- •Предисловие
- •1. Метод оценки вариабильности признака При изучении изменчивости лесных древесных растений пользуются биометрическими методами исследований, входящими в раздел статистической генетики.
- •Задачи к теме 1: Методы оценки вариабельности признака
- •2. Оценка наследования качественных признаков
- •Задачи к теме 2: Оценка наследования качественных признаков
- •3. Оценка наследования количественных признаков
- •1) Методы оценки количественных признаков и расчет коэффициента наследуемости в широком смысле h2
- •2) Методика расчета коэффициента наследуемости в узком смысле h2
- •Методика расчета генетического улучшения
- •Задачи к теме 3: Оценка наследования количественных признаков
- •Литература
- •Содержание
2. Оценка наследования качественных признаков
Для того чтобы установить, достоверно или случайно наблюдаемое явление теоретическому, в биометрии используются особые критерии, к которым относится критерий Пирсона или критерий Хи-квадрата 2. Он представляет собой сумму квадратов отклонений эмпирических частот p от частот теоретических или ожидаемых p , отнесенную к теоретическим частотам p :
2 =∑
При этом используется нулевая теория. Предполагают, что несоответствие эмпирических и теоретических частот случайно, то есть между этими частотами никакой разницы нет. Если же ( p - p)2 не равно 0, то 2 может изменяться от 0 до , поэтому критерий Пирсона фактический 2f сравнивают со стандартным 2st. И если 2f 2st, то отклонение носит случайный характер для принятого уровня значимости с учетом степеней свободы K , что проверяется по табл. 12.
Таблица 12
Значение 2 при разных степенях свободы (по Фишеру с сокращениями)
Число степеней свободы |
Вероятность p | |||||||||
0,99 |
0,95 |
0,90 |
0,75 |
0,50 |
0,25 |
0,10 |
0,05 |
0,025 |
0,01 | |
1 |
– |
– |
0,02 |
0,1 |
0,45 |
1,32 |
2,71 |
3,84 |
5,02 |
6,63 |
2 |
0,02 |
0,10 |
0,21 |
0,58 |
1,39 |
2,77 |
4,61 |
5,99 |
7,38 |
9,21 |
3 |
0,11 |
0,35 |
0,58 |
1,21 |
2,37 |
4,11 |
6,25 |
7,81 |
9,35 |
11,34 |
4 |
0,30 |
0,71 |
1,06 |
1,92 |
3,36 |
5,39 |
7,78 |
9,49 |
11,14 |
13,28 |
5 |
0,55 |
1,15 |
1,61 |
2,67 |
4,35 |
6,63 |
9,24 |
11,07 |
12,83 |
15,09 |
При этом должны соблюдаться следующие условия:
вариационный ряд должен включать не менее 50 вариантов;
крайние классы не должны быть менее 5, иначе они объединяются с частотами соседних классов и по вторичному числу классов устанавливается число степеней свободы;
при оценке эмпирических распределений по нормальному или биноминальному распределению число степеней свободы равно: K=N–3;
__ по закону Пуассона K=N–2;
в генетических расчетах число степеней свободы в простейших случаях равно числу классов, уменьшенному на единицу.
Задача.В природе имеются красношишечные и зеленошишечные ели (Picea abies (L.) Karst.). При скрещивании этих двух форм во втором поколенииF2было подучено 407 особей с зелеными шишками и 143 – с красными. Соответствует ли данное расщепление ожидаемому по схеме моногибридного скрещивания при полном доминировании 3:1 ?
В приведенной задаче имеется два класса: зеленошишечные и красношишечные формы ели, значит, число степеней свободы K=2–1=1. 2st при K=1 и p=0,05 равен 3,84. Общая численность семян 550, из них ¾ ожидается зеленых, то есть (3550) / 4= 412,5 и ¼ – красных, то есть ¼550=137,5 – это теоретические ожидаемые частоты. Сравним эти величины с полученными в опыте и рассчитаем критерий 2 f (табл. 13).
Таблица 13
Расчет критерия χ2
Показатели |
Количество шишек |
Всего | |
зеленых |
красных | ||
Данные опыта p |
407 |
143 |
550 |
Ожидаемые p |
412,5 |
137,5 |
550 |
Разность p–p |
5,5 |
5,5 |
|
(p-p)2 |
30,25 |
30,25 |
|
2f =0,29 |
2f=0,29; 2st=3,8; 2f2st; значит, расщепление по окраске стробилов соответствует 3:1, а отклонение носит случайный характер.
Метод χ2-квадрата дает возможность сравнивать различные численные отклонения при разных объемах выборок в одном масштабе, но он не применим к значениям, выраженным в процентах и относительных числах.