Слесарев В.И. - Химия. Основы химии живого. 2000 (учебник для вузов)
.pdfНаиболее устойчивой и относительно малоизменяемой частью сложного органического вещества является углеродная цепь - уг леродный скелет. В зависимости от структуры углеродного ске лета все органические соединения классифицируются на ацик лические и циклические.
А ц и к л и ч е с к и е с о е д и н е н и я - соединения с откры той (незамкнутой) углеродной цепью. Их простейшими представи телями являются алифатические углеводороды, содержащие толь ко атомы углерода и водорода, которые могут быть насыщенны ми (алканы) и ненасыщенными (алкены, алкадиены, алкины).
Углеродная цепь может быть неразветвленной (например, в н-гексане) и разветвленной (например, в 2,3-диметилбутане).
I АЛ КАН Ы
|
|
|
СН3 СНз |
с н 3— с н 2— с н 2— с н 2— с н 2— СН3 |
с н 3— с н — с н — с н 3 |
||
н-гексан |
|
|
2 ,3-диметилбутан |
I а л к е н ы ! |
а л к а д и е н ы ] |
|
I АЛКИНЫ |
СНз— с н = с н 2 |
н 2с= сн— с н = с н 2 |
н с = с н |
|
пропен |
бутадиен-1,3 |
|
этин (ацетилен) |
Ц и к л и ч е с к и е |
с о е д и н е н и я - |
соединения с замкну |
той углеродной цепью. В зависимости от природы атомов, со ставляющих цикл, различают карбоциклические и гетероцик лические соединения.
К а р б о ц и к л и ч е с к и е с о е д и н е н и я содержат в цикле только атомы углерода и делятся на две существенно разли чающиеся по химическим свойствам группы: алициклические соединения (циклоалканы), например циклопропан, циклогек сан, и ароматические соединения (арены), например бензол, нафталин.
ЦИ КЛОАЛКАН Ы АРЕН Ы
Н2 |
|
Н2 |
Л;-© оо |
||
Н 2с х |
с / С Н 2 |
||||
А |
|||||
Н2С |
с н 2 |
|
|
||
н 2с — с н 2 |
|
|
|
|
|
циклопропан |
|
Н2 |
н |
нафталин |
|
циклогексан |
бензол |
||||
Г е т е р о ц и к л и ч е с к и е |
с о е д и н е н и я |
содержат в цикле |
кроме атомов углерода один или несколько атомов других эле ментов - гетероатомов: кислород, азот, серу и др. Эти соединения могут иметь как ароматический (пиррол, пиридин, тиофен), так и неароматический характер (этиленоксид, пирролидин).
376
А Р О М А Т И Ч Е С К И Е |
|НЕАРОМАТИЧЕСКЙЁ |
|||
оN |
ОN |
9 |
|
н 2с -------СН2 |
Н2С\ / СН2 |
Н2СХ /С Н 2 |
|||
Н |
|
0 |
N |
|
пиррол |
пиридин |
тиофен |
этиленоксид |
Н |
пирролидин |
При систематизации органические соединения делят на клас сы в соответствии с тем, какие функциональные группы имеются в молекулах.
Функциональная группа - атом или группа атомов, определяющие принадлежность соединения к определен ному классу и ответственные за его химические свой ства.
Химические свойства данного класса органических соедине ний определяются как характером углеродного скелета, так и числом и характером функциональных групп. Соединения с не сколькими одинаковыми функциональными группами называ ются полифункциональными, например:
сн2— СН— СН2 |
\ |
||
I |
I |
I |
но/ с с\ он |
он |
он |
он |
|
|
глицерин |
|
щавелевая кислота |
Соединения с разными функциональными группами называют
гетерофункциональными, например:
о
сн2—сн—сн—сн—сн—с//
I |
I |
I |
I |
I |
4 |
н |
он |
он |
он |
он |
он |
|
глюкоза (полигидроксиальдегид)
H 3N — С Н 2— С О О
сн3- -сн—соон
I
он
ГЛИЦИН |
молочная кислота |
(аминокислота) |
(гидроксикислота) |
Номенклатура. В настоящее время общепринятой является систематическая номенклатура ИЮПАК (IUPAC - Междуна родный союз теоретической и прикладной химии).
