Ручной подбор
Прямой праймер
• |
20 нуклеотидов |
• |
CG-состав составляет 50% |
• |
Тп/прямой = 60 |
• |
Праймеры не само- и взаимо- |
|
комплиментарны |
Обратный праймер
• |
20 нуклеотидов |
• CG-состав чуть больше 50% |
|
• |
Tп/обратный = 62 |
CAC AGG ATC AGA CAA GCG AG
•Праймеры не само- и взаимо- комплиментарны
Подбор с помощью ресурса OLIGOANALYZER
Подбор с помощью ресурса OLIGOANALYZER
Подбор с помощью ресурса OLIGOANALYZER
Прямой праймер |
Обратный праймер |
G гетеродимеров |
Разница температур |
F1 |
CTTTTTTGAGCCGATGGGTG |
AGGATCAGACAAGCGAGTAC |
R1 |
-3,9 |
0,7 |
F1-R1 - 436.. 793 |
F2 |
TTTTTTGAGCCGATGGGTGG |
AGGATCAGACAAGCGAGTAC |
R1 |
-3,9 |
2,2 |
F2-R1 - 437..793 |
F1 436..455
F2 437..456
R1 774..793
Подбор с помощью ресурса OLIGOANALYZER
|
Подобранные вручную: |
|
|
|
|
|
|
Прямой праймер |
Обратный праймер |
|
G гетеродимеров |
Разница температур |
|
F1 |
CTTTTTTGAGCCGATGGGTG |
CACAGGATCAGACAAGCGAG |
R2 |
-3.61 |
0,3 |
F1-R2 - 436..798 |
^Спецефичен^ |
^Неспецефичен^ |
F1 436..455
R2 774..798
Подбор с помощью ресурса PRIMER3
Другие варианты прямых и обратный 
праймеров
Предложенные прямой и обратный праймеры