4 курс / Дерматовенерология / Диссертация_Рауш_Е_Р_Особенности_возбудителей_внутрибольничного

61

35 (10,9%), C.tropicalis –29 (9,0%), C.krusei –20 (6,2%), C.guilliermondii –16 (5,0%), C. dubliniensis –13 штаммов (4,0%), C.lusitaniae –3 штамма (0,9%),

C.rugosa –2 (0,6%), C.kefyr –1 (0,3%), C.lipolytica – 1 (0,3%). Для двух штаммов видовая принадлежность неопределена (0,6%).

10.9

41.6

Рисунок 9 – Видовая идентификация Candida spp. с помощью тест-системы

AUXACOLOR 2 (n=322).

При сравнении полученных результатов видовой идентификации 322

штаммов совпадение составило 93,2%, (таблица 10 и 11), у C. albicans (139)

доля неверной идентификации была - 7,9%, среди C.не- albicans видов - 6,0%.

Таблица 10 – Сравнение результатов идентификации возбудителей ИК тест-

системой AUXACOLOR2

62

Продолжение таблицы 10

Таблица 11 – Причины расхожения результатов видовой идентификации

При сравнении полученных данных с использованием тест-системы

AUXACOLOR 2 и метода MALDI-TOF масс-спектрометрии достоверных различий между ними выявлено не было (рисунок 10). Вследствии выхода тест-системы AUXACOLOR 2 за пределы допустимой ошибки, для видовой идентификации, особенно, C.не- albicans видов лучше использовать метод

MALDI-TOF масс-спектрометрии, в связи с тем, что именно среди этих видов постоянно появляются штаммы со сниженной чувствительностью к противогрибковым препаратам.

63

Рисунок 10 – Сравнение данных полученных методами MALDI-TOF массспектрометрии и AUXACOLOR 2

Таким образом, можно заключить, что использование современных методов видовой идентификации (ДНК-секвенирование и MALDI-TOF масс-

спектрометрия) помогает точнее установить этиологию внутрибольничного инвазивного кандидоза в России (рисунок 11): 43,2% C. albicans и другие виды Candida spp. - 56.8%.

9.6

Рисунок 11 – Cпектр возбудителей внутрибольничного ИК в РФ (n=322)

64

Также был рассмотрен спектр Candida spp. в различных биосубстратах

(рисунки 12 и 13)

Рисунок 12 – Спектр Candida spp., выделенных их крови.

Следует отметить, что в крови в качестве возбудителя ИК, преимущественно изолировали C. не-albicans виды – 61,2%, в том числе C. krusei (природно устойчивый к флуконазолу вид) – 6%, а также редкие виды (4,9%). В других биосубстратах (перитонеальная и плевральная жидкости, желчь, ЦСЖ)

доминировали C. albicans, в биоптатах с одинаковой частотой выделяли C. albicans и C. glabrata.

Таким образом, анализируя данные видового спектра Candida spp.,

было обнаружено, что среди 268 штаммов, выделенных из крови преобладали C. не-albicans виды (р=0,008), а среди 54 штаммов, выделенных из других биосубстратов - C. albicans (р=0,013).

Рисунок 13 – Видовой спектр Candida spp., выделенный из других в норме

стерильных биосубстратах.

3.4 Видовой спектр возбудителей ВБИК в течение 2012-2014 гг.

Мониторинг видового спектра возбудителей ИК необходим для своевременного обнаружения его изменения. Мы проанализировали видовой спектр возбудителей ВБИК, выделенных нами в период исследования в 2012, 2013 и 2014 годах.

В 2012 году нами изучен 61 изолят Candida spp.и было отмечено, что в данной группе преобладали C. albicans - 54 %, C. не-albicans составляет 46 %

(рисунок 14).

67

Среди изученных в 2013 году 198 штаммов Candida spp., доля C. albicans

составила 43,4 %, а C. не-albicans виды -56,6% (рисунок 15)

100

90

80

70

60

Рисунок 15 – Этиология ВБИК в 2013 г (n=198).

В 2014 году, среди возбудителей ВБИК (61 штамм), мы обнаружили, что доля штаммов C. albicans составила 32,8%, а C. не-albicans - 67,2% (рисунок

16).

Рисунок 16 – Этиология ВБИК в 2014 г (n=61).

Таким образом, видовой спектр возбудителей внутрибольничного ИК в течение 2012, 2013, 2014 гг. изменился: во-первых, уровень C. albicans

68

снизился с 54% (2012г.) до 32,8% (2014 г.) (р=0,01) (рисунок 17); во-вторых,

заметно возрос уровень C.не-albicans видов с 46% (2012г.) до 67,2% (2014

г.,р=0,001) (рисунок 17). При этом вырос также уровень C. parapsilosis: с

9,8 % (2012г.) до 27,8% (2014г., р=0,01) (рисунок 17). Доли часто встречающихся видов C. glabrata (16,4% и 13,2%), C. tropicalis (10,6% и 8,2%) и C. krusei (8,2% и 6,1%) существенно не изменились (рисунок 17).

Также были выявлены редкие виды возбудителей ВБИК (рисунок 17).

Рисунок 17 – Видовой спектр возбудителей ВБИК в течение (2012-2014 гг.).

69

3.5 Географические особенности этиологии инвазвиного кандидоза

Исследуемые штаммы грибов рода Candida были выделены от пациентов из стационарах 12 городов 6 федеральных округов (ФО) РФ: Южного (Ростов-

на-Дону, Краснодар), Центрального (Москва), Северо-Западного (Санкт-

Петербург, Петрозаводск),Приволжского (Пермь, Нижний Новгород, Казань),

Уральского (Тюмень, Сургут), Сибирского (Иркутск, Омск) (рисунок 18).

127

53

38

32

60

12

Рисунок 18 – Географическое распределение исследуемых штаммов Candida spp (n=322).

При изучении видового спектра возбудителей ИК в федеральных округах установлены географические особенности. Так в Сибирском и Уральском (рисунок 19) федеральных округах доля C. albicans в структуре возбудителей ИК была достоверно выше, чем в Северо-Западном и Южным федеральных округах, р < 0.05.