Основу названия органического соединения по этой номенк латуре составляет название главной углеродной цепи молекулы. Она не всегда самая длинная, но обязательно должна содержать самую старшую функциональную группу данного соединения.
377
Функциональные группы обозначаются префиксами ( приставка ми) или суффиксами. В табл. 15.1 приведены основные функци ональные группы в последовательности убывания их старшин ства и указаны соответствующие им префиксы и суффиксы. Функ циональные группы необходимо выучить и запомнить, чтобы, взглянув на структурную формулу вещества, вы могли сразу оп ределить, какие функциональные группы имеются в этом веще стве и к какому классу органических веществ оно относится.
О с н о в н ы е п р а в и л а м е ж д у н а р о д н о й н о м е н к л а т у р ы . Название соединения составляют из префиксов,
корня и суффиксов.
Префиксами (табл. 15.1, 15.2) обозначают названия всех функциональных групп данного соединения, располагаемых в алфавитном порядке, кроме старшей, название которой обозна чают суффиксом.
Корень обозначает название главной углеродной цепи или карбоциклической, или гетероциклической структуры.
Суффиксами (табл. 15.1) обозначают степень насыщеннос ти главной цепи (-ан, -ен, -ин) и старшую функциональную группу. Следовательно, название органического соединения со ставляется по следующей схеме:
Префиксы
ук а зы в а ю т р у сск и е названия в се х ф у н к ц и он ал ьн ы х гр уп п в алф авитном п о
ря д к е (к р о м е ст а р
шей гр уп п ы )
Корень
указы вает название главной углеродной цепи или карбоцик лической, или гетеро ци кл и ческой стр ук ту р ы
Суффиксы
указы ваю т:
степ ен ь на- |
название |
сы щ ен н ости |
старш ей |
главной цепи |
гр уп п ы |
(-ан, -ен, -ин) |
|
|
|
|
|
|
|
Таблица 15.1 |
|
О сн ов н ы е ф у н к ц и он а л ьн ы е гр уп п ы , обозн а ч а е м ы е су ф ф и к са м и |
|||||||
|
и п р еф и к са м и , в п ор я д к е убы ва н и я |
и х ста р ш и н ств а |
|||||
Название |
класса |
соединений |
Ф ункциональная |
Префикс |
Суффикс |
||
и его |
общая |
формула |
группа |
||||
|
|
||||||
К арбоновы е к и сл оты |
К арбоксильная |
к арбокси - - к а р б о н о в а я |
|||||
|
|
\f > |
|
о /чЧо |
|
ки сл ота |
|
Я 1 О |
|
|
|
||||
|
|
о н |
1 |
|
|
||
|
|
он |
|
|
|||
С ульф оновы е к и сл оты |
С ульф окислотная |
сул ьф о- |
- с у л ь ф о н о |
||||
|
О |
|
|
О |
|
вая ки сл ота |
|
|
|
|
|
|
|||
|
и |
|
|
II |
|
|
|
R —S—ОН |
— s — он |
|
|
||||
|
II |
|
|
II |
|
|
|
|
О |
|
|
О |
|
|
378
Название класса соединений и его общая формула
Соли карбоновых кислот
