- •Некоторые генетические термины
- •Генетическая изменчивость
- •Количественная оценка генетической изменчивости
- •Понятия об отборе
- •Отбор: другие модели и оценки
- •Инбридинг
- •Генетический дрейф и эффективный размер популяций
- •Поток генов и структура популяции
- •Мутации
- •Молекулярная генетика популяций и эволюция
- •Мультилокусные модели
- •Количественные признаки и эволюция
- •Список литературы
- •Содержание
Мультилокусные модели
123. Определите значение D в уравнении , из выражения, данного в уравнении . Определите частоту гамет A1B2 после одного поколения случайных скрещиваний.
124. Допустим, что x1=0,3, x2=0,1, x3=0,2 и x4=0,4, вычислите значения D, D/ и r.
125. Предположим, что c=0,1 и S=0,9, каково значение D после трех поколений, если исходно оно равно 0,10? Допустим, что c=0,1 и A=0,9, каково будет значение D после трех поколений, если исходно оно равно 0,10?
126. Если c=0,01, Ne=500 и N=50, то каково значение r2? Используйте выражения и .
127. Если две популяции смешиваются так, что mx=0,2 (my=0,8) и частоты аллеля в диаллельном локусе равны 0,3 и 0,6, а частоты аллеля во втором двухаллельном локусе равны 0,4 и 0,5 в двух популяциях, то каково ожидаемое значение D?
138. Получите общее выражение для частоты гаметы A1B2, если действует отбор. Используйте выражение .
129. Предположим, что a=0,8 и b=0,85, распишите матрицу приспособленностей 3×3. Каков критический уровень рекомбинаций для этих приспособленностей? Если c=0,01, то каковы частоты гамет и гаметическое неравновесие в двух комплементарных неравновесиях?
130. Вычислите кумулятивные вероятности из таблицы 12.
Таблица 12. Вероятность рядов гамет, полученных из уравнения ,
возрастающем порядке и кумулятивная вероятность
-- |
-+ |
+- |
++ |
Вероятность |
Кумулятивная вероятность |
6 |
0 |
0 |
11 |
0,000 |
0,000 |
5 |
1 |
1 |
10 |
0,005 |
0,005 |
0 |
6 |
6 |
5 |
0,037 |
0,042 |
4 |
2 |
2 |
9 |
0,067 |
0,109 |
1 |
5 |
5 |
6 |
0,224 |
0,333 |
3 |
3 |
3 |
8 |
0,267 |
0,600 |
2 |
4 |
4 |
7 |
0,400 |
1,000 |
131. Допустим, что частоты гамет ++, +-, -+ и -- равны 0,15; 0,45; 0,35 и 0,05. Вычислите частоты десяти возможных генотипов, предполагая соответствие пропорциям Харди-Вайнберга. Если генотипы -/- имеют селективный вред, равный 0,2, имеется полное доминирование аллеля дикого типа и мультипликативные приспособленности по локусам, то какова средняя приспособленность для двойных гомозигот и двойных гетерозигот?
132. Допустим, что сильное гаметическое неравновесие наблюдалось между аллелями в двух локусах в разных популяциях. Как можно спланировать исследование для определения причины этой ассоциации?
133. Обдумайте два фактора, которые могут сделать недействительными храповик Мюллера. Как можно поверить значимость этих факторов в реальной популяции?
134. Определите гаметическое неравновесие для данных в таблице 13, используя предложенную стартовую частоту для итерации и значение для выражения с учетом этих данных.
Таблица 13.Численность голубых моллюсков в разных фенотипических классах с двумя аллоферментными локусами
|
Lap |
|
||
Ap |
ff |
fm |
mm |
|
ff |
61 |
96 |
49 |
206 |
fm |
60 |
112 |
56 |
228 |
mm |
49 |
34 |
17 |
100 |
|
170 |
242 |
122 |
534 |
|
=0,302 |
=-0,0246 |
Q=5,43 |
|
135. Левонтин (Lewontin, 1995) отметил, что даже при сильном неравновесии по сцеплению между нуклеотидными сайтами их ассоциация может быть статистически незначимой. В качестве примера рассмотрим гаметы (и их численность) в двух сайтах AA (1), AT (6), TA (15) и TT (78). Рассчитайте кумулятивную вероятность обнаруженного неравновесия, равную или более крайнюю, чем наблюдаемая.
136. Обсудите различия между выметающим и фоновым отбором. Разработайте эксперимент, при котором были бы получены данные, показывающие относительное значение этих двух механизмов для генетической изменчивости.