3.3 Отладка mpj Экспресс

Можно отлаживать MPJ Экспресс на трех уровнях:

1. Mpjrun скрипта: этот скрипт позволяет самонастройки программы MPJ Экспресс в кластере многоядерной конфигурации.

2. Библиотека ядра: внутреннее программное обеспечение MPJ Экспресс

3. MPJ Экспресс демоны: во время работы конфигурации кластера, демоны выполняются на вычислительных узлах и отвечают за запуск и остановка MPJ Экспресс процессов при контакте их со скриптом mpjrun.

3.1 mpjrun скрипт

Для включения отладки для сценария mpjrun, необходимо выполнить следующие действия:

1. Редактировать %MPJ_HOME%/src/runtime/starter/MPJRun.java и изменить значение static final boolean DEBUG на true

2. Перекомпилировать код: cd %MPJ_HOME% ; ant

3.Mpjrun сценарий имеет соответствующий файл журнала %MPJ_HOME%/logs/mpjrun.log

3.2 Основная библиотека

Чтобы включить отладку для основной библиотеки, необходимо выполнить следующие действия:

1 Редактировать %MPJ_HOME%/src/mpi/MPI.java и измените значение static final boolean DEBUG на true

2 Перекомпилируйте код: cd %MPJ_HOME% ; ant

3 Если общее количество MPJ Экспресс процессов равно двум, то соответствующие файлы журнала будут %MPJ_HOME%/logs/mpj0.log и %MPJ_HOME%/logs/mpj1.log для процессов 0 и 1 соответственно.

3.3 MPJ Экспресс демоны

Демоны MPJ Экспресс работающие на вычислительных узлах могут быть отлажены в два этапа, изложенных ниже:

3.3.1 Шаг первый: Изменение файла wrapper.conf

1. Редактировать %MPJ_HOME%/conf/wrapper.conf файл

2. Измените значение wrapper.logfile.loglevel от "NONE" в "DEBUG".

3. Теперь выход mpjboot, mpjhalt и другие мероприятия демона можно увидеть в файле

$MPJ_HOME/logs/wrapper.log. Это очень полезно для диагностики и фиксации ошибки демона.

3.3.2 Шаг второй: Изменение файла MPJDaemon.java

1. Редактировать %MPJ_HOME%/src/runtime/daemon/MPJDaemon.java файл.

2. Изменить значение static final boolean DEBUG флаг на true.

3 Перекомпилировать код: cd %MPJ_HOME% ; ant

4. Файлы авторизации теперь можно увидеть %MPJ_HOME%/logs/daemon-<machine_name>.log файле журнала.

3.4 Проблемы которые могут возникнуть при работе с mpj Экспресс

Существуют определенные проблемы и ограничения для программного обеспечения MPJ Экспресс :

1. Для пользоватлей Windows Vista и 7 installmpjd-windows.bat сценарий может не работать. В таком случае, необходимо запустить с "Запуск от имени администратора". Если проблема осталась, тогда необходимо выполнить скрипт mpjdaemon.bat напрямую или с выключеным брандмауэром.

2. Существует известная проблема WIndows и Solaris, что приводит к ависанию MPJ процесса. Обычно это наблюдается, тогда MPJ программы будут зависать, не ывдав результата и не выдавая никаких сообщений об ошибках.

3. Начальная загрузка процесса MPJ Экспресс зачастую занимает очень много времени.

Например,:

user@machine:~/mpj-user> mpjrun.sh -np 6 -jar $MPJ_HOME/lib/test.jar

16:15:43.400 EVENT Starting Jetty/4.2.23

16:15:43.415 EVENT Started HttpContext[/]

16:15:43.419 EVENT Started SocketListener on 0.0.0.0:15000

16:15:43.419 EVENT Started org.mortbay.http.HttpServer@23ac23ac

16:15:43.420 EVENT Starting Jetty/4.2.23

16:15:43.420 EVENT Started HttpContext[/]

16:15:43.421 EVENT Started SocketListener on 0.0.0.0:15001

16:15:43.421 EVENT Started org.mortbay.http.HttpServer@50265026

[ pause for a minute or two ]

Starting process <0> on Starting process <1> on

[ pause for a minute or two ]

Starting process <2> on Starting process <3> on

[ pause for a minute or two ]

Starting process <4> on Starting process <5> on

[ job starts ]

Эта проблема связанна с разрешением имен.

4. Операция объединения реализуется с ограниченной функциональностью.

5. Любое сообщение, отправленное с MPI.PACK можно получить только с помощью MPI.PACK как типа данных. Позже, MPI.Unpack (..) может быть использован, чтобы распаковывать различные типы данных.

6. Использование буферного режима отправки с MPI.PACK как типа данных на самом деле не использует спецификацию буфера MPI.Buffer_attach (..) метод.

7. MPJ приложения не должны выводить более 500 символов в одной строке. [1]