- •2. Підкреслити хімічні групи в складі амінокислот, які формують пептидний зв’язок: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.
- •30. Яка субодиниця бактеріальної рнк-полімерази видаляється з неї при переході від ініціації до елонгації транскрипції (α, β, β', σ)?
- •33. Підкреслити 6 базальних транскрипційних факторів рнк-полімерази іі: tfii a, tfii b, tfii c, tfii d, tfii e, tfii f, tfii g, tfii h, tfii I, tfii j, tfii k.
- •23. Чи входить гістон н1 до складу корової частинки нуклеосоми? ні
- •29. Яка субодиниця бактеріальної рнк-полімерази не входить до складу ферменту під час елонгації транскрипції (α, β, β', σ)?
- •33. Підкреслити 6 базальних транскрипційних факторів рнк-полімерази іі: tfii a, tfii b, tfii c, tfii d, tfii e, tfii f, tfii g, tfii h, tfii I, tfii j, tfii k.
- •4. Чи можливі іонні взаємодії між двома аміногрупами за фізіологічних умов? так
- •8. Скільки існує змістовних кодонів, що відповідають амінокислотам?
- •38. В межах яких динуклеотидів здійснюється метилування днк (ApT, TpA, GpT, CpG, CpA, GpC)?
- •2. Пептидна група по відношенню до водневого зв’язку є: а) донором; б) акцептором; в) і донором, і акцептором; г) не формує водневих зв’язків.
- •9. Яка позиція в складі кодону (перша, друга третя) є найбільш важливою у визначенні амінокислоти?
- •13. Як називається пентоза, що містить он-групу при атомі с2'?
- •7. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Ser.
- •37. Один зі стандартних структурних блоків білків – бромодомен – впізнає: а) ацетатні залишки в гістонах; б) метильні залишки в гістонах; в) фосфатні залишки в гістонах; д) метильні залишки в днк.
- •40. В транскрипційно активних генах: а) нуклеосоми присутні завжди; б) нуклеосоми відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше нуклеосоми присутні; д) частіше нуклеосоми відсутні.
- •1. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.
- •39. Як називається фермент, що здійснює метилування днк?
- •40. В транскрипційно активних генах: а) гістони присутні завжди; б) гістони відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше гістони присутні; д) частіше гістони відсутні.
- •1. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.
- •1. Який заряд в складі кожної амінокислоти несе на собі карбоксильна група за фізіологічних умов?
- •1. Яка хімічна група в складі кожної амінокислоти несе на собі позитивний заряд за фізіологічних умов?
- •37. Метилування днк в промоторних зонах корелює з активацією чи репресією транскрипції, або такої кореляції немає?
- •39. Як називається фермент, що здійснює метилування днк?
- •40. В транскрипційно активних генах: а) нуклеосоми присутні завжди; б) нуклеосоми відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше нуклеосоми присутні; д) частіше нуклеосоми відсутні.
- •37. Ацетильованими чи деацетильованими є гістони в активному хроматині?
- •38. В межах яких динуклеотидів здійснюється метилування днк (ApT, TpA, GpT, CpG, CpA, GpC)?
- •40. В транскрипційно активних генах: а) нуклеосоми присутні завжди; б) нуклеосоми відсутні завжди; в) 50:50; г) частіше нуклеосоми присутні; д) частіше нуклеосоми відсутні.
- •5. Деякий процес супроводжується зростанням ентропії. Зростає чи знижується при цьому вільна енергія?
- •8. Як називається така властивість генетичного коду, що одній амінокислоті відповідає кілька кодонів?
- •38. В межах яких динуклеотидів здійснюється метилування днк (ApT, TpA, GpT, CpG, CpA, GpC)?
- •39. Основним наслідком атр-залежного ремоделювання хроматину є: а) деконденсація хроматину; б) руйнування нуклеосом; в) репозиціювання нуклеосом; г) зміна структури нуклеосом.
- •1. Який заряд несе на собі кожна амінокислота за фізіологічних умов (плюс, мінус, обидва, жодного)?
- •39. Основним наслідком атр-залежного ремоделювання хроматину є: а) деконденсація хроматину; б) руйнування нуклеосом; в) репозиціювання нуклеосом; г) зміна структури нуклеосом.
- •1. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.
- •1. Підкреслити хімічну групу, яка не зустрічається в складі амінокислот: аміногрупа, фенольна, карбоксильна, фосфатна, гуанідінова, амідна.
1. Який заряд в складі кожної амінокислоти несе на собі карбоксильна група за фізіологічних умов?
2. Як називаються нековалентні взаємодії між зарядженими групами чи молекулами?
