- •ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА:
- •ДОМЕННАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА
- •ВПЕРВЫЕ ДОМЕННАЯ СТРУКТУРА ПОКАЗАНА НА ПРИМЕРЕ ЛИЗОЦИМА, ИММУНОГЛОБУЛИНОВ, ХИМОТРИПСИНА, ПАПАИНА И ДР.
- •СТРУКТУРНАЯ АВТОНОМИЯ ДОПОЛНЯЕТСЯ
- •Доменная организация димерного фрагмента глутатионредуктазы.
- •Третичная структура одного из доменов протромбина. При активации этот домен (остатки 66-144) -
- •РАЗЛИЧАЮТ ДВА ВИДА ДОМЕНОВ (Д.УЕТЛАУФЕР)
- •ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА И СИЛЫ, ЕЁ СТАБИЛИЗИРУЮЩИЕ
- •Третичная структура белка
- •ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА
- •РАЗЛИЧНЫЕ ВАРИАНТЫ ИЗОБРАЖЕНИЯ СТРУКТУРЫ БЕЛКА КРАМБИНА.
- •СИЛЫ, СТАБИЛИЗИРУЮЩИЕ ТРЕТИЧНУЮ СТРУКТУРУ
- •ВОДОРОДНЫЕ СВЯЗИ в белковой молекуле: А - между двумя гидроксильными группами;
- •СВОБОДНАЯ ЭНЕРГИЯ ГИББСА
- •При свертывании белковой глобулы
- •ТЕРМОДИНАМИКА ОБРАЗОВАНИЯ ГЛОБУЛЫ
- •СТЕПЕНЬ ГИДРОФОБНОСТИ АМИНОКИСЛОТЫ ОПРЕДЕЛЯЮТ ПО РАЗНОСТИ СВОБОДНЫХ ЭНЕРГИЙ ЕЕ РАСТВОРЕНИЯ В СЛАБОПОЛЯРНОМ РАСТВОРИТЕЛЕ
- •В 1964 году Фишер установил, что, зная общее число аминокислотных остатков в ядре
- •Заштриховано гидрофобное ядро,
- •ДИСУЛЬФИДНЫЕ СВЯЗИ
- •ОСНОВНЫЕ ТИПЫ ДВИЖЕНИЙ В БЕЛКОВОЙ МОЛЕКУЛЕ
- •Основные типы движений в белковой молекуле
- •ЧЕТВЕРТИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА
- •ПРИМЕРЫ БЕЛКОВ С ЧЕТВЕРТИЧНОЙ СТРУКТУРОЙ
- •РОЛЬ ЧЕТВЕРТИЧНОЙ СТРУКТУРЫ
- •САМООРГАНИЗАЦИЯ БЕЛКА
- •Несмотря на громадное число теоретически
- •Каждый ако имеет около 10 возможных конформаций.
- •ПАРАДОКС С.ЛЕВИНТАЛЯ
- •С.Левинталь предположил, что
- •КОНЦЕПЦИЯ СТАДИЙНОГО СВОРАЧИВАНИЯ БЕЛКА О.Б.ПТИЦЫНА (1973)
- •Очень быстрое формирование элементов вторичной структуры, служащих как бы "затравками" для образования более
- •Специфическая ассоциация некоторых элементов вторичной структуры с образованием
- •Формирование 'расплавленной глобулы'
- •Формирование нативной структуры белка
- •ВНУТРИКЛЕТОЧНАЯ
- •ФЕРМЕНТЫ, УСКОРЯЮЩИЕ ПРОЦЕСС СВОРАЧИВАНИЯ
- •Транс-конформация более стабильна, она преобладает во вновь синтезированной полипептидной цепи.
- •Второй фермент (протеиндисульфидизомераза),
- •ШАПЕРОНЫ И ШАПЕРОНИНЫ
- •Функции шаперонов в клетке
- •Структура шаперонина hsp60.
- •Модель сворачивания белков с участием шаперонинов.
ПРОСТРАНСТВЕННАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА:
ДОМЕНЫТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА
ЧЕТВЕРТИЧНАЯ СТРУКТУРА
САМООРГАНИЗАЦИЯ БЕЛКОВОЙ МОЛЕКУЛЫ
ДОМЕННАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА
ДОМЕНЫ – ОБЛАСТИ В ТРЕТИЧНОЙ СТРУКТУРЕ БЕЛКА С ОПРЕДЕЛЕННОЙ СТРУКТУРНОЙ АВТОНОМИЕЙ.
ДОМЕНЫ – ПОДУРОВЕНЬ СТРУКТУРНОЙ ОРГАНИЗАЦИИ БЕЛКА НА ПУТИ ОТ ВТОРИЧНОЙ К ТРЕТИЧНОЙ СТРУКТУРЕ.
ВПЕРВЫЕ ДОМЕННАЯ СТРУКТУРА ПОКАЗАНА НА ПРИМЕРЕ ЛИЗОЦИМА, ИММУНОГЛОБУЛИНОВ, ХИМОТРИПСИНА, ПАПАИНА И ДР.
Домены в структуре протеолитического
фермента папайи -
папаина.
Прерывистыми линиями намечено направление впадины между двумя доменами, в которой связывается субстрат и размещен
каталитический центр. Дисульфидные связи
заштрихованы
СТРУКТУРНАЯ АВТОНОМИЯ ДОПОЛНЯЕТСЯ
ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ
ДОМЕННАЯ ОРГАНИЗАЦИЯ ИММУНОГЛОБУЛИНА
Доменная организация димерного фрагмента глутатионредуктазы.
Каждая субъединица состоит из трех доменов: один присоединяет FAD, другой - NADP, третий образует поверхность раздела.
Субстрат глутатион помещается между субъединицами. Активный центр образован 4 доменами.
Третичная структура одного из доменов протромбина. При активации этот домен (остатки 66-144) - обеспечивает связывание протромбина с фосфолипидом. Зачернены дисульфидные связи.
РАЗЛИЧАЮТ ДВА ВИДА ДОМЕНОВ (Д.УЕТЛАУФЕР)
С НЕПРЕРЫВНОЙ ПОЛИПЕПТИДНОЙ ЦЕПЬЮС РАЗРЫВНОЙ ПОЛИПЕПТИДНОЙ ЦЕПЬЮ
ОБЛАСТЬ, ОБЪЕДИНЯЮЩАЯ ДОМЕНЫ – ЯДРО
(НУКЛЕАЦИЯ)
ТРЕТИЧНАЯ СТРУКТУРА БЕЛКА И СИЛЫ, ЕЁ СТАБИЛИЗИРУЮЩИЕ
Третичная структура белка
- пространственная ориентация полипептидной спирали или способ укладки полипептидной цепи в определенном объеме.