Добавил:
kiopkiopkiop18@yandex.ru Вовсе не секретарь, но почту проверяю Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:
4 курс / Дерматовенерология / Диссертация_Шагдилеева_Е_В_Клинико_лабораторные_особенности_внутрибольничного.doc
Скачиваний:
0
Добавлен:
23.03.2024
Размер:
3.92 Mб
Скачать

2.3.5 Определение вида Candida spp.

Вид возбудителя определяли с применением микроскопического исследова- ния культуры, биохимической тест-системы Auxacolor 2 (BioRad, США), осно- ванной на биохимических свойствах гриба, методом MALDI-TOF масс- спектрометрии, основанном на определении масс-спектра гриба с помощью при- бора «Autoflex Speed» (Bruker, Германия) и сравнением полученных масс- спектров с масс-спектрами базы данных MALDI Biotyper.

При наличии роста проводили микроскопическое исследование, которое позволяет на основании морфологических признаков выявить Candida spp. и ис- ключить грибы другого рода Cryptococcus, Geotrichum, Malassezia, Trichosporon и Aureobasidium.

Auxacolor 2 (BioRad, США) позволяет определить более 30 видов Candida. С помощью этой системы время идентификации гриба составляет от 24 ч до 72 ч. Тест–система включает 13 тестов ассимиляции разных сахаров, среду с циклогек- симидом и тест на фенолоксидазную активность, а также требует учета ряда мор- фологических признаков и способности культуры к росту при температуре 370С.

MALDI–TOF-масс-спектрометрия на масс-спектрометре Autoflex speed TOF

/ TOF (Bruker Daltonics, Германия) в линейном режиме позволяет идентифициро- вать Candida spp. в течение 15 минут. Сбор масс-спектра с образца выполняли в автоматическом и ручном режимах. Идентификация гриба осуществляется при сравнении полученных спектров с референтной базой, с использованием пакета программ MALDI Biotyper 3.1 (Bruker Daltonics). Для дальнейшего анализа выби- рали один из двух масс-спектров с наибольшим коэффициентом достоверности. Для сравнения спектров выполняли построение диаграмм с помощью MALDI Biotyper OC. MSP-дендрограммы стро- или по объединенным выборкам масс-

спектров, полученных из авторских и референтных коллекционных штаммов, на основе которых была создана база для идентификации. В построении кластеров анализа главных компонентов масс-спектров был применен иерархический метод пятой степени [9].

2.3.6 Определение чувствительности Candida spp.

к антимикотическим препаратам (CLSI M27-A3)

Для определения чувствительности к противогрибковым препаратам in vitro использован метод CLSI M27-A3. Чувствительность определения к следующим препаратам: флуконазолу, вориконазолу, позаконазолу и каспофунгину. Для се- рийных микроразведений использовали среду RPMI 1640 с добавлением буфера MOPS до получения ph 7 +/- 0,1 при температуре 25ºC, после культивирования в течение 24 часов был приготовлен инокулят, финальный инокулят в каждой из ячеек содержал 5 х 102 – 2,5 х 103 КОЕ/мл. Инкубацию при температуре 35ºC про- водили в течение 24 и 48 часов. МИК каспофунгина интерпретировали, как наименьшую концентрацию лекарственного препарата, приводящую к достовер- ному снижению мутности, что трактуют как приблизительное снижение роста на

50% по сравнению с контролем, культивируемым без добавления препарата. Оценку чувствительности Candida spp. к флуконазолу, вориконазолу, каспофун- гину и позаконазолу проводили следующим образом: согласно критериям интер- претации метода M27-A3 МИК чувствительных к флуконазолу и каспофунгину штаммов < 2мкг/мл, умеренно чувствительных – 4 мкг/мл, устойчивых > 8 мкг/мл; МИК чувствительных к вориконазолу штаммов – <1 мкг/мл, умеренно чувствительных – 2 мкг/мл, устойчивых – > 4 мкг/мл, к позаконазолу < 1 мкг/мл. Контроль качества исследования проводили с использованием тест – культуры C. parapsilosis.

Соседние файлы в папке Дерматовенерология