R —
О"
Сложные эфиры
R — С Г
O R '
Амиды
R —
N H 2
Нитрилы
R — C = N
Альдегиды
R — С \
Н
Кетоны
R — С — R '
II
0
Спирты
R — ОН
Тиолы
R — SH
Амины
R — NH2; N H R2; N R 3
Алкины С,гН 2л-2
П р о д о л ж е н и е
Функциональная группа |
Префикс |
Суффикс |
|
Карбоксилат |
|
-оат |
|
- o |
f0" |
|
|
Алкилкарбоксилатная |
карбоалк- |
А лкил...оат |
|
|
|
окси- |
|
- с С |
° |
|
|
|
O R ' |
|
|
Амидная |
|
карбамоил- |
-амид |
- c t |
° |
|
|
|
N H 2 |
|
|
Нитрильная |
циано- |
-нитрил |
|
— C = N |
|
|
|
Альдегидная |
оксо- |
-аль |
|
- o |
f |
|
|
|
Н |
|
|
Карбонильная |
окео- |
-он |
|
— с — |
|
|
|
II |
|
|
|
0 |
|
|
|
Гидрокси |
|
(гидр)окси- |
-ол |
—о н |
|
|
|
М еркапто |
меркалто- |
-тиол |
|
— SH |
|
|
|
— N H 2; — NH R; — N R 2 |
амино- |
-амин |
|
— с = с — |
- |
-ин |
Алкены |
— с = с — |
- |
-ен |
спя2п |
|
|
|
Алканы |
~ |
— |
-ан |
С„Н2л+2 |
|
|
|
379
Таблица 15.2
Функциональные группы, обозначаемые только префиксами
Название класса соединений |
Функциональная группа |
Префикс |
|
и его общая формула |
|||
|
|
Галогенпроизводные
R—Hal
Нитратопроизводные
R—0N02
Нитропроизводные
R—N02
Простые эфиры R—О —R
Сульфиды
R—S—R
Дисульфиды
R—S—S—R
Гидропероксиды
R—о—о—н
Алкилпероксиды
R—О—О—R
—F; —Cl; —Br; —I
1 |
ОАО |
о |
|
ОАО |
|
|
—OR |
—SR
—S—SR
—О—ОН
—О—OR
галоген(о)-
нитрато-
нитро-
алкокси-
алкилтио-
алкилдитио-
гидроперокси-
алкилперокси-
В главной цепи нумерацию атомов углерода начинают с того конца, к котором у ближе расположена старшая функциональ ная группа, а если ее нет, то цепи нумеруют так, чтобы замес тители получили наименьшие номера. В гетероцикле начало нумерации определяет гетероатом.
Перед префиксами и после суффиксов соответствующих функ циональных групп и суффиксов степени насыщ енности ставят цифры, указывающие положения групп и кратных связей, кото рые отделяют друг от друга запятыми, а от префиксов, суффик сов и названий групп - дефисом. После суфф иксов “ -аль” или “ -овая кислота” цифры, указывающие положение альдегидной или карбоксильной группы, не ставят, так как с их атома угле рода начинается нумерация главной цепи.
Для одинаковых функциональных групп перед их префик сами или суффиксами используются греческие числительные: ди-, три-, тетра-, пента- и т. д. При наличии в соединении не скольких одинаковых заместителей при одном и том же атоме углерода цифра, обозначающая место этих заместителей, повто
ряется в названии столько раз, сколько |
имеется заместителей, |
и они ставятся перед соответствующ им |
греческим числитель- |
380
