Лекция_2_ГИ_М_2014
.pdf
Краткое резюме:
Пример подхода для получения устойчивых к фитопатогенам растений
Можно использовать гены PR-белков
СТРУКТУРНЫЕ СВОЙСТВА ДЕФЕНЗИНОВ
-положительно заряженные пептиды
-число аминокислот варьирует от 45 до 54, из которых 12 являются строго консервативными
-структура представлена a-
спиралью и тремя антипараллельными b-
складками, стабилизированных тремя дисульфидными мостиками
-молекула несет гидрофобный и заряженный домены, необходимые для начального взаимодействия с мембраной патогена
КЛАССЫ ДЕФЕНЗИНОВ
ГРУППА |
ПРЕДСТАВИТЕЛИ |
ДЕЙСТВИЕ |
|
ДЕФЕНЗИНОВ |
|||
|
|
|
|
фунгицидное, |
|
|
бактерицидное для |
|
RS-AFP1-4, AC-AMP1, AH- |
некоторых грамположи- |
I |
тельных бактерий, |
|
|
AMP1 |
вызывают |
|
|
|
|
|
морфологические |
|
|
изменения гиф грибов |
|
DM-AMP1, CT-AMP1, AH- |
фунгицидное без |
II |
морфологических |
|
|
AMP1 |
изменений гиф грибов |
|
|
|
III |
SO-D1, ST-PTH1, SIa2 |
бактерицидное |
|
|
|
|
|
бактерицидное и |
IV |
SO-D2-7 |
фунгицидное без |
|
морфологических |
|
|
|
|
|
|
изменений гиф грибов |
ДВЕ МОДЕЛИ ВОЗМОЖНОГО МЕХАНИЗМА ДЕЙСТВИЯ ДЕФЕНЗИНОВ НА ГРИБНЫЕ ПАТОГЕНЫ
1. РЕЦЕПТОР НА МЕМБРАНЕ ПАТОГЕНА РАБОТАЕТ ПОДОБНО “ЯКОРЮ”, ПОЗВОЛЯЯ МОЛЕКУЛЕ ДЕФЕНЗИНА ВСТРАИВАТЬСЯ В МЕМБРАНУ С ОБРАЗОВАНИЕМ ИОНПРОНИЦАЕМОЙ ПОРЫ
2. СВЯЗЫВАНИЕ МОЛЕКУЛЫ ДЕФЕНЗИНА С РЕЦЕПТОРОМ ПРИВОДИТ К АКТИВАЦИИ ПРОМЕЖУТОЧНЫХ СИГНАЛЬНЫХ МОЛЕКУЛ, ИЗМЕНЯЮЩИХ АКТИВНОСТЬ СУЩЕСТВУЮЩИХ ПОР
СРАВНЕНИЕ АМИНОКИСЛОТНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ДЕФЕНЗИНОВ ЧЕТЫРЕХ ГРУПП
Высоко консервативны!!!
СРАВНЕНИЕ АМИНОКИСЛОТНЫХ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ДЕФЕНЗИНА ИЗ ПОДСОЛНЕЧНИКА SD И SO-D2, ПРЕДСТАВИТЕЛЯ IV ГРУППЫ ДЕФЕНЗИНОВ
SD2 |
R T C E S Q |
|
S |
H |
K F K G |
SO-D2 |
G I F S S R K C K T P |
S K T F K G |
|||
SD2mod. |
G I F S S R K C K T P |
S |
K |
T F K G |
|
T C L S D T N C A N V C H S E R F I C T R D S N C D T S C R Y E G Y T C L S D T N C A N V C H S E R F
S G G K C R P A G D C K S G G K C R
G F R R G I R R G F R R
R C F C R C M C R C F C
T K P C S K P C T K P C
SD2 – антибактериальная активность; SO-D2 – антигрибная активность
СХЕМЫ ГИБРИДНЫХ БЕЛКОВ, СОСТОЯЩИХ ИЗ ДЕФЕНЗИНА ИЗ ПОДСОЛНЕЧНИКА SD, СЛИТОГО С РЕПОРТЕРНЫМ БЕЛКОМ LicB
|
232 а.о. |
47 а.о. |
LicB-SD: |
LicB |
SD |
|
47 а.о. |
232 а.о. |
SD-LicB: |
SD |
LicB |
ЭЛЕКТРОФОРЕГРАММА И ЗИМОГРАММА (В ПРИСУТСТВИИ 0,1% ЛИХЕНАНА КАК СУБСТРАТА) БАКТЕРИАЛЬНЫХ БЕЛКОВЫХ ЭКСТРАКТОВ