2. Применение диалогового окна Translate:

В текстовом поле dx и dy, введите 0, а в текстовом поле dz, введите -5 и нажмите OK.

HyperChem перемещает молекулу 5Å недалеко от Вас и молекула вновь появляется в рабочем пространстве.

Нажмите [Пробел], чтобы повторно выровнять по центру молекулу в рабочем пространстве.

3. Масштабирование молекулы

1. Использование инструмента (кнопки) Изменения масштаба изображения

Чтобы увеличить или уменьшить размеры молекулы, используйте кнопку Изменения масштаба изображения. Это полезно, например, когда Вы хотите исследовать структурные детали большой молекулы.

Произведите L-щелчок по значку Изменение масштаба изображения .

Установите курсор на рабочем поле и нажмите левую кнопку мыши. Не отпуская ее, передвигайте мышь по рабочему полю. Изображение молекулы будет уменьшаться при движении к верхнему правому углу рабочего поля и увеличиваться при движении к его нижней границе.

4. Центрирование молекулы

После того, как Вы используете Трансляцию или Изменение масштаба изображения, Вы можете вернуться к первоначальному размеру молекулы и отцентрировать ее в рабочем пространстве.

Выровнять по центру и масштабировать молекулу можно так:

Выберите Scale to Fit в меню Display, или как альтернативу, нажмите клавишу "пробел". Молекула возвращается к ее первоначальному размеру и устанавливается в центр рабочего пространства. Вы можете достичь того же вводя значение 1 в диалоговом окне (диалоговое окно Zoom выводится двойным щелчком по кнопке Изменение масштаба изображения). Однако при этом не происходит центрирование молекулы.

5. Xy Вращение

Чтобы вращать одну или более молекул вокруг оси X или Y или обоих сразу, используйте кнопку XY вращения.

Произведите L-щелчок на кнопке XY-вращения . Переместите курсор в рабочее пространство окна HyperChem. Удерживая нажатой левую кнопку мыши, вращайте молекулу.

Задание:

1. Используйте диалог Labels в меню Display, чтобы добавить символы к атомам. Нажмите левую кнопку мыши и протяните ее горизонтально. При этом молекула будет вращаться вокруг оси Y.

2. Нажмите левую кнопку мыши и протяните ее вертикально. Молекула вращается вокруг оси X.

3. Нажмите левую кнопку мыши и протяните ее по диагонали, чтобы вращать молекулу и вокруг осей X и Y одновременно.

4. Вращайте молекулу, пока она не будет выглядеть так, как на рис. 2.2.

6. Z Вращение Чтобы вращать молекулу вдоль оси Z произведите L-щелчок на кнопке Z вращения . Нажмите левую кнопку мыши и протяните горизонтально вправо в рабочем пространстве. Молекула вращается по часовой стрелке. Нажмите левую кнопку мыши и протяните горизонтально налево. Молекула приближается против часовой стрелки. Отметьте: Протягивание вертикально не имеет никакого эффекта.

Рис. 2.2.

Измерение структурных свойств молекулы

Создайте 3D cструктуру молекулы, показанной на рис. 2.3.

Используя описанные выше приемы, расположите молекулы на рабочем поле так же, как на рисунке. Молекула встроена по умолчанию с определенными значениями структурных параметров. Следующие примеры показывают Вам, как измерить эти параметры. 6. Характеристики Атома Чтобы получить информацию об атоме в меню Select, удостоверьтесь, что выбрана команда Atoms и команда Multiple Selections не активизирована. Щелкните левой кнопкой мыши по кнопке Selection, затем сделайте L-щелчок атоме кислорода. Выбранный атом подсвечивается, и в строке состояния появляются характеристики атома.

Рис. 2.3.

Строка состояния показывает номер атома, тип атома, и вызывает заряд поля в терминах метода молекулярной механики. В строке состояния также показаны x, y, и z координаты атома. Выберите другие атомы и сравните характеристики атомов, которые показаны в строке состояния.