ным. Рассмотрим составление названия органических соединений по международной номенклатуре на следующих примерах:
6 |
5 |
4 |
3 |
|
2 |
1 |
|
4 |
3 |
2 |
О |
с н 3— с н 2— с н — с н 2— С Н — С Н 3 |
|
с н 3- - с н 2— сн - ■ < |
н |
||||||||
|
|
С Н 3 |
|
|
С Н 3 |
|
|
|
с н 3 |
|
|
|
2,4-диметилгексан |
|
|
|
2 -метилбутаналь |
|
|||||
|
|
1 |
|
2 |
3 |
4 |
5 |
6 |
7 |
|
|
|
|
с н 3— с н — с н 2— с н —с н 2— с н 2— с н 3 |
|
||||||||
|
|
|
|
С6Н5 |
сн 2— СН2С1 |
|
|
|
|||
|
|
|
|
|
2-фенил-4-(2-хлорэтил)гептан* |
|
|
|
|||
|
|
2 |
3 |
|
4 |
5 |
|
з |
2 |
о |
|
|
с н 2 |
|
|
|
|
||||||
|
:С— с н 2— с н — с н 3 |
|
с н 2— сн - |
■ <н |
|
||||||
|
|
С 2Н 5 |
|
с н 3 |
|
|
о н |
о н |
|
||
|
4-метил-2-этилпентен-1 |
|
2,3-дигидроксипропаналь |
|
|||||||
1 |
2 |
з |
4 |
|
5 |
6 |
|
4 |
3 |
|
|
с н 3— с - -сн- - с н 2— с - - С Н 3 |
|
с н 3— сн с н 2— с о о н |
|
||||||||
|
О |
с 6н 5 |
|
|
о |
|
|
|
I |
|
|
|
|
|
|
|
|
о н |
|
|
|||
|
3-фенилгексакдион-2,5 |
|
|
3-гидроксибутановая кислота |
|
Н 2Н 2
с - с з 2
н 2с |
Х - с н -С Н 2- |
с - с н I
Н2Н2 С1
|
о |
о |
5 |
4 |
,0 |
|
|
6 |
3 |
||
< |
|
с н 2— с н — с н = с - |
|||
н |
|
|
|
|
З-хлор-З-циклогексилпропаналь
15.2. ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТРУКТУРА БИООРГАНИЧЕСКИХ МОЛЕКУЛ И ВИДЫ ИЗОМЕРИИ
Многообразие органических соединений обусловлено в значи тельной мере явлением изомерии.
Изомерами н а зы в а ю тся соединения с одинаковым качествен
ны м и ко л и че стве н н ы м со ста во м , но о тл и ча ю щ и е ся последо в а т е л ь н о с т ь ю связы вани я а т о м о в ил и располож ением и х в п р о с тр а н с тв е .
Даже минимальные структурные различия между изомерами биомолекул приводят к заметным различиям в их физических и химических свойствах и очень сильно влияют на их биологичес кую активность. Возможны следующие типы изомерии: с т р у к
т у р н а я и п р о с т р а н с т в е н н а я ( стереои зом ерия).
С т р у к т у р н а я и з о м е р и я . Этот тип изомерии обуслов лен различным взаимным расположением атомов в молекулах.
2Й
* Н а з в а н и е с л о ж н ы х з а м е с т и т е л е й о б ы ч н о з а к л ю ч а е т с я в с к о б к и .
Ц и ф р ы в с к о б к а х о т н о с я т с я к н у м е р а ц и и б о к о в о й ц е п и , п р и ч е м н у м е |
||||
, |
, |
, |
с ~” с \ |
|
р а ц и я н а ч и н а е т с я с т о го а т о м а у гл е р о д а , к о т о р ы й н е п о с р е д с т в е н н о с в я |
||||
N 0 2 Cl |
С 6Н 5 |
о с н з |
зан с гл а в н о й ц е п ь ю . |
метил-6-нитро-2-оксо-3-фенил-5-хлоргексен-3-оат |
|
381
При этом различают изомерию углеродного скелета и изомерию полож ения.
