С-ОН
О
Н-С-ОН
О СН2О-Р-ОН
СН2О-Р-ОН ОН
ОН
Фруктозо-6- 3-Фосфоглицери-
Фосфат новый альдегид
СН2ОН СН2ОН Н О
\ //
С=О С=О С
Пентозофосфат- Пентозофосфат-
НО-С-Н Н-С-ОН Н- С-ОН
Н-С-ОН эпимераза Н-С-ОН изомераза Н -С-ОН
О О
Н-С-ОН
СН2О- Р-ОН СН2О- Р-ОН О
ОН ОН СН2О-Р-ОН
ОН
Ксилулозо-5-фосфат Рибулозо-5-фосфат Рибозо-5-фосфат
Далее идут реакции с участием ферментов трансфераз, переносящих молекулярные остатки –трансальдолазы и тарнскетолазы.
Транскетолаза переносит двухуглеродный фрагмент от 2-кетосахара на первый углеродный атом альдозы. Трансельдолаза переносит трехуглеродный фрагмент от 2-кетосахара на первый атом углерода альдозы. В качестве 2-кетосахара используется ксилулозо-5-фосфат и метоболиты, полученные при ее участии.
Рассмотрим некоторые реакции, катализируемые транскетолазой и трансальдолазой.
СН2ОН О
С=О С-Н Транскетолаза
НО-С-Н Н- С- ОН
Н-С-ОН + Н-С-ОН
О О
СН2О- Р-ОН СН2О-Р-ОН
СН2 ОН
ОН ОН
К силулозо-5-фосфат С=О
Рибозо-5-фосфат
О НО-С-Н
С-Н Н-С-ОН
Н-С-ОН + Н-С-ОН
О
Н-С-ОН
СН2О- Р-ОН О
ОН СН2О- Р-ОН
3-Фосфоглицериновый ОН
альдегид Седогептулозо-7-фосфат
Процессом окислительной ветви пентозофосфатного цикла является окисление 6-фосфоглюконовой кислоты соответствующей дегидрогеназой. Одновременно с процессом дегидрирования происходит декарбоксилирование 6-фосфоглюконовой кислоты. С потерей одного углеродного атома глюкоза превращается в пентозу:
Н ОН Н ОН О
\ / \ /
С С С
АТФ НАДФ+ Н2О
Н-С-ОН Гексоки- Н-С-ОН Глюкозо-6- Н-С-ОН Лакто
Наза фосфат наза
Н О-С-Н О НО-С-Н О НО-С-Н О
дегидро-
Н-С-ОН АДФ -С-ОН геназа Н-С-ОН
НАДФН + Н+
Н-С Н-С Н-С
О О
СН2ОН
СН2ОН-Р-ОН СН2ОН-Р-ОН
ОН ОН
Глюкоза Глюкозо-6-фосфат 6-Фосфоглюконолактон
СООН СН2ОН
Н-С-ОН НАДФ- С=О
6-Фосфоглюконат-
НО-С-Н Н-С-ОН
дегидрогеназа
Н-С-ОН НАДФН + Н- Н -С-ОН
СО2 О
Н-С-ОН
О СН2О- Р-ОН
СН2О- Р-ОН ОН
ОН
6-Фосфоглюконат Рибулозо-5-фосфат
Анаэробная фаза апотомического распада глюкозы
Рибулозо-5-фосфат, образовавшийся в окислительной фазе, может обратимо изомерироваться в другие пентозофосфаты: ксилулозо-5-фосфат и рибозо-5-фосфат. Катализируют эти реакции два разных фермента, относящиеся к классу изомераз: пентозофасфат изомераза и пентозофасфат эпимераза.. Образование из рибулозо-5-фосфата двух других пентозофосфатов необходимо для осуществления последующих реакций пентозофосфатного цикла, причем требуется две молекулы ксилулозо-5-фосфата и одна молекула рибозо-5-фосфата.
Сукцинил-КоА далее гидролизируется до свободной янтарной кислоты, а выделяющаяся при этом энергия сохраняется путем образования гуанозинтрифосфата (ГТФ) . Эта стадия – единственная во всем цикле, в ходе которой прямо выделяется энергия метаболизма:
СООН
СН2 ГДФ СООН
Сукцинаттиокиназа
СН2 СН2
ГТФ, КоАНS
С=О СН2
S КоА СООН
Сукцинил-КоА Янтарная кислота
Дегидрирование янтарной кислоты ускоряет сукцинатдегидрогеназа, коферментом которой является ФАД. Фумаровая кислота, гидратируется с образованием яблочной кислоты; заключенным процессом цикла Коебса является дегидрирование яблочной кислоты, катализируемое мелатдегидрогеназой; результатом этой стадии является метаболит, с которого и начался цикл ди- и трикарбановых кислот- щавелевоуксусная кислота:
СООН ФАД СООН СООН НАД+ СООН
Сукцинатде- Н2О Малатдегидро
СН2 гидрогеназа СН Фумараза СНОН геназа С=О
С Н2 ФАД .2Н СН СН2 НАДН + Н - СН2
СООН СООН СООН СООН
Янтарная Фумаровая Яблочная Щавелевоук-
кислота кислота кислота сусная кислота
Апотомический распад глюкозы иначе называетсяпентозофосфатным циклом. В результате протекания этого пути из 6 молекул глюкозо-6-фосфата распадается одна. Апотономический распад можно разделить на две фазы : окислительную и анаэробную. Рассмотрим отдельные реакции этого метаболического пути.
Окислительная фаза апотомического распада глюкозы. Как и в глюколизе первой стадией является фосфорилирование глюкозы с образованием глюкозо-6-фасфата. Далее глюкозо-6 – фасфат дегидрируется с участием глюкозо-6-фосфатдегидрогеназы, коферментом которой служит НАДФ. Образующийся 6-фосфоглюконолактон спонтанно или с участием лактоназы гидролизируется с образованием 6-фосфоглюконовой кислоты.