3. Як називаються нековалентні взаємодії, які реалізуються між будь-якими групами чи молекулами на маленьких відстанях?
4. Одна з двох груп, що формують водневий зв'язок, містить атом водню. Як вона називається?
5. Зростання чи зниження вільної енергії є умовою здійснення будь-якого процесу?
6. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Val.
7. Дайте повну назву амінокислоти, що позначається Arg.
8. Скільки всього існує кодонів?
9. Яка позиція в складі кодону (перша, друга третя) є найбільш важливою у визначенні амінокислоти?
10. Тип вторинної структури білків, яка стабілізується водневими зв'язками між пептидними групами амінокислот, що відстоять на 3 амінокислоти одна від одної вздовж ланцюга?
11. Тип вторинної структури білків, яка стабілізується водневими зв'язками між пептидними групами витягнутих поліпептидних ланцюгів?
12. Скільки атомів вуглецю містить цукор в складі нуклеотиду?
13. Амінокислотну послідовність білка прийнято зчитувати в певному напрямі. Як позначається його початок?
14. Нуклеотидну послідовність нуклеїнової кислоти прийнято зчитувати в певному напрямі. Як позначається його початок?
15. Як називається пентоза, що входить до складу РНК?
16. Подвійна спіраль ДНК в В-формі є правою чи лівою?
17. Скільки водневих зв'язків утворюється між G і C в GC-парі?
18. В ДНК реалізуєтся динуклеотидний контакт CT. Яке позначення контакту є еквівалентним до наведеного?
19. Послідовність одного з ланцюгів ДНК – AAGTATG. Напишіть послідовність комплементарного ланцюга.
20. Незалежні від нуклеотидної послідовності білково-нуклеїновї взаємодії здійснюються переважно через цукрофосфатний остов чи жолобки подвійної спіралі ДНК?
21. Які нековалентні взаємодії, як правило, відіграють провідну роль у білково-нуклеїновому впізнанні (іонні, гідрофобні, ван-дер-ваальсові, водневі зв’язки)?
22. Як називаються основні білки хроматину?
23. Яка середня густина нуклеосом в хроматині (1/100, 1/200, 1/300, 1/400 нуклеосом на пари основ)?
24. Залишки яких амінокислот є позитивно зарядженими за фізіологічних умов (Ala, Arg, Asp, Gln, Ile, Lys, Met, Tyr,Val)?
25. Як називається частина хроматину, яка зберігає високий ступінь компактності і є повністю репресованою в інтерфазі?
26. Як називається сукупність послідовностей ДНК в гаплоїдному наборі даного організму?
27. Зростає, знижується чи не змінюється спорідненість до промоторів бактеріальної РНК-полімерази при наявності σ-фактора в складі ферменту?
28. В якому напрямі здійснюється зчитування інформації з ДНК в ході транскрипції?
29. Дайте повну назву ферменту, який прийнято скорочено позначати як RNAP.
30. До якого кінця мРНК приєднується черговий нуклеотид під час транскрипції?
31. Ділянка ДНК, що контролює активність певного промотору, називається trans- чи cis-регулятором?
32. Регуляція транскрипції, що залежить від ефективності впізнання термінуючого елементу, є: а) негативною; б) позитивною; в) атенюацією; г) аллостеричною.
33. Підкреслити групи генів, які транскрибуються РНК-полімеразою ІІІ: високомолекулярна rRNA, 5S rRNA, білкові гени, snRNA, tRNA.
34. Складовою частиною якого базального транскрипційного фактору РНК-полімерази ІІ є білок ТВР?
35. Який транскрипційний фактор РНК-полімерази ІІ має кілька ферментативних активностей (TFII A, TFII B, TFII D, TFII E, TFII F, TFII H)?
36. С-кінцевий домен РНК-полімерази ІІ піддається фосфорилюванню при: а) ініціації транскрипції; б) переході від інінціації до елонгації; в) елонгації; г) термінації.
37. Один зі стандартних структурних блоків білків – хромодомен – впізнає: а) ацетатні залишки в гістонах; б) метильні залишки в гістонах; в) фосфатні залишки в гістонах; д) метильні залишки в ДНК.
38. Як називається фермент, що здійснює ацетилування гістонів?
39. CpG-острівці з’являються внаслідок: а) метилування ДНК; б) підтримання деметильованого стану ДНК; в) мутацій; г) активності мобільних елементів.
40. Комплекси ремоделювання хроматину рекрутуються в активні ділянки хроматину: а) транскрипційними факторами; б) ацетильованими гістонами; в) гістон ацетилтрансферазою; г) білками ядерного матриксу; д) реалізуються всі можливості.
Модуль 1. Білет 101.
Дата ________ Група________________
Прізвище ______________________