И з о м е р и я у г л е р о д н о г о с к е л е т а обусловлена сп о собностью атомов углерода образовывать как прямые ( нормаль н ы е) углеродные цепи, так и разветвленные цепи с различной степенью разветвления. Например, у пентана имеются три изо мера:
|
|
|
|
СНз |
1 |
2 |
3 |
4 |
сн3—с—сн3 |
СНз— СН2— СН2— СН2— СНз сн3—сн—сн2—сн3 |
||||
|
|
СНз |
|
СНз |
н-пентан |
|
2 -метилбутан |
|
2 ,2 -диметилпропан |
И з о м е р и я п о л о ж е н и я |
обусловлена различным положе |
нием заместителей, функциональных групп или кратных связей в молекулах органических соединений одинакового состава. На
пример: |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
- |
перемещение заместителя по цепи: |
|
|
|
|
||||
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
сн2—сн2—сн2—сн2—сн3 |
сн3—сн—сн2—сн2—С Н 3 |
||||||||
С1 |
|
1 -хлорпентан |
|
|
С1 |
2 -хлорпентан |
|
||
|
|
|
|
|
|
||||
|
|
|
сн3—сн2—сн—сн2—сн3 |
|
|
||||
|
|
|
|
|
С1 |
|
|
|
|
|
|
|
|
3-хлорпентан |
|
|
|
|
|
- |
перемещение кратной связи по цепи: |
|
|
|
|||||
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
1 |
2 |
3 |
4 |
5 |
сн2=сн—сн2—сн2—сн3 |
сн3—сн=сн—сн2—сн3 |
||||||||
|
|
пентен- 1 |
|
|
|
пентен- 2 |
|
- взаимное расположение заместителей в соединениях аро матического ряда:
СН*
о СНз
1 ,2 -диметилбензол |
1,3-диметилбензол |
СНз |
1,4-диметилбензол |
||
(орпго-ксилол) |
(мета-ксилол) |
(пара-ксилол) |
Для рассмотренных видов структурной изомерии взаимное превращение изомеров друг в друга при обычных условиях от сутствует. Особым случаем структурной изомерии является тау томерия.
382
Таутомерия - явление равновесной динамической изо мерии, при которой происходит быстрое обратимое са мопроизвольное превращение ст рукт урных изомеров, со провождаемое миграцией подвижной группы между дву мя или несколькими центрами в молекуле.
Таутомерия свойственна соединениям, в молекулах которых име ются разные реакционноспособные группировки. Например, в мо лекулах природных аминокислот имеются две группы с противо положными свойствами: аминогруппа - основные свойства - и карбоксильная группа - кислотные свойства (разд. 8.2). М ежду этими группами осущ ествляется перенос протона, и поэтому такой вид изомерии называется прототропной таутомерией. Для обозначения таутомерного равновесия в учебнике исполь зованы пунктирные стрелки.
H2N—CHR—COOH * * H3N—CHR—СОО~
Для всех природных аминокислот в кристаллическом состоя нии и в водных растворах наиболее устойчив таутомер, имеющий структуру биполярного иона. Его содержание превышает 99,9% . П оэтому в учебнике все природные а-аминокислоты всегда изо бражены в виде таутомера с биполярно-ионной структурой.
Прототропная таутомерия бывает разных видов: кето-еноль- ная (разд. 18 .2 .3), лактим-лактамная (разд. 23.2) и др. Кроме прототропной таутомерии в природных соединениях наблюдает ся кольчато-цепная таутомерия, которая особенно характерна для углеводов (разд. 22 . 1).
П р о с т р а н с т в е н н а я и з о м е р и я ( с т е р е о и з о м е р и я ) . Пространственная изомерия в молекуле обусловлена различным пространственным расположением атомов при одинаковом по рядке их связывания.
Стереоизомеры - изомеры, имеющие одинаковую после доват ельност ь хим ических связей атомов, но различное располож ение эт их атомов относительно друг друга в пространстве.
Стереоизомеры могут различаться конформацией и конфигу рацией.
Конформациями молекулы называются различные ее
«пространственные формы, возникающие в результате вращения атомов или групп вокруг ординарных связей.
Стереоизомеры, различие между которыми обусловлено поворо том отдельных участков молекулы вокруг ординарных связей, называются конформерами. Наиболее стабильными и энергети чески выгодными конформерами являются те, в которых меж ду несвязанными атомами или их группами межатомное отталкива ние наименьшее; их называют заторможенными конформерами. Конформеры, где атомы или их группы расположены близко друг
383
кдругу, являются нестабильными и называются заслоненными.