Заключительную стадию окислительного декарбоксилирования ПВК катализирует дигидролипоилдегидрогеназа, коферментом которой является ФАД. Кофермент отщепляет два атома водорода от дигидролипоевой кислоты, тем самым воссоздавая первоначальную структуру данного кофермента:
Н S Е3 S
Липоат + ФАД ФАД 2Н липоат
Н S S
Дигидролипоевая Липоева
Кислота кислота
Конечным акцептором атомов водорода является НАД:
ФАД 2Н + НАД- ФАД + НАДН + Н-
Суммарная схема процесса может быть представлена в виде :
Пируватдегидрогеназный комплекс
С Н3 – СО – СООН + НАД + НSКоА
СО2 + СН3 СО – SкоА + НАДН + Н-
Ацетил –КоА представляет собой соединение с макроэргической связью, иначе его можно назвать активной формой уксусной кислоты. Освобождение коэнзимав А от ацетильного радикала происходит при включении его в амфиболический цикл, который называется циклом ди – и трикарбоновых кислот.
Цикл ди- и трикарбоновых кислот. Этот амфибо-лический цикл называют циклом Кребса в честь Г.Кребся (лауреата Нобелевской премии 1953 г.) определившего последовательность реакций в этом цикле.
В результате функционирования цикла Кребса происходит полный аэробный распад ацетильного радикала до углекислого газа и воды. Цикл Кребса можно рассматривать как путь углеводного обмена, однако его роль в метаболизме гораздо шире. Во-первых, он выступает в роли центрального метаболического пути углерода, входящего в состав всех основных классов биологических молекул, во вторых, совместно с процессом окислительного фосфорилирования обеспечивает основной источник метаболической энергии в форме АТФ.
Большая часть молочной кислоты, образующейся в мышце, вымывается в кровяное русло.
Далее молочная кислота транспортируется к печени и почкам, где она почти полностью перерабатывается в глюкозу и гликоген. Незначительная часть молочной кислоты вновь превращается в пировиноградную кислоту, которая в аэробных условиях окисляется до конечных продуктов обмена.
Аэробный обмен ПВК. В аэробных условиях пировиноградная кислота окисляется; этот процесс называется окислительным декарбонированием пировиноградной кислоты. Катализирует этот процесс мультиэнзимный комплекс, который называется пируватдегидрогеназным комплексом. В состав этого комплекса входят три фермента и пять коферментов.
Первый этап аэрообразного превращения ПВК заключается в ее декарбоксилировании, катализируемом пируватдекарбоксилазой (Е1), коферментом которой является тиаминпирофосфат. В результате образуется оксиэтильный радикал, ковалентно связанный с коферментом.
Фермент, ускоряющий второй этап окислительного декарбоксилирования ПВК, - липоат-ацетилтрансфераза содержит в своем составе два фермента: липоевую кислоту и коэнзим А (KoASH). Происходит окисление оксиэтильного радикала в ацетильный, который сначала акцептируется липоевой кислотой, а затем переносится на KoASH. Результатом второго этапа является образование ацетил-КоА и дегидролипоевой кислоты:
О S
СН 3 липоат-Е2
С-ОН ТПФ Е1 S
С=О - СО2 Н-С-ОН
СН3 Т ПФ
Пировиноградная кислота
О
О НS
Н 3 С- С -S НSКоА- Е2 3 липоат
Липоат Н3С- SкоА + НS
НS
Ацетиллипоевая Ацетил- КоА Дигидролипоевая
Кислота кислота
Глюкоза
АТФ
АДФ
Глюкозо-6-фосфат
Фруктозо-6-фосфат
АТФ
АДФ
Фруктозо-1,6—дифосфат
Ф осфодиоксиацетон 3-Фосфоглицериновый альдегид
Триозофосфат
Изомера
НАЛ
Н3РО4
НАДН+Н-
1,3-Дифосфоглицериновая кислота
АДФ
АТФ
3-Фосфоглицериновая кислота
2-Фосфоглицериновая кислота
Н2О
2-Фосфоенолпировиноградная
кислота
АДФ
АТФ
Пировиноградная кислота
НАДН+Н-
Н3РО4
НАЛ
Молочная кислота
Схема гликолиза
Н ОН Н О
НS-фермент, \ /
С=О 3-Фосфогли- С-S-фермент С-S-фермент
церальдегид- НАД-
Н-С-ОН Н- С-ОН Н-С-ОН
О дегидро- О НАДН + Н- О
гинеза
СН 2О-Р-ОН СН 2О-Р-ОН СН 2О-Р-ОН
ОН ОН ОН
3 -Фосфоглицериновый Е S Е S '
альдегид
О О О
С- О – Р- ОН АДФ С-ОН
Н 3РО4 Фосфоглицераткиназа
ОН Н-С-ОН
Н S-фермент Н-С-ОН АТФ О
О
СН2О-Р-ОН
СН2О-Р-ОН
ОН
ОН
1,3-Дифосфоглицериновая 3- Фосфоглицериновая
кислота кислота
О О
С- ОН С-ОН
Ф осфоглицерат- О Енолоза О
фосфомутаза Н-С – О – Р – ОН Н2О С – О – Р - ОН
СН2ОН ОН СН2ОН ОН
2-Фосфоглицериновая 2-Фосфоенолпирови-
кислота ноградная кислота
О О
С - ОН С - ОН
А ДФ НАДН + Н-
Пируваткиназа С = О Лактатдегидрогеназа Н – С – ОН
АТФ СН3 НАД- СН3
Пировиноградная кислота Молочная кислота