Фактически различные конформеры находятся в динамическом
равновесии, |
и возмож ность перехода одного |
конформера в дру |
|
гой определяется |
энергетическим барьером |
вращ ения, который |
|
составляет |
1 0 -5 0 |
кД ж /м оль. П оскольку энергетический барьер |
вращения невелик, то переход из одной конформации в другую |
|
осущ ествляется легко, и поэтому выделить конформеры в каче |
|
стве устойчивы х изомеров нельзя. Внутреннее вращение вокруг |
|
просты х связей ограничивается |
или даже затормаж ивается в |
случае вы сокого энергетического |
барьера вращения. |
Для изображения результатов вращения по связи С—С удоб но пользоваться проекционными формулами Ньюмена (1955). Эти проекции получают, рассматривая молекулу вдоль С—С связи, вокруг которой происходит вращение. Ближайший к наблюда телю атом углерода обозначается точкой пересечения его связей
, а удаленный от наблюдателя атом углерода и его связи -
окруж ностью с линиями . На рис. 15.1 при помощ и проек
ций Ньюмена и стереохимических формул изображено враще ние метильных групп вокруг связи С—С в молекуле этана.
Вдлинных углеродных цепях вращение возмож но вокруг нескольких С—С связей. П оэтому вся цепь может принимать разнообразные геометрические формы, среди которы х зигзаго образная конформация наиболее устойчива. Именно эта кон формация характерна для гидрофобных фрагментов природных
жирных кислот и их производных.
Вциклических соединениях вращение вокруг ординарных связей ограничено, что приводит к возникновению определенных
Н н |
н |
|
П р о е к ц и и |
AG° = - 1 2 ,6 к Д ж /м о л ь |
|
Н ью м ен а |
||
|
нн
заслоненный |
заторможенный |
конформер |
конформер |
Н
С тер еох и м и ч еск и е ф ор м у л ы
Рис. 15.1. Проекции Ньюмена и стереохимические формулы засло ненного и заторможенного конформеров молекулы этана
384
н |
н |
|
н |
н |
|
н |
^ н |
|
|
н |
|
|
|
|
н |
н |
н |
|
н |
|
ванна |
|
"кресло" |
Рис. 15.2. Циклогексан в конформациях ванны и кресла
конформаций. В природных соединениях особенно часто встреча ется фрагмент, содержащий циклогексановый цикл. А томы уг лерода в этом цикле находятся в состоянии $р3-гибридизации, и, следовательно, их химические связи не лежат в одной плос кости. У циклогексана возникают два конформера типа кресла и ванны (рис. 15.2). В конформации «кресло», в отличие от кон формации «ванна», не имеется заслоненных положений атомов водорода, поэтому она термодинамически более устойчива. При ком натной температуре молекулы циклогексана сущ ествую т практически только в конформации кресла.
Производные циклогексана, содержащие два и более объем ных заместителя, имеют такую конформацию, в которой эти за местители располагаются наиболее удаленно друг от друга, на пример по разные стороны от плоскости цикла.
Биологическое действие многих лекарственных веществ и био регуляторов (гормоны, витамины, антибиотики и др.) тесно свя зано с пространственным строением их молекул. Для наиболее полного связывания этих веществ рецепторами клетки они долж ны иметь определенную конформацию. Изменение конформа ции, как правило, сниж ает степень связы вания и ослабляет биологическое действие. О конформации белков, полисахаридов и нуклеиновых кислот речь пойдет в разд. 21.4, 22.3 и 23.3.
Стереоизомеры могут отличаться не только конформацией,
но и конфигурацией. |
|
Конфигурациями молекул назы ваю т ся разны е |
про |
ст ранст венные располож ения атомов или групп, |
кото |
рые не могут быт ь переведены друг в друга простым |
|
вращением вокруг связей. |
|
В отличие от конформационных изомеров, которые легко пре вращаются друг в друга, конфигурационные изомеры устойчи вы. Различают два вида конфигурационной изомерии: геомет рическую , или цис-транс-изомерию, и опт ическую изомерию.
Г е о м е т р и ч е с к а я и з о м е р и я . С тереоизомеры , отл и чающиеся друг от друга расположением заместителей по отноше нию к плоскости двойной связи или цикла, называются геомет рическими изомерами. Изомер, содержащ ий одинаковые замес тители по одну сторону от плоскости связи (цикла), называется
385
1 3 -3 